Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QL01

Protein Details
Accession B6QL01    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
563-585SAEQKANKKREELKRQLDAKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-374KPPKKAMGRIGGPKAVPLGRPRK
424-451KKETPTETAPKKKGVLGKIGGKKPEPKK
484-506PTLKRGKKLGLIGGGKKKPQAAA
567-593KANKKREELKRQLDAKSKAPTKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 13, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG tmf:PMAA_055720  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSPRWHSLPTRNISAPLLLYSFIYTSQSYEFFLTDLTHIWHENLQYKHVLQKAEDIGTSIDPSEDANQYDVFMRKIQDALDGANNTGVTIASGHKSDSVVVTTSTKLPAGLNPLKWTFTLSKEPPSAVTRHLLLPLLKSERNHEQREQSLLEHIREKDNILSKIFDKIDPSQLTSMFPGTAGVRHTKPKTSDLIRHIKGATRFDEKGWRGSPAGEDNTANGLAESVYAHGGFTSLDTASTRYAAWWKSLDDVKDAKLQSQERSQAAMKENICSPDTGAAGKEQVTADEDLSTEDEDEFQHQETPLHLKRKKDQADRKPVEDSESDIGVGTTESDQDAESDDGLDDIKAPIQKPPKKAMGRIGGPKAVPLGRPRKESVADETDSDSEPKPRQRTAATREELELDDGTESDSEPERMPTPSPVKAKKETPTETAPKKKGVLGKIGGKKPEPKKVPSSEPADTNDIGQPTSDEDDLNQRQAPSKPQPTLKRGKKLGLIGGGKKKPQAAAPKPEPDETDEDLDTGPITSTQKQKVPSTSPPPPPAVSSSPSPIRHRVSKAEPEPELSAEQKANKKREELKRQLDAKSKAPTKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.31
4 0.25
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.14
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.19
28 0.21
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.3
33 0.31
34 0.36
35 0.37
36 0.36
37 0.29
38 0.35
39 0.37
40 0.35
41 0.33
42 0.28
43 0.26
44 0.25
45 0.24
46 0.17
47 0.12
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.19
57 0.2
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.2
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.22
97 0.26
98 0.27
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.31
103 0.34
104 0.27
105 0.26
106 0.34
107 0.31
108 0.37
109 0.38
110 0.38
111 0.38
112 0.38
113 0.35
114 0.28
115 0.29
116 0.24
117 0.23
118 0.24
119 0.23
120 0.21
121 0.21
122 0.24
123 0.26
124 0.27
125 0.26
126 0.29
127 0.37
128 0.44
129 0.47
130 0.47
131 0.48
132 0.49
133 0.53
134 0.49
135 0.4
136 0.4
137 0.37
138 0.35
139 0.34
140 0.32
141 0.31
142 0.3
143 0.3
144 0.28
145 0.32
146 0.32
147 0.28
148 0.29
149 0.26
150 0.32
151 0.32
152 0.27
153 0.24
154 0.24
155 0.31
156 0.3
157 0.32
158 0.27
159 0.27
160 0.27
161 0.24
162 0.22
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.16
171 0.23
172 0.26
173 0.3
174 0.32
175 0.35
176 0.4
177 0.42
178 0.47
179 0.48
180 0.56
181 0.52
182 0.52
183 0.49
184 0.46
185 0.44
186 0.4
187 0.36
188 0.32
189 0.31
190 0.3
191 0.38
192 0.35
193 0.37
194 0.34
195 0.32
196 0.27
197 0.27
198 0.28
199 0.24
200 0.24
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.09
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.17
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.24
241 0.24
242 0.22
243 0.25
244 0.26
245 0.25
246 0.29
247 0.31
248 0.26
249 0.29
250 0.28
251 0.27
252 0.28
253 0.3
254 0.26
255 0.23
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.18
260 0.16
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.16
291 0.19
292 0.28
293 0.3
294 0.33
295 0.39
296 0.48
297 0.56
298 0.59
299 0.65
300 0.66
301 0.75
302 0.74
303 0.71
304 0.64
305 0.56
306 0.48
307 0.38
308 0.31
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.12
313 0.12
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.13
337 0.23
338 0.28
339 0.32
340 0.38
341 0.46
342 0.47
343 0.51
344 0.54
345 0.52
346 0.53
347 0.55
348 0.51
349 0.45
350 0.41
351 0.38
352 0.32
353 0.25
354 0.22
355 0.23
356 0.3
357 0.31
358 0.36
359 0.37
360 0.39
361 0.4
362 0.41
363 0.4
364 0.36
365 0.32
366 0.29
367 0.29
368 0.26
369 0.24
370 0.23
371 0.18
372 0.17
373 0.2
374 0.26
375 0.28
376 0.28
377 0.32
378 0.36
379 0.44
380 0.47
381 0.53
382 0.48
383 0.45
384 0.45
385 0.43
386 0.37
387 0.3
388 0.23
389 0.13
390 0.11
391 0.1
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.14
403 0.19
404 0.23
405 0.28
406 0.36
407 0.41
408 0.46
409 0.5
410 0.55
411 0.55
412 0.6
413 0.57
414 0.54
415 0.55
416 0.58
417 0.61
418 0.65
419 0.61
420 0.56
421 0.54
422 0.53
423 0.51
424 0.46
425 0.45
426 0.42
427 0.48
428 0.52
429 0.55
430 0.54
431 0.51
432 0.57
433 0.55
434 0.6
435 0.56
436 0.53
437 0.58
438 0.62
439 0.66
440 0.64
441 0.64
442 0.57
443 0.55
444 0.53
445 0.48
446 0.42
447 0.36
448 0.31
449 0.25
450 0.22
451 0.18
452 0.14
453 0.13
454 0.15
455 0.13
456 0.11
457 0.11
458 0.2
459 0.22
460 0.24
461 0.24
462 0.22
463 0.26
464 0.29
465 0.36
466 0.37
467 0.43
468 0.47
469 0.54
470 0.62
471 0.66
472 0.74
473 0.75
474 0.76
475 0.73
476 0.73
477 0.7
478 0.66
479 0.62
480 0.6
481 0.57
482 0.54
483 0.59
484 0.58
485 0.54
486 0.52
487 0.48
488 0.42
489 0.43
490 0.46
491 0.45
492 0.51
493 0.57
494 0.63
495 0.64
496 0.64
497 0.59
498 0.53
499 0.5
500 0.43
501 0.39
502 0.3
503 0.28
504 0.25
505 0.24
506 0.19
507 0.13
508 0.1
509 0.09
510 0.12
511 0.17
512 0.24
513 0.29
514 0.33
515 0.38
516 0.44
517 0.48
518 0.52
519 0.57
520 0.59
521 0.63
522 0.67
523 0.67
524 0.66
525 0.6
526 0.56
527 0.52
528 0.48
529 0.42
530 0.37
531 0.39
532 0.42
533 0.47
534 0.5
535 0.51
536 0.54
537 0.58
538 0.59
539 0.61
540 0.62
541 0.66
542 0.68
543 0.68
544 0.63
545 0.59
546 0.56
547 0.5
548 0.45
549 0.36
550 0.33
551 0.29
552 0.34
553 0.39
554 0.45
555 0.5
556 0.51
557 0.58
558 0.64
559 0.71
560 0.75
561 0.77
562 0.78
563 0.81
564 0.83
565 0.83
566 0.82
567 0.76
568 0.72
569 0.72
570 0.71
571 0.7
572 0.74
573 0.77