Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A067MSH3

Protein Details
Accession A0A067MSH3    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
443-464RPSGDVRRQDPRRRRNEFYDAEBasic
525-547TPGPPARGRRGGRGRRGKGRSSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
480-495RRSARGRGRASRGRSR
528-544PPARGRRGGRGRRGKGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences METSGTRTFSSRPQFASSEDEGMAQPYDHFMQPHSNPVVSYYFPKGVGNYHYGERHPMKPHRLTLTNSLVIGYGLHKKIDHFFNPRAATQEELEQYHDHDYIDFLARLIPGSPNIREAVERFNFGEDCPLFDGLFDFCSQYTGASLMGARKISQGTTDIAINWSGGLHHAKRGEASGFCYVNDAVIAILEMLRFHPRVLYIDIDIHHGDGVELAFWNTNRVMTVSFHKYNGDFFPGTGKLEDDGGGLGKHFCLNIPLQDGIDDESYVTLFKSVMEPTITAFQPSSIVLQCGADSLGCDRLGAFNLSISAHGECVRYIKAFNLPLLVVGGGGYTVRNVSRCWTYETSLLVGAQIPEQLPHTPYDAFFAPDHALHPKIVGKVDNQNTRASLERIRVTIREKLRYLNGAPSVQMSEIPPELGAWLEDEYERKNEDGDEEQTRTDGRPSGDVRRQDPRRRRNEFYDAERDGERNRDVPAPAMTRRSARGRGRASRGRSRNVSGGNTRGDTGADGEIESIAEEDEESPPTPGPPARGRRGGRGRRGKGRSSVAASSIQATPATESTPLPPPDANEVDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.48
4 0.43
5 0.38
6 0.33
7 0.31
8 0.26
9 0.25
10 0.23
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.24
19 0.25
20 0.34
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.33
25 0.34
26 0.28
27 0.3
28 0.27
29 0.27
30 0.27
31 0.28
32 0.26
33 0.26
34 0.29
35 0.29
36 0.27
37 0.29
38 0.31
39 0.31
40 0.39
41 0.39
42 0.42
43 0.47
44 0.52
45 0.57
46 0.61
47 0.67
48 0.66
49 0.66
50 0.64
51 0.63
52 0.63
53 0.56
54 0.49
55 0.42
56 0.34
57 0.29
58 0.25
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.21
65 0.27
66 0.34
67 0.38
68 0.37
69 0.41
70 0.48
71 0.5
72 0.49
73 0.47
74 0.41
75 0.37
76 0.31
77 0.33
78 0.27
79 0.25
80 0.27
81 0.23
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.13
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.2
104 0.21
105 0.25
106 0.23
107 0.25
108 0.23
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.29
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.18
118 0.18
119 0.19
120 0.11
121 0.12
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.08
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.16
162 0.19
163 0.21
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.19
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.03
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.15
186 0.15
187 0.13
188 0.16
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.15
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.24
218 0.22
219 0.15
220 0.14
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.15
225 0.14
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.09
325 0.12
326 0.13
327 0.2
328 0.21
329 0.22
330 0.24
331 0.25
332 0.23
333 0.21
334 0.19
335 0.13
336 0.11
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.06
341 0.06
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.12
360 0.13
361 0.15
362 0.16
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.25
367 0.33
368 0.38
369 0.37
370 0.36
371 0.35
372 0.35
373 0.35
374 0.29
375 0.25
376 0.23
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.28
382 0.33
383 0.35
384 0.36
385 0.35
386 0.37
387 0.38
388 0.4
389 0.38
390 0.37
391 0.35
392 0.29
393 0.28
394 0.26
395 0.23
396 0.19
397 0.19
398 0.13
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.1
413 0.12
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.15
419 0.18
420 0.2
421 0.23
422 0.23
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.21
427 0.19
428 0.19
429 0.15
430 0.21
431 0.24
432 0.33
433 0.38
434 0.43
435 0.45
436 0.51
437 0.6
438 0.63
439 0.7
440 0.72
441 0.76
442 0.79
443 0.82
444 0.8
445 0.8
446 0.77
447 0.74
448 0.73
449 0.64
450 0.59
451 0.53
452 0.46
453 0.38
454 0.36
455 0.31
456 0.23
457 0.23
458 0.25
459 0.24
460 0.25
461 0.29
462 0.29
463 0.3
464 0.33
465 0.33
466 0.32
467 0.37
468 0.41
469 0.44
470 0.46
471 0.53
472 0.58
473 0.64
474 0.71
475 0.74
476 0.75
477 0.76
478 0.77
479 0.75
480 0.72
481 0.68
482 0.65
483 0.62
484 0.61
485 0.55
486 0.53
487 0.49
488 0.44
489 0.4
490 0.34
491 0.29
492 0.22
493 0.2
494 0.16
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.08
507 0.1
508 0.1
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.16
513 0.17
514 0.22
515 0.29
516 0.37
517 0.44
518 0.53
519 0.56
520 0.63
521 0.72
522 0.76
523 0.77
524 0.8
525 0.81
526 0.82
527 0.86
528 0.82
529 0.79
530 0.77
531 0.73
532 0.68
533 0.62
534 0.54
535 0.51
536 0.45
537 0.39
538 0.32
539 0.27
540 0.21
541 0.19
542 0.18
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.18
548 0.26
549 0.27
550 0.27
551 0.27
552 0.28
553 0.35