FuNGI

A0A067NPW2

Protein Details

Accession

A0A067NPW2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
111-130	DILRKAKEARQKNTKDETKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSLIGSVFERKRSGSVKPNAPSVAGRKTGFPPVQHRSKSAFARGRDDARKGDATTSRQVAPPPVIQRNADAEDWREQISRENETRVENMSESERQEEINEIMQRFGSGVGDILRKAKEARQKNTKDETKVSAEKRCGTCSFPSPAINFTPVVGSPPPALSTSSTRPSSRAENRKLRFAELTPDDVHVYESAPPSPRKKGPLLLLPPPDSSESTEDKPISLGTWTQSQIKKSNNEPEEGTPEYIRRRYFPQVPPNDPSLAWIEEDPSSTSTLSLRFDLTGTPIPASQSSLLPTHLGLHHHAEGSRAGYTLDDIFLLTRSTVPAQRTVMLGVLAGIARWLVRLLRDQSASNGLDVTDIRGKEEELRRRILAAGINALNERGSPAARAVDVIWECLVGWEANHTDNRVVEWERRRSSRLASSEATKSVISTLSLDFLLPKISEIFALGALPQESLIQLLGIVHRLGKENNSIADSIVTTPKLLANVVQKFLLSPSPTSTNDPASDEDSGPQPLALELLITLASASRTSATSITELADTLLRFITTLPSASPFGSQSATSLLSLTIRLYKTLASYGLYASIATTAYSHFNLLQRYILSCSANQPAQKDRLSLCRDYLMLLEGWIVCATDPHRTTPAHEILWSQVVGWGWKDDILEFRDILEAGEEEFSAWAALWNAQAAWVEGSKVNAVRGGTAEREDAIAALKDGFSQELGKERLVISLAANRMRVALAESPEPNVVWLEEISNASLALSAALRLWVACAPPLSEGPMEEPHLILPFSLISDISANLVNHVLWSWSSSLDIISKLPPLLVYFRPLTDFLRTYLQVSRRLPDVTDDLWLAQSFTILGRMIQGDEEYALEVVKDIACAISRDFMSAFDVPTVIWERGGLSILQPFLCHMVRPKGDVYIGPLHPSIHSISASTTQRLASAATAFSCKSETTGLPLDRDWAMSPLDHLLRSGSSTVFQNLPPSWDASETEVTRSTLLLAMAQQNILARYKLDSFTMSREEAVFGCMKVFMLEHGQLHSDSSDEVFRDREVGKLMDSLLKPYTLSASKGLRKEGVETGDLEEVAVRFLGPGTPFYQYYQDFVGLYDAISFSHPTFARLLLPPTSMRYPLDYRKHIWSDYSHILKNIRPPVGDIISGSLREYLYPVERDTQLITAYLRALVKGDLENASFLRKVAVHHIACNVWDDSDDNKSVKLLKAVVVQGGPMVVKAVVLYDVAEDGSTRPISQEIREKRLARLQLFGDGSLVERLRPLLES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.51
3	0.56
4	0.58
5	0.63
6	0.58
7	0.57
8	0.54
9	0.5
10	0.48
11	0.44
12	0.41
13	0.39
14	0.42
15	0.49
16	0.48
17	0.47
18	0.49
19	0.52
20	0.61
21	0.6
22	0.61
23	0.57
24	0.62
25	0.62
26	0.63
27	0.62
28	0.56
29	0.6
30	0.62
31	0.65
32	0.64
33	0.62
34	0.55
35	0.54
36	0.54
37	0.48
38	0.49
39	0.46
40	0.45
41	0.47
42	0.47
43	0.43
44	0.41
45	0.42
46	0.4
47	0.38
48	0.4
49	0.41
50	0.44
51	0.46
52	0.44
53	0.46
54	0.47
55	0.46
56	0.41
57	0.35
58	0.32
59	0.33
60	0.34
61	0.33
62	0.28
63	0.24
64	0.3
65	0.33
66	0.37
67	0.35
68	0.38
69	0.38
70	0.4
71	0.42
72	0.38
73	0.36
74	0.28
75	0.27
76	0.28
77	0.29
78	0.28
79	0.29
80	0.26
81	0.23
82	0.23
83	0.24
84	0.21
85	0.24
86	0.27
87	0.24
88	0.25
89	0.24
90	0.23
91	0.21
92	0.19
93	0.12
94	0.08
95	0.09
96	0.11
97	0.13
98	0.14
99	0.17
100	0.17
101	0.18
102	0.21
103	0.26
104	0.32
105	0.4
106	0.49
107	0.56
108	0.63
109	0.7
110	0.79
111	0.8
112	0.77
113	0.72
114	0.69
115	0.66
116	0.67
117	0.64
118	0.61
119	0.58
120	0.6
121	0.58
122	0.58
123	0.51
124	0.47
125	0.47
126	0.45
127	0.45
128	0.41
129	0.42
130	0.38
131	0.39
132	0.37
133	0.35
134	0.29
135	0.23
136	0.22
137	0.18
138	0.2
139	0.17
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.17
144	0.16
145	0.17
146	0.16
147	0.22
148	0.26
149	0.32
150	0.35
151	0.35
152	0.36
153	0.38
154	0.45
155	0.5
156	0.54
157	0.57
158	0.63
159	0.66
160	0.73
161	0.71
162	0.65
163	0.59
164	0.5
165	0.49
166	0.42
167	0.43
168	0.35
169	0.35
170	0.32
171	0.27
172	0.27
173	0.18
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.17
178	0.22
179	0.27
180	0.3
181	0.38
182	0.42
183	0.44
184	0.47
185	0.51
