FuNGI

B6QLX9

Protein Details

Accession

B6QLX9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-52	LRRYAKPIRLCARSKRWWGPHT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 8, cyto_nucl 6, nucl 5, cyto 5, pero 5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	tmf:PMAA_058860 -
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MSAQPSLTDDCSLRDVEREAEWIEQSLTDVLRRYAKPIRLCARSKRWWGPHTIEARRLYSKARKAYHAGELSEDSHRLKRQCWEAFLQGTDKGVLTEQKRCWAALRYTKPNTNGTTPALIDPVSKRVIAATFSEKEILFREQAFPQGPESGAEIELPEPGDAHKLANETAVRDALFSQGIDKAPGTDLLNFRAIRLLWLGIHPAAWKTAKGILLRKPGKGIYTVAKAYRIISLLKCLGKVVEKLVAGLITDYAEAQGLFHKSQFGARRQRSAVDAVACLIGEIEHAWGNGKLGACLFMDIKGAFDYVVWSKLIGGLQGTGMDGDLVRWVASMSNRRAMLVIDGHIGEEVPISSGLPQGSPVSPILFVLYVRLLVAAIESAVPEVRGLSFVDDQGLVTAASSIREACKTLQHAAKVAIKWGVENGVQFDPSKTEAAFFTRQRESLFRRNIREARITVGGVRAKIMPNTVRWLGVILDRQLSLKSHYSTCLQKARGTEMRLRTLCRANGLTPELIRRLQRATVQAQALWGSELWWQGQNTWALGLQRLVNSQARAITGMLPKAPIGALIREAALEPANVLLDARKARYVTRLLGLPETHPTAQLLPVTLRHGDTHAQPGEQPLDDREWAQSNDKVPKRIGQRLAKHLAQRLTKDPSGGIERTVQSAPAAFLGTIRVLGTEQALIEAAEWRLGTALWSDGSRQNNGRTGAGVALQIVPEAPWEHLELPMGTGFEVFDVELMGVASALEWALERHLPGPIHVLLDAQNAIKRLQSTEPGAGQSLALRARMAASRLRLSGRPVTIQWVPGHNGVEGNEQADQAAKRAASKPAGPGFEGLSLAYVRRACTEARRAAVENWAPAKAPKRVASRYYQLKTGHAPIGTYLHRIKTRDSPECRACGELRETVSHILFECRGRRGPRRILYKGLADAGVPLPTAAEDAPEARLFSEPKATTALLQFVASANLFRDKEQAARESELGDHWGWEALRDGEDTGVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.21
4	0.22
5	0.22
6	0.21
7	0.22
8	0.22
9	0.2
10	0.19
11	0.16
12	0.16
13	0.16
14	0.15
15	0.15
16	0.16
17	0.18
18	0.26
19	0.26
20	0.31
21	0.37
22	0.44
23	0.48
24	0.56
25	0.62
26	0.63
27	0.69
28	0.73
29	0.75
30	0.77
31	0.8
32	0.8
33	0.81
34	0.77
35	0.78
36	0.75
37	0.73
38	0.74
39	0.71
40	0.68
41	0.63
42	0.64
43	0.6
44	0.55
45	0.55
46	0.54
47	0.56
48	0.58
49	0.58
50	0.59
51	0.6
52	0.63
53	0.64
54	0.6
55	0.52
56	0.46
57	0.44
58	0.41
59	0.38
60	0.35
61	0.29
62	0.29
63	0.34
64	0.33
65	0.34
66	0.4
67	0.47
68	0.51
69	0.53
70	0.53
71	0.53
72	0.54
73	0.52
74	0.47
75	0.38
76	0.33
77	0.29
78	0.23
79	0.17
80	0.16
81	0.2
82	0.21
83	0.28
84	0.3
85	0.36
86	0.37
87	0.37
88	0.39
89	0.41
90	0.46
91	0.48
92	0.55
93	0.57
94	0.63
95	0.69
96	0.69
97	0.68
98	0.63
99	0.57
100	0.52
101	0.46
102	0.42
103	0.38
104	0.34
105	0.29
106	0.25
107	0.23
108	0.21
109	0.22
110	0.2
111	0.19
112	0.18
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.23
118	0.23
119	0.24
120	0.27
121	0.25
122	0.24
123	0.25
124	0.25
125	0.2
126	0.2
127	0.22
128	0.21
129	0.26
130	0.27
131	0.25
132	0.24
133	0.24
134	0.22
135	0.2
136	0.21
137	0.17
138	0.15
139	0.14
140	0.12
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.11
148	0.1
149	0.11
150	0.12
151	0.13
152	0.13
153	0.17
154	0.18
155	0.17
156	0.18
157	0.19
158	0.17
159	0.16
160	0.16
161	0.13
162	0.13
163	0.11
164	0.11
165	0.13
166	0.13
167	0.14
168	0.14
169	0.13
170	0.13
171	0.16
172	0.16
173	0.18
174	0.19
175	0.2
176	0.26
177	0.25
178	0.24
179	0.25
180	0.24
181	0.2
182	0.2
183	0.18
184	0.13
185	0.14
186	0.16
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.12
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.18
196	0.21
197	0.24
198	0.3
199	0.34
200	0.43
201	0.47
202	0.46
203	0.45
204	0.43
205	0.4
206	0.36
207	0.32
208	0.28
209	0.3
210	0.32
211	0.3
212	0.3
213	0.29
214	0.28
215	0.27
216	0.22
217	0.19
218	0.17
219	0.2
220	0.23
221	0.24
222	0.23
223	0.21
224	0.21
225	0.22
226	0.22
227	0.2
228	0.19
229	0.18
230	0.18
231	0.18
232	0.17
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.13
249	0.19
250	0.25
251	0.3
252	0.39
253	0.42
254	0.48
255	0.48
256	0.5
257	0.47
258	0.43
259	0.38
260	0.29
261	0.26
262	0.2
263	0.19
264	0.16
265	0.14
266	0.1
267	0.06
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.08
280	0.1
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.08
285	0.1
286	0.09
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.09
293	0.08
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.11
299	0.11
300	0.09
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.06
317	0.1
318	0.17
319	0.19
320	0.24
321	0.25
322	0.25
323	0.25
324	0.24
325	0.22
326	0.17
327	0.15
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.06
341	0.07
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.13
394	0.15
395	0.2
396	0.23
397	0.22
398	0.24
399	0.26
400	0.3
401	0.26
402	0.24
403	0.21
404	0.18
405	0.17
406	0.16
407	0.14
408	0.1
409	0.1
410	0.12
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.14
422	0.19
423	0.19
424	0.22
425	0.23
426	0.24
427	0.25
428	0.29
429	0.31
430	0.35
431	0.43
432	0.43
433	0.46
434	0.53
435	0.55
436	0.54
437	0.52
438	0.43
439	0.37
440	0.34
441	0.29
442	0.22
443	0.23
444	0.21
445	0.16
446	0.16
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.15
451	0.12
452	0.12
453	0.16
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.13
460	0.14
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.15
472	0.18
473	0.21
474	0.25
475	0.28
476	0.26
477	0.27
478	0.28
479	0.32
480	0.34
481	0.34
482	0.34
483	0.32
484	0.38
485	0.36
486	0.37
487	0.34
488	0.33
489	0.31
490	0.28
491	0.26
492	0.2
493	0.21
494	0.21
495	0.19
496	0.15
497	0.16
498	0.15
499	0.16
500	0.16
501	0.14
502	0.14
503	0.16
504	0.18
505	0.2
506	0.21
507	0.23
508	0.23
509	0.21
510	0.2
511	0.19
512	0.16
513	0.12
514	0.1
515	0.06
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.13
523	0.12
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.13
538	0.12
539	0.12
540	0.12
541	0.13
542	0.12
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.08
550	0.07
551	0.07
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.07
567	0.08
568	0.09
569	0.11
570	0.11
571	0.12
572	0.17
573	0.2
574	0.18
575	0.19
576	0.21
577	0.2
578	0.22
579	0.22
580	0.18
581	0.18
582	0.18
583	0.16
584	0.14
585	0.14
586	0.12
587	0.13
588	0.12
589	0.11
590	0.09
591	0.1
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.11
596	0.13
597	0.13
598	0.14
599	0.2
600	0.19
601	0.18
602	0.18
603	0.19
604	0.19
605	0.18
606	0.17
607	0.11
608	0.13
609	0.13
610	0.14
611	0.13
612	0.15
613	0.16
614	0.19
615	0.2
616	0.22
617	0.31
618	0.33
619	0.35
620	0.32
621	0.37
622	0.4
623	0.45
624	0.49
625	0.49
626	0.53
627	0.58
628	0.63
629	0.61
630	0.58
631	0.56
632	0.53
633	0.48
