FuNGI

A0A067N4H5

Protein Details

Accession

A0A067N4H5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
223-248	LRSTKGGKGKKSKKIKKDDDVKDKVK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
108-123	GRGRGRGDSRGRGRGR
226-239	TKGGKGKKSKKIKK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSTQDSNPSQSAGSSLGSGIADSTGDAKPLIRSRPLGTAPLGALSGPSMPKAIGNQVKKQEDVTRQGKSKLMFKPNIVQKKTTGPEVKQEPTSTAAAPPGTNNVNDRGRGRGRGDSRGRGRGRGFEPAPMTASGPFAQGPAMAGNSESRRAGLRTAAYVPITPVGSSMDTSGSQSFAPPPMIKKDIDDVKSEDEEVYSDAEGGVTVIDMANVRTIDWMAPESLRSTKGGKGKKSKKIKKDDDVKDKVKAQGEDDMMDSDLPPPATAPEQDEGPTEDKDTMNALDLSESEGEEEMEDLVENFINKKRTEDELTTYPEQQLYFFQFPAPFPTFQPPTPAVQPPSSEPIRVDIDAEITVAPTKAEPKIDVKGKGKAVSFAAPADGSKDKKDEPKEPEKKAPLEGLIGHMDILRSGAIKIRLGSNIIMDVSAATQPSFLQQLVYIDQEENRMIVLGEVNKRFIVSPDVEVLLDQLEEKEIKEKELKKEGGAPVPMNVDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.12
4	0.12
5	0.11
6	0.1
7	0.08
8	0.07
9	0.07
10	0.1
11	0.09
12	0.1
13	0.1
14	0.11
15	0.17
16	0.23
17	0.27
18	0.29
19	0.32
20	0.35
21	0.43
22	0.44
23	0.42
24	0.38
25	0.36
26	0.31
27	0.29
28	0.26
29	0.17
30	0.15
31	0.12
32	0.13
33	0.1
34	0.11
35	0.1
36	0.1
37	0.12
38	0.14
39	0.22
40	0.28
41	0.33
42	0.4
43	0.49
44	0.52
45	0.51
46	0.53
47	0.52
48	0.51
49	0.54
50	0.53
51	0.52
52	0.53
53	0.55
54	0.56
55	0.5
56	0.51
57	0.51
58	0.54
59	0.51
60	0.51
61	0.57
62	0.63
63	0.7
64	0.65
65	0.58
66	0.51
67	0.56
68	0.55
69	0.55
70	0.52
71	0.43
72	0.49
73	0.54
74	0.55
75	0.49
76	0.47
77	0.4
78	0.37
79	0.37
80	0.29
81	0.23
82	0.22
83	0.19
84	0.18
85	0.17
86	0.18
87	0.18
88	0.18
89	0.19
90	0.23
91	0.25
92	0.27
93	0.28
94	0.31
95	0.33
96	0.37
97	0.38
98	0.4
99	0.41
100	0.48
101	0.53
102	0.55
103	0.58
104	0.63
105	0.61
106	0.59
107	0.56
108	0.54
109	0.51
110	0.5
111	0.44
112	0.4
113	0.4
114	0.35
115	0.35
116	0.28
117	0.26
118	0.18
119	0.19
120	0.14
121	0.13
122	0.12
123	0.1
124	0.1
125	0.09
126	0.09
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.1
132	0.11
133	0.13
134	0.12
135	0.12
136	0.14
137	0.15
138	0.15
139	0.16
140	0.16
141	0.17
142	0.19
143	0.2
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.14
149	0.11
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.09
157	0.1
158	0.1
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.13
166	0.15
167	0.19
168	0.22
169	0.21
170	0.21
171	0.26
172	0.3
173	0.31
174	0.31
175	0.28
176	0.29
177	0.29
178	0.28
179	0.22
180	0.15
181	0.13
182	0.11
183	0.1
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.02
192	0.03
193	0.02
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.16
214	0.23
215	0.29
216	0.34
217	0.44
218	0.52
219	0.6
220	0.7
221	0.74
222	0.76
223	0.82
224	0.83
225	0.82
226	0.83
227	0.83
228	0.82
229	0.82
230	0.75
231	0.67
232	0.61
233	0.56
234	0.49
235	0.4
236	0.31
237	0.28
238	0.26
239	0.23
240	0.21
241	0.17
242	0.14
243	0.13
244	0.12
245	0.06
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.1
257	0.11
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.11
262	0.13
263	0.12
264	0.12
265	0.12
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.09
270	0.07
271	0.07
272	0.09
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.06
288	0.1
289	0.13
290	0.14
291	0.16
292	0.18
293	0.22
294	0.27
295	0.28
296	0.3
297	0.31
298	0.37
299	0.36
300	0.34
301	0.31
302	0.27
303	0.25
304	0.2
305	0.18
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.18
310	0.18
311	0.18
312	0.24
313	0.25
314	0.2
315	0.2
316	0.27
317	0.28
318	0.27
319	0.32
320	0.27
321	0.28
322	0.31
323	0.33
324	0.29
325	0.28
326	0.3
327	0.27
328	0.32
329	0.29
330	0.26
331	0.22
332	0.23
333	0.24
334	0.23
335	0.21
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.14
340	0.1
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.09
347	0.1
348	0.12
349	0.14
350	0.17
351	0.25
352	0.3
353	0.37
354	0.38
355	0.43
356	0.45
357	0.47
358	0.44
359	0.4
360	0.36
361	0.32
362	0.29
363	0.23
364	0.2
365	0.16
366	0.15
367	0.17
368	0.19
369	0.17
370	0.19
371	0.22
372	0.24
373	0.32
374	0.39
375	0.43
376	0.47
377	0.57
378	0.64
379	0.67
380	0.73
381	0.72
382	0.68
383	0.63
384	0.58
385	0.48
386	0.42
387	0.36
388	0.3
389	0.24
390	0.21
391	0.18
392	0.15
393	0.13
394	0.11
395	0.1
396	0.07
397	0.06
398	0.07
399	0.11
400	0.13
401	0.15
402	0.16
403	0.18
404	0.2
405	0.21
406	0.21
407	0.18
408	0.17
409	0.16
410	0.14
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.1
415	0.09
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.13
425	0.15
426	0.17
427	0.16
428	0.15
429	0.17
430	0.18
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.1
436	0.1
437	0.12
438	0.16
439	0.23
440	0.25
441	0.26
442	0.26
443	0.27
444	0.26
445	0.24
446	0.25
447	0.2
448	0.22
449	0.23
450	0.24
451	0.23
452	0.23
453	0.21
454	0.16
455	0.13
456	0.1
457	0.08
458	0.09
459	0.1
460	0.11
461	0.18
462	0.18
463	0.22
464	0.3
465	0.37
466	0.43
467	0.53
468	0.55
469	0.51
470	0.59
471	0.6
472	0.59
473	0.57
474	0.49
475	0.42

A0A067N4H5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer