Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q236

Protein Details
Accession B6Q236    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPEKKDKKRKATSTAAVATHydrophilic
66-85TADAPARKIKPRKRASDFLSHydrophilic
94-124EEETKSTKKVEKKEKDAKKTAPAKKTKKVEVBasic
174-200AVPRIPDSKKAKRKIQKKLKENDQPDEHydrophilic
288-309WKGANRRYKRVPWNRIEKQRLEHydrophilic
392-416AAAEEKTPKKKSKTAKKGKELVEPEHydrophilic
432-453TPETSSAKKSKAKKGKKSAGKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-11KDKKRK
72-79RKIKPRKR
101-121KKVEKKEKDAKKTAPAKKTKK
177-193RIPDSKKAKRKIQKKLK
292-337NRRYKRVPWNRIEKQRLERGKTRDKWAKSIEQEEKRRLAKAEKFKK
397-410KTPKKKSKTAKKGK
438-453AKKSKAKKGKKSAGKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmf:PMAA_027560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPEKKDKKRKATSTAAVATPDLPNKKSKKTAVAESTPASTPKSILKKKGAEEKTNGVAQSTVPETADAPARKIKPRKRASDFLSDDEADNQSEEETKSTKKVEKKEKDAKKTAPAKKTKKVEVVEEESEAEGSEGQESENDEIDDQTAELIKGFESSGDEDASEDEGFEAGKAVPRIPDSKKAKRKIQKKLKENDQPDEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGEITRLRLSRNRVTGRSKHYAFIEFASSIVARIVAETMNNYLMYGHILKCKYVPQEQQHPELWKGANRRYKRVPWNRIEKQRLERGKTRDKWAKSIEQEEKRRLAKAEKFKKLGYEFEMPQLKAIDSVPVQEKLPAPEAAAETAIEEAAPVEDAVAVVEESAPAAAAAAEEKTPKKKSKTAKKGKELVEPEVETATPVKQVEATTATPETSSAKKSKAKKGKKSAGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.79
3 0.7
4 0.6
5 0.52
6 0.44
7 0.38
8 0.37
9 0.32
10 0.29
11 0.36
12 0.4
13 0.48
14 0.54
15 0.57
16 0.6
17 0.62
18 0.7
19 0.71
20 0.7
21 0.67
22 0.6
23 0.57
24 0.49
25 0.44
26 0.36
27 0.28
28 0.24
29 0.27
30 0.36
31 0.4
32 0.46
33 0.54
34 0.58
35 0.65
36 0.73
37 0.73
38 0.7
39 0.68
40 0.66
41 0.62
42 0.58
43 0.51
44 0.41
45 0.34
46 0.26
47 0.25
48 0.2
49 0.16
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.22
55 0.19
56 0.2
57 0.26
58 0.31
59 0.4
60 0.49
61 0.56
62 0.59
63 0.68
64 0.76
65 0.77
66 0.81
67 0.78
68 0.79
69 0.74
70 0.68
71 0.63
72 0.53
73 0.46
74 0.39
75 0.34
76 0.23
77 0.19
78 0.15
79 0.1
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.14
85 0.18
86 0.22
87 0.29
88 0.34
89 0.43
90 0.52
91 0.59
92 0.68
93 0.75
94 0.81
95 0.84
96 0.85
97 0.81
98 0.8
99 0.81
100 0.79
101 0.78
102 0.78
103 0.77
104 0.78
105 0.8
106 0.77
107 0.76
108 0.7
109 0.67
110 0.64
111 0.62
112 0.54
113 0.47
114 0.41
115 0.32
116 0.29
117 0.22
118 0.14
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.04
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.12
164 0.17
165 0.19
166 0.28
167 0.34
168 0.44
169 0.53
170 0.6
171 0.68
172 0.72
173 0.79
174 0.8
175 0.83
176 0.82
177 0.83
178 0.84
179 0.85
180 0.85
181 0.8
182 0.74
183 0.66
184 0.59
185 0.5
186 0.42
187 0.32
188 0.22
189 0.18
190 0.14
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.17
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.2
209 0.13
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.19
220 0.24
221 0.26
222 0.34
223 0.37
224 0.4
225 0.45
226 0.5
227 0.54
228 0.55
229 0.51
230 0.45
231 0.42
232 0.4
233 0.34
234 0.29
235 0.23
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.19
263 0.22
264 0.26
265 0.33
266 0.34
267 0.44
268 0.48
269 0.51
270 0.51
271 0.5
272 0.45
273 0.41
274 0.36
275 0.3
276 0.32
277 0.36
278 0.4
279 0.4
280 0.46
281 0.5
282 0.57
283 0.64
284 0.69
285 0.72
286 0.72
287 0.8
288 0.82
289 0.84
290 0.83
291 0.79
292 0.76
293 0.75
294 0.74
295 0.7
296 0.68
297 0.67
298 0.7
299 0.68
300 0.7
301 0.7
302 0.65
303 0.66
304 0.64
305 0.64
306 0.58
307 0.62
308 0.62
309 0.62
310 0.67
311 0.64
312 0.65
313 0.59
314 0.57
315 0.51
316 0.5
317 0.49
318 0.53
319 0.58
320 0.6
321 0.61
322 0.6
323 0.64
324 0.58
325 0.54
326 0.48
327 0.44
328 0.37
329 0.41
330 0.46
331 0.38
332 0.37
333 0.34
334 0.28
335 0.23
336 0.22
337 0.18
338 0.13
339 0.17
340 0.19
341 0.19
342 0.19
343 0.21
344 0.23
345 0.22
346 0.25
347 0.22
348 0.19
349 0.21
350 0.21
351 0.19
352 0.17
353 0.14
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.05
381 0.07
382 0.11
383 0.15
384 0.22
385 0.3
386 0.38
387 0.44
388 0.51
389 0.61
390 0.69
391 0.76
392 0.8
393 0.84
394 0.87
395 0.89
396 0.87
397 0.86
398 0.79
399 0.73
400 0.69
401 0.6
402 0.51
403 0.43
404 0.37
405 0.28
406 0.25
407 0.2
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.18
414 0.21
415 0.22
416 0.22
417 0.23
418 0.23
419 0.2
420 0.21
421 0.21
422 0.2
423 0.25
424 0.26
425 0.33
426 0.4
427 0.49
428 0.59
429 0.67
430 0.74
431 0.79
432 0.86
433 0.88