Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QDI5

Protein Details
Accession B6QDI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-280MIPTNKNKVVKPRPKVEQKKTKKPRRTGKTTNTHMMGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-271NKVVKPRPKVEQKKTKKPRRTG
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG tmf:PMAA_078000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MSYLQQQINNFNSSVVSSAGRLPQQKRIIGGSQPVSSTSSQAPSTPGTPGPARRHDPANIVYSQPADTGTGKDIMTNVLYAIQKMKEKNAPLTFEDIVGYLSLQERRHDQGYVHALRSILQVHDKVNYDPSGADGKGTFSFRPPHNIRSEEQLLQKLQSQTTMTGILVKDLKEGWSGVEQTIDKLEQEGKLLVTRNKKDNHPKMVWANDPSLMHKFDDEFRVIWEKTKVPDQQQVIEDLEKAGMIPTNKNKVVKPRPKVEQKKTKKPRRTGKTTNTHMMGILRDYSHLKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.13
4 0.12
5 0.15
6 0.19
7 0.23
8 0.3
9 0.31
10 0.39
11 0.45
12 0.46
13 0.45
14 0.46
15 0.45
16 0.42
17 0.46
18 0.41
19 0.36
20 0.34
21 0.32
22 0.3
23 0.27
24 0.26
25 0.21
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.2
31 0.21
32 0.21
33 0.19
34 0.2
35 0.23
36 0.31
37 0.36
38 0.41
39 0.45
40 0.46
41 0.49
42 0.48
43 0.5
44 0.46
45 0.43
46 0.36
47 0.32
48 0.3
49 0.26
50 0.24
51 0.18
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.14
69 0.15
70 0.19
71 0.2
72 0.25
73 0.25
74 0.28
75 0.36
76 0.37
77 0.38
78 0.36
79 0.4
80 0.35
81 0.3
82 0.28
83 0.19
84 0.15
85 0.12
86 0.1
87 0.06
88 0.07
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.18
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.22
98 0.29
99 0.31
100 0.29
101 0.26
102 0.25
103 0.25
104 0.26
105 0.2
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.15
111 0.16
112 0.15
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.17
128 0.17
129 0.26
130 0.27
131 0.31
132 0.34
133 0.36
134 0.35
135 0.37
136 0.39
137 0.34
138 0.33
139 0.31
140 0.26
141 0.25
142 0.28
143 0.22
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.16
179 0.2
180 0.27
181 0.31
182 0.37
183 0.4
184 0.48
185 0.56
186 0.62
187 0.66
188 0.6
189 0.62
190 0.61
191 0.62
192 0.59
193 0.5
194 0.43
195 0.37
196 0.35
197 0.32
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.22
205 0.2
206 0.17
207 0.19
208 0.25
209 0.24
210 0.26
211 0.26
212 0.25
213 0.26
214 0.33
215 0.36
216 0.35
217 0.42
218 0.41
219 0.44
220 0.42
221 0.43
222 0.37
223 0.33
224 0.28
225 0.22
226 0.19
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.16
233 0.24
234 0.32
235 0.36
236 0.39
237 0.42
238 0.51
239 0.61
240 0.64
241 0.65
242 0.66
243 0.73
244 0.81
245 0.88
246 0.88
247 0.88
248 0.88
249 0.91
250 0.93
251 0.94
252 0.93
253 0.93
254 0.93
255 0.92
256 0.92
257 0.92
258 0.91
259 0.91
260 0.89
261 0.87
262 0.79
263 0.68
264 0.6
265 0.51
266 0.42
267 0.34
268 0.28
269 0.2
270 0.2