186	0.53
187	0.58
188	0.59
189	0.59
190	0.61
191	0.58
192	0.53
193	0.48
194	0.44
195	0.35
196	0.32
197	0.29
198	0.27
199	0.27
200	0.31
201	0.29
202	0.27
203	0.26
204	0.23
205	0.19
206	0.16
207	0.15
208	0.12
209	0.17
210	0.18
211	0.25
212	0.28
213	0.32
214	0.37
215	0.42
216	0.46
217	0.48
218	0.56
219	0.51
220	0.5
221	0.49
222	0.46
223	0.45
224	0.42
225	0.37
226	0.28
227	0.3
228	0.33
229	0.35
230	0.33
231	0.3
232	0.33
233	0.39
234	0.47
235	0.52
236	0.56
237	0.61
238	0.65
239	0.66
240	0.64
241	0.58
242	0.48
243	0.41
244	0.35
245	0.26
246	0.21
247	0.18
248	0.16
249	0.15
250	0.16
251	0.16
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.13
256	0.12
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.13
262	0.13
263	0.13
264	0.16
265	0.18
266	0.17
267	0.17
268	0.17
269	0.18
270	0.18
271	0.19
272	0.17
273	0.13
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.14
278	0.14
279	0.15
280	0.16
281	0.16
282	0.17
283	0.2
284	0.21
285	0.21
286	0.21
287	0.2
288	0.19
289	0.18
290	0.17
291	0.12
292	0.11
293	0.09
294	0.11
295	0.1
296	0.09
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.06
304	0.08
305	0.1
306	0.14
307	0.15
308	0.19
309	0.2
310	0.21
311	0.22
312	0.21
313	0.19
314	0.15
315	0.13
316	0.09
317	0.08
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.12
328	0.16
329	0.2
330	0.22
331	0.22
332	0.24
333	0.29
334	0.28
335	0.23
336	0.19
337	0.15
338	0.15
339	0.14
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.22
347	0.3
348	0.35
349	0.35
350	0.39
351	0.38
352	0.39
353	0.39
354	0.34
355	0.29
356	0.21
357	0.22
358	0.18
359	0.19
360	0.18
361	0.17
362	0.14
363	0.11
364	0.1
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.14
374	0.13
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.05
382	0.05
383	0.07
384	0.08
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.12
390	0.13
391	0.14
392	0.16
393	0.2
394	0.27
395	0.35
396	0.39
397	0.42
398	0.44
399	0.43
400	0.45
401	0.47
402	0.43
403	0.39
404	0.36
405	0.38
406	0.37
407	0.36
408	0.32
409	0.24
410	0.2
411	0.16
412	0.15
413	0.11
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.13
458	0.12
459	0.1
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.11
468	0.16
469	0.19
470	0.2
471	0.19
472	0.18
473	0.18
474	0.19
475	0.19
476	0.12
477	0.11
478	0.13
479	0.17
480	0.19
481	0.22
482	0.23
483	0.22
484	0.22
485	0.23
486	0.22
487	0.2
488	0.2
489	0.16
490	0.16
491	0.14
492	0.14
493	0.12
494	0.1
495	0.08
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.04
500	0.03
501	0.04
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.08
518	0.08
519	0.07
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.08
528	0.06
529	0.07
530	0.06
531	0.08
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.09
541	0.1
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.08
547	0.08
548	0.1
549	0.09
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.12
555	0.12
556	0.08
557	0.09
558	0.08
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.11
573	0.12
574	0.12
575	0.12
576	0.11
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.12
581	0.12
582	0.14
583	0.15
584	0.17