634	0.44
635	0.41
636	0.41
637	0.38
638	0.35
639	0.3
640	0.27
641	0.28
642	0.25
643	0.21
644	0.2
645	0.2
646	0.22
647	0.22
648	0.19
649	0.14
650	0.14
651	0.13
652	0.1
653	0.09
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.06
668	0.05
669	0.05
670	0.07
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.06
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.09
683	0.14
684	0.16
685	0.2
686	0.22
687	0.24
688	0.29
689	0.3
690	0.28
691	0.24
692	0.23
693	0.2
694	0.18
695	0.15
696	0.1
697	0.09
698	0.09
699	0.08
700	0.07
701	0.06
702	0.06
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.09
707	0.1
708	0.1
709	0.12
710	0.11
711	0.11
712	0.11
713	0.1
714	0.08
715	0.08
716	0.07
717	0.06
718	0.06
719	0.05
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.03
727	0.03
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.05
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.12
739	0.12
740	0.12
741	0.16
742	0.16
743	0.16
744	0.16
745	0.16
746	0.13
747	0.15
748	0.15
749	0.12
750	0.12
751	0.13
752	0.13
753	0.14
754	0.14
755	0.15
756	0.17
757	0.2
758	0.22
759	0.25
760	0.27
761	0.26
762	0.26
763	0.23
764	0.2
765	0.17
766	0.16
767	0.14
768	0.12
769	0.11
770	0.1
771	0.12
772	0.14
773	0.15
774	0.16
775	0.19
776	0.22
777	0.24
778	0.27
779	0.27
780	0.3
781	0.34
782	0.33
783	0.32
784	0.29
785	0.32
786	0.31
787	0.33
788	0.31
789	0.28
790	0.29
791	0.28
792	0.29
793	0.24
794	0.24
795	0.21
796	0.22
797	0.19
798	0.17
799	0.15
800	0.14
801	0.13
802	0.15
803	0.14
804	0.12
805	0.14
806	0.13
807	0.16
808	0.19
809	0.24
810	0.25
811	0.27
812	0.33
813	0.36
814	0.38
815	0.35
816	0.33
817	0.29
818	0.27
819	0.25
820	0.17
821	0.13
822	0.11
823	0.11
824	0.14
825	0.13
826	0.12
827	0.14
828	0.16
829	0.16
830	0.24
831	0.33
832	0.35
833	0.37
834	0.4
835	0.41
836	0.4
837	0.47
838	0.41
839	0.38
840	0.34
841	0.32
842	0.29
843	0.3
844	0.35
845	0.32
846	0.36
847	0.38
848	0.44
849	0.5
850	0.54
851	0.58
852	0.61
853	0.66
854	0.62
855	0.61
856	0.55
857	0.52
858	0.52
859	0.5
860	0.46
861	0.35
862	0.33
863	0.28
864	0.32
865	0.29
866	0.3
867	0.27
868	0.3
869	0.34
870	0.35
871	0.38
872	0.41
873	0.49
874	0.54
875	0.58
876	0.61
877	0.62
878	0.65
879	0.62
880	0.57
881	0.49
882	0.45
883	0.42
884	0.38
885	0.34
886	0.32
887	0.33
888	0.32
889	0.32
890	0.27
891	0.23
892	0.22
893	0.22
894	0.25
895	0.27
896	0.29
897	0.35
898	0.42
899	0.51
900	0.57
901	0.64
902	0.68
903	0.73
904	0.73
905	0.74
906	0.71
907	0.67
908	0.61
909	0.53
910	0.45
911	0.35
912	0.32
913	0.25
914	0.21
915	0.15
916	0.12
917	0.09
918	0.09
919	0.1
920	0.07
921	0.07
922	0.08
923	0.09
924	0.12
925	0.13
926	0.13
927	0.13
928	0.17
929	0.17
930	0.18
931	0.26
932	0.24
933	0.24
934	0.28
935	0.28
936	0.27
937	0.28
938	0.3
939	0.21
940	0.21
941	0.2
942	0.16
943	0.18
944	0.15
945	0.14
946	0.12
947	0.19
948	0.19
949	0.2
950	0.24
951	0.23
952	0.29
953	0.33
954	0.36
955	0.33
956	0.36
957	0.36
958	0.33
959	0.33
960	0.29
961	0.27
962	0.22
963	0.18
964	0.15
965	0.18
966	0.16
967	0.16
968	0.17
969	0.15
970	0.16
971	0.16
972	0.17

B6QLX9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer