Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QMA0

Protein Details
Accession B6QMA0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-242NLPAKHKNAARRRAPRRDEYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-193IKRKAEEPIRRPEKPSSTANGNDVKARPKAPLPVRPVVAKKPTPPAAPAKPPPKGSFADLMAKAKAVQKEAPKVGVLKHQAALPKEKISKSEMKRRMEAKAKGKEAARSGKQPGVSPAPNTGKKIEGKPGID
195-198SAKK
225-237AKHKNAARRRAPR
300-318KRAKMERKQKLAALARAKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG tmf:PMAA_060060  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLSSVLSSIETGTPASLPPTTPRPSTSALSATVTKSEPRKSTPSAPTSNRPTSSNPSAGIKRKAEEPIRRPEKPSSTANGNDVKARPKAPLPVRPVVAKKPTPPAAPAKPPPKGSFADLMAKAKAVQKEAPKVGVLKHQAALPKEKISKSEMKRRMEAKAKGKEAARSGKQPGVSPAPNTGKKIEGKPGIDVSAKKREPEENTYKGTSRSAQPSYKGTANLPAKHKNAARRRAPRRDEYLGTDEEDEGDFYDDYDDYYSDASSDMEAGYGDMEREEYAALRAAQREDEEDIRMEAEAKRAKMERKQKLAALARAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.16
8 0.23
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.33
13 0.37
14 0.38
15 0.37
16 0.33
17 0.31
18 0.32
19 0.32
20 0.28
21 0.27
22 0.25
23 0.26
24 0.29
25 0.34
26 0.34
27 0.38
28 0.43
29 0.46
30 0.54
31 0.58
32 0.61
33 0.63
34 0.64
35 0.67
36 0.69
37 0.71
38 0.63
39 0.57
40 0.55
41 0.54
42 0.55
43 0.5
44 0.43
45 0.42
46 0.47
47 0.51
48 0.53
49 0.48
50 0.43
51 0.44
52 0.5
53 0.53
54 0.56
55 0.55
56 0.59
57 0.64
58 0.65
59 0.65
60 0.64
61 0.62
62 0.58
63 0.56
64 0.5
65 0.48
66 0.48
67 0.49
68 0.46
69 0.4
70 0.39
71 0.37
72 0.36
73 0.33
74 0.31
75 0.29
76 0.26
77 0.34
78 0.36
79 0.42
80 0.45
81 0.47
82 0.48
83 0.5
84 0.51
85 0.49
86 0.5
87 0.45
88 0.42
89 0.45
90 0.47
91 0.44
92 0.44
93 0.45
94 0.43
95 0.48
96 0.52
97 0.51
98 0.52
99 0.54
100 0.53
101 0.49
102 0.44
103 0.39
104 0.35
105 0.3
106 0.31
107 0.29
108 0.29
109 0.24
110 0.23
111 0.21
112 0.22
113 0.21
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.28
118 0.29
119 0.29
120 0.26
121 0.25
122 0.24
123 0.27
124 0.25
125 0.21
126 0.2
127 0.21
128 0.24
129 0.24
130 0.28
131 0.23
132 0.25
133 0.27
134 0.27
135 0.27
136 0.29
137 0.36
138 0.37
139 0.45
140 0.48
141 0.48
142 0.52
143 0.53
144 0.55
145 0.54
146 0.56
147 0.55
148 0.54
149 0.53
150 0.51
151 0.5
152 0.47
153 0.43
154 0.43
155 0.36
156 0.33
157 0.34
158 0.33
159 0.32
160 0.3
161 0.28
162 0.27
163 0.25
164 0.22
165 0.26
166 0.3
167 0.31
168 0.32
169 0.3
170 0.29
171 0.31
172 0.32
173 0.33
174 0.31
175 0.3
176 0.3
177 0.3
178 0.28
179 0.28
180 0.27
181 0.25
182 0.31
183 0.3
184 0.29
185 0.3
186 0.33
187 0.36
188 0.43
189 0.46
190 0.41
191 0.44
192 0.45
193 0.44
194 0.4
195 0.37
196 0.3
197 0.27
198 0.29
199 0.31
200 0.31
201 0.33
202 0.35
203 0.37
204 0.37
205 0.33
206 0.27
207 0.31
208 0.35
209 0.38
210 0.4
211 0.44
212 0.42
213 0.47
214 0.5
215 0.51
216 0.54
217 0.58
218 0.63
219 0.66
220 0.75
221 0.79
222 0.83
223 0.81
224 0.79
225 0.76
226 0.69
227 0.64
228 0.59
229 0.5
230 0.44
231 0.37
232 0.3
233 0.24
234 0.21
235 0.15
236 0.1
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.1
268 0.11
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.19
273 0.19
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.15
284 0.21
285 0.24
286 0.24
287 0.29
288 0.34
289 0.41
290 0.48
291 0.58
292 0.6
293 0.64
294 0.69
295 0.67
296 0.72
297 0.73
298 0.72