585	0.17
586	0.17
587	0.19
588	0.23
589	0.23
590	0.23
591	0.21
592	0.28
593	0.31
594	0.29
595	0.27
596	0.23
597	0.23
598	0.21
599	0.2
600	0.12
601	0.09
602	0.08
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.05
610	0.05
611	0.1
612	0.11
613	0.13
614	0.16
615	0.16
616	0.18
617	0.23
618	0.26
619	0.21
620	0.2
621	0.2
622	0.18
623	0.19
624	0.16
625	0.1
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.08
630	0.08
631	0.06
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.08
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.1
642	0.1
643	0.07
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.03
653	0.03
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.06
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.07
682	0.06
683	0.06
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.11
694	0.12
695	0.12
696	0.13
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.13
701	0.09
702	0.11
703	0.14
704	0.14
705	0.14
706	0.13
707	0.13
708	0.13
709	0.12
710	0.1
711	0.1
712	0.11
713	0.13
714	0.13
715	0.14
716	0.14
717	0.14
718	0.12
719	0.09
720	0.08
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.07
727	0.06
728	0.06
729	0.05
730	0.06
731	0.05
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.06
743	0.06
744	0.07
745	0.08
746	0.08
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.11
751	0.12
752	0.14
753	0.13
754	0.13
755	0.11
756	0.12
757	0.11
758	0.08
759	0.07
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.04
765	0.05
766	0.05
767	0.06
768	0.08
769	0.08
770	0.08
771	0.09
772	0.08
773	0.08
774	0.08
775	0.07
776	0.05
777	0.06
778	0.06
779	0.06
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.08
784	0.09
785	0.08
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.12
793	0.12
794	0.15
795	0.15
796	0.15
797	0.17
798	0.18
799	0.18
800	0.18
801	0.18
802	0.17
803	0.2
804	0.2
805	0.2
806	0.24
807	0.27
808	0.3
809	0.31
810	0.31
811	0.29
812	0.29
813	0.27
814	0.25
815	0.24
816	0.18
817	0.18
818	0.16
819	0.14
820	0.14
821	0.14
822	0.11
823	0.07
824	0.07
825	0.05
826	0.05
827	0.07
828	0.06
829	0.06
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.05
841	0.04
842	0.04
843	0.05
844	0.05
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.05
849	0.06
850	0.07
851	0.09
852	0.09
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.13
857	0.13
858	0.13
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.11
863	0.14
864	0.11
865	0.1
866	0.1
867	0.1
868	0.11
869	0.12
870	0.09
871	0.07
872	0.09
873	0.1
874	0.1
875	0.09
876	0.09
877	0.12
878	0.12
879	0.12
880	0.14
881	0.21
882	0.22
883	0.25
884	0.26
885	0.24
886	0.25
887	0.24
888	0.25
889	0.25
890	0.24
891	0.24
892	0.23
893	0.22
894	0.21
895	0.22
896	0.18
897	0.13
898	0.13
899	0.11
900	0.12
901	0.18
902	0.2
903	0.19
904	0.19
905	0.17
906	0.18
907	0.18
908	0.17
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.1
913	0.11
914	0.11
915	0.11
916	0.12
917	0.1
918	0.1
919	0.12
920	0.12
921	0.15
922	0.22
923	0.23
924	0.23
925	0.23
926	0.25
927	0.22
928	0.23
929	0.19
930	0.13
931	0.13
932	0.11
933	0.12
934	0.14
935	0.15
936	0.14
937	0.13
