Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QBX4

Protein Details
Accession B6QBX4    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-62AEELQSSKKRKRHADQVPENKNDDHydrophilic
81-106ATTGVKESKKTQKSKKDESAKNDKTEHydrophilic
155-183HDDDDDAKAKKKKKKRKISKEIAALSKKRBasic
661-680LPDLSKKDKQDLKRHGVKARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-185KAKKKKKKRKISKEIAALSKKRQK
669-714KQDLKRHGVKARAASAKLKHDTEKGGKARISTKSGYDRRMENKRKG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
KEGG tmf:PMAA_066390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDAFKLLTRSTKLKPSTPTTTSRLPSAGKAANPQLFGSAEELQSSKKRKRHADQVPENKNDDFEATQRLLFGGGHSTAAPATTGVKESKKTQKSKKDESAKNDKTEAPDDSDSEQQDQGDVMDESERRTILKTHKIKIVDLRDLEDILADKADDHDDDDDAKAKKKKKKRKISKEIAALSKKRQKQARQLYPEPLTSFQDLRKKYQISRKLAENIAEQGFTVPTEVQMGSLPLLLGSTSPTKDAQEPDLLAVAPTGSGKTLAFLIPLINKTVRYHRENPGQREISSIVVAPTKELVGQIVNEGRKLAVGTGVKITAMRKGMQVVVRPEEDDAGEDSEDSASGSESDDADEEKSAKSKDSKKSDILTKSDILVTTPLALVNALSVKDTEEKESLPSVRHLVLDEADVLLDPLFREQTLAIWNSCTNTNLGISFWSATMGSSIEELTKSTLESRHESLNAEKRPLLRLVIGLKDSAVPNIQHKLIYAATEQGKLLGLRQLLHPTAAIAPNEVRLRPPFLVFTQTITRAAALHSELLYDIPIEAGGSSRIAVLHSDLSETRRSEIMKGFRKGEIWIIITTDLLARGVDFRGINGVVNYDIPTSSAAYVHRVGRTGRAGREGGVAVTYYTEEDIPYVKSIANLIHASEKLQGKEQSVQKWLLDSLPDLSKKDKQDLKRHGVKARAASAKLKHDTEKGGKARISTKSGYDRRMENKRKGAISASRNRAQQSSTAKDAADSGDDEWQGLDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.62
4 0.61
5 0.63
6 0.59
7 0.63
8 0.58
9 0.54
10 0.5
11 0.44
12 0.41
13 0.43
14 0.42
15 0.35
16 0.4
17 0.44
18 0.44
19 0.43
20 0.4
21 0.35
22 0.31
23 0.29
24 0.27
25 0.22
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.2
30 0.27
31 0.34
32 0.38
33 0.4
34 0.49
35 0.58
36 0.67
37 0.74
38 0.77
39 0.81
40 0.84
41 0.9
42 0.9
43 0.85
44 0.79
45 0.68
46 0.58
47 0.48
48 0.4
49 0.31
50 0.24
51 0.25
52 0.23
53 0.22
54 0.22
55 0.21
56 0.18
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.13
71 0.16
72 0.2
73 0.23
74 0.31
75 0.41
76 0.48
77 0.56
78 0.64
79 0.71
80 0.76
81 0.84
82 0.87
83 0.87
84 0.86
85 0.85
86 0.86
87 0.83
88 0.78
89 0.71
90 0.64
91 0.58
92 0.54
93 0.47
94 0.42
95 0.37
96 0.34
97 0.33
98 0.35
99 0.31
100 0.3
101 0.28
102 0.22
103 0.2
104 0.18
105 0.15
106 0.13
107 0.11
108 0.09
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.15
116 0.21
117 0.26
118 0.36
119 0.42
120 0.45
121 0.51
122 0.53
123 0.55
124 0.58
125 0.57
126 0.53
127 0.47
128 0.44
129 0.4
130 0.38
131 0.34
132 0.26
133 0.19
134 0.12
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.17
147 0.17
148 0.24
149 0.29
150 0.36
151 0.45
152 0.55
153 0.65
154 0.7
155 0.8
156 0.85
157 0.9
158 0.93
159 0.95
160 0.94
161 0.92
162 0.88
163 0.86
164 0.83
165 0.75
166 0.73
167 0.7
168 0.66
169 0.64
170 0.65
171 0.64
172 0.67
173 0.75
174 0.76
175 0.77
176 0.76
177 0.76
178 0.71
179 0.66
180 0.58
181 0.49
182 0.41
183 0.34
184 0.31
185 0.29
186 0.33
187 0.32
188 0.35
189 0.41
190 0.41
191 0.46
192 0.53
193 0.57
194 0.58
195 0.6
196 0.61
197 0.59
198 0.58
199 0.53
200 0.46
201 0.4
202 0.33
203 0.29
204 0.23
205 0.17
206 0.15
207 0.12
208 0.11
209 0.07
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.06
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.14
238 0.11
239 0.08
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.23
259 0.28
260 0.32
261 0.37
262 0.43
263 0.52
264 0.59
265 0.63
266 0.64
267 0.61
268 0.54
269 0.51
270 0.44
271 0.35
272 0.28
273 0.22
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.16
308 0.18
309 0.21
310 0.21
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.2
315 0.17
316 0.15
317 0.12
318 0.1
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.04
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.06
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.16
343 0.24
344 0.32
345 0.39
346 0.43
347 0.45
348 0.49
349 0.55
350 0.53
351 0.48
352 0.42
353 0.35
354 0.32
355 0.29
356 0.24
357 0.17
358 0.13
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.14
437 0.17
438 0.19
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.26
443 0.32
444 0.31
445 0.3
446 0.3
447 0.29
448 0.3
449 0.3
450 0.25
451 0.17
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.19
456 0.16
457 0.15
458 0.16
459 0.15
460 0.13
461 0.12
462 0.1
463 0.12
464 0.15
465 0.16
466 0.14
467 0.14
468 0.16
469 0.14
470 0.15
471 0.13
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.16
476 0.14
477 0.15
478 0.13
479 0.14
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.13
484 0.16
485 0.16
486 0.16
487 0.15
488 0.13
489 0.15
490 0.16
491 0.15
492 0.12
493 0.12
494 0.17
495 0.18
496 0.17
497 0.17
498 0.16
499 0.21
500 0.2
501 0.21
502 0.19
503 0.19
504 0.24
505 0.22
506 0.24
507 0.23
508 0.23
509 0.23
510 0.21
511 0.2
512 0.15
513 0.15
514 0.13
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.07
523 0.06
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.11
540 0.11
541 0.14
542 0.18
543 0.18
544 0.18
545 0.19
546 0.2
547 0.22
548 0.28
549 0.35
550 0.4
551 0.43
552 0.44
553 0.43
554 0.43
555 0.4
556 0.38
557 0.32
558 0.26
559 0.22
560 0.2
561 0.19
562 0.18
563 0.17
564 0.13
565 0.09
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.12
575 0.13
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.14
591 0.18
592 0.21
593 0.21
594 0.22
595 0.22
596 0.26
597 0.33
598 0.35
599 0.34
600 0.36
601 0.35
602 0.34
603 0.36
604 0.31
605 0.23
606 0.18
607 0.16
608 0.11
609 0.11
610 0.1
611 0.07
612 0.08
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.11
622 0.13
623 0.13
624 0.16
625 0.15
626 0.15
627 0.19
628 0.19
629 0.2
630 0.25
631 0.28
632 0.24
633 0.3
634 0.32
635 0.31
636 0.39
637 0.43
638 0.42
639 0.43
640 0.44
641 0.38
642 0.38
643 0.35
644 0.29
645 0.25
646 0.2
647 0.2
648 0.24
649 0.26
650 0.26
651 0.29
652 0.34
653 0.37
654 0.45
655 0.49
656 0.51
657 0.6
658 0.68
659 0.74
660 0.77
661 0.8
662 0.77
663 0.77
664 0.74
665 0.7
666 0.68
667 0.65
668 0.58
669 0.58
670 0.57
671 0.59
672 0.59
673 0.55
674 0.51
675 0.48
676 0.54
677 0.54
678 0.58
679 0.53
680 0.54
681 0.52
682 0.52
683 0.55
684 0.53
685 0.52
686 0.44
687 0.47
688 0.51
689 0.56
690 0.57
691 0.55
692 0.56
693 0.6
694 0.68
695 0.71
696 0.7
697 0.73
698 0.75
699 0.72
700 0.67
701 0.66
702 0.64
703 0.64
704 0.65
705 0.64
706 0.63
707 0.64
708 0.64
709 0.58
710 0.51
711 0.48
712 0.47
713 0.46
714 0.45
715 0.44
716 0.41
717 0.38
718 0.38
719 0.32
720 0.25
721 0.2
722 0.16
723 0.19
724 0.19
725 0.19