938	0.12
939	0.12
940	0.14
941	0.14
942	0.1
943	0.1
944	0.12
945	0.14
946	0.15
947	0.15
948	0.18
949	0.17
950	0.2
951	0.19
952	0.19
953	0.18
954	0.18
955	0.18
956	0.18
957	0.23
958	0.21
959	0.22
960	0.22
961	0.22
962	0.2
963	0.19
964	0.16
965	0.12
966	0.12
967	0.1
968	0.11
969	0.13
970	0.14
971	0.13
972	0.13
973	0.13
974	0.14
975	0.14
976	0.13
977	0.1
978	0.12
979	0.15
980	0.15
981	0.16
982	0.17
983	0.17
984	0.21
985	0.25
986	0.23
987	0.21
988	0.2
989	0.21
990	0.18
991	0.19
992	0.16
993	0.12
994	0.12
995	0.11
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.08
1000	0.11
1001	0.13
1002	0.14
1003	0.15
1004	0.16
1005	0.16
1006	0.17
1007	0.15
1008	0.11
1009	0.09
1010	0.1
1011	0.11
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.15
1017	0.15
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.17
1021	0.17
1022	0.17
1023	0.19
1024	0.21
1025	0.21
1026	0.22
1027	0.2
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.17
1031	0.21
1032	0.17
1033	0.19
1034	0.21
1035	0.28
1036	0.34
1037	0.37
1038	0.39
1039	0.38
1040	0.37
1041	0.39
1042	0.38
1043	0.33
1044	0.28
1045	0.27
1046	0.26
1047	0.24
1048	0.23
1049	0.19
1050	0.15
1051	0.12
1052	0.11
1053	0.09
1054	0.06
1055	0.05
1056	0.06
1057	0.09
1058	0.08
1059	0.1
1060	0.12
1061	0.15
1062	0.16
1063	0.18
1064	0.24
1065	0.22
1066	0.23
1067	0.23
1068	0.22
1069	0.19
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.13
1073	0.12
1074	0.11
1075	0.09
1076	0.08
1077	0.09
1078	0.1
1079	0.09
1080	0.16
1081	0.16
1082	0.17
1083	0.18
1084	0.19
1085	0.22
1086	0.23
1087	0.26
1088	0.21
1089	0.24
1090	0.24
1091	0.27
1092	0.29
1093	0.27
1094	0.26
1095	0.28
1096	0.33
1097	0.4
1098	0.47
1099	0.47
1100	0.48
1101	0.55
1102	0.58
1103	0.54
1104	0.51
1105	0.45
1106	0.44
1107	0.47
1108	0.5
1109	0.42
1110	0.42
1111	0.43
1112	0.42
1113	0.47
1114	0.48
1115	0.42
1116	0.36
1117	0.37
1118	0.41
1119	0.4
1120	0.38
1121	0.3
1122	0.26
1123	0.25
1124	0.25
1125	0.22
1126	0.18
1127	0.15
1128	0.15
1129	0.15
1130	0.15
1131	0.18
1132	0.19
1133	0.21
1134	0.23
1135	0.24
1136	0.26
1137	0.26
1138	0.24
1139	0.2
1140	0.2
1141	0.18
1142	0.15
1143	0.15
1144	0.17
1145	0.15
1146	0.14
1147	0.14
1148	0.13
1149	0.15
1150	0.15
1151	0.17
1152	0.16
1153	0.16
1154	0.18
1155	0.17
1156	0.2
1157	0.18
1158	0.16
1159	0.17
1160	0.16
1161	0.17
1162	0.23
1163	0.32
1164	0.3
1165	0.33
1166	0.37
1167	0.35
1168	0.34
1169	0.36
1170	0.28
1171	0.19
1172	0.18
1173	0.17
1174	0.16
1175	0.21
1176	0.23
1177	0.2
1178	0.2
1179	0.22
1180	0.25
1181	0.26
1182	0.27
1183	0.24
1184	0.25
1185	0.3
1186	0.32
1187	0.33
1188	0.29
1189	0.26
1190	0.22
1191	0.21
1192	0.17
1193	0.11
1194	0.1
1195	0.07
1196	0.07
1197	0.07
1198	0.07
1199	0.07
1200	0.07
1201	0.07
1202	0.07
1203	0.07
1204	0.07
1205	0.07
1206	0.07
1207	0.07
1208	0.12
1209	0.13
1210	0.12
1211	0.13
1212	0.17
1213	0.2
1214	0.25
1215	0.34
1216	0.38
1217	0.45
1218	0.54
1219	0.55
1220	0.57
1221	0.63
1222	0.65
1223	0.57
1224	0.55
1225	0.49
1226	0.48
1227	0.48
1228	0.41
1229	0.34
1230	0.26
1231	0.25
1232	0.24
1233	0.22
1234	0.15
1235	0.14
1236	0.15

A0A067NPW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer