Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q6Q0

Protein Details
Accession B6Q6Q0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-400EKTKAEKAEKQRQSKEKAKAEKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-400KRERARKEAEEKTKAEKAEKQRQSKEKAKAEKA
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, cyto 6, mito 3, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG tmf:PMAA_034530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLGNFLADENFGSWADEMEDMPLPAAPEPRSTYGGERRAVSSTAAFGNGFNDRERPAFSSRPELPLPTEPPFTAHIGNLSFDATSSDVSQLFADCEVTNVRIVEDKLNRSPKGFGYVEFASVEGLKKALTFSGTTLQGRAIRVSIAEPPKDSASSRDFSDWSRKGPLPDLPRRGTDRGGFNRDFPDNVSETGSSRGGRRQFEGDGKVRDFGNWERKGPLSPVAAVAGREGGRPRSNEGSNFRKNSPAWGEGRSQDGSRPPRREFQERPERPERTPTAAEMDNQWRARMRPDPAPKEPSAPSSPVATAATPATPAAPAVRPKLNLQKRTVSENVQSPPLSATGDSKASPFGAARPIDTAAREQEVVAKRERARKEAEEKTKAEKAEKQRQSKEKAKAEKAAAGENGTKETDLDAPKKSNFEVLRRTDDEAGETEAEAAKEETTAAKEQPKEATESKTNGSWRKAEPAPAEADEEGWSTVSTGKRNKGRGRGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.13
13 0.17
14 0.16
15 0.19
16 0.24
17 0.27
18 0.3
19 0.31
20 0.37
21 0.42
22 0.47
23 0.46
24 0.43
25 0.42
26 0.42
27 0.41
28 0.35
29 0.26
30 0.22
31 0.2
32 0.2
33 0.17
34 0.15
35 0.17
36 0.18
37 0.19
38 0.17
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.23
43 0.24
44 0.27
45 0.31
46 0.33
47 0.39
48 0.4
49 0.44
50 0.43
51 0.41
52 0.39
53 0.41
54 0.43
55 0.38
56 0.38
57 0.32
58 0.33
59 0.34
60 0.32
61 0.26
62 0.22
63 0.21
64 0.19
65 0.2
66 0.18
67 0.16
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.21
92 0.26
93 0.3
94 0.36
95 0.44
96 0.44
97 0.43
98 0.44
99 0.38
100 0.4
101 0.35
102 0.28
103 0.27
104 0.27
105 0.27
106 0.24
107 0.22
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.15
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.16
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.18
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.33
148 0.3
149 0.28
150 0.32
151 0.33
152 0.32
153 0.34
154 0.38
155 0.38
156 0.44
157 0.49
158 0.46
159 0.48
160 0.51
161 0.5
162 0.47
163 0.42
164 0.43
165 0.42
166 0.47
167 0.43
168 0.4
169 0.42
170 0.39
171 0.35
172 0.27
173 0.24
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.15
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.14
182 0.14
183 0.18
184 0.21
185 0.22
186 0.24
187 0.24
188 0.26
189 0.3
190 0.34
191 0.34
192 0.33
193 0.32
194 0.32
195 0.29
196 0.26
197 0.24
198 0.24
199 0.3
200 0.28
201 0.28
202 0.28
203 0.29
204 0.3
205 0.28
206 0.27
207 0.18
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.18
222 0.21
223 0.22
224 0.26
225 0.31
226 0.36
227 0.4
228 0.42
229 0.4
230 0.39
231 0.38
232 0.38
233 0.36
234 0.32
235 0.27
236 0.27
237 0.28
238 0.24
239 0.28
240 0.24
241 0.2
242 0.18
243 0.23
244 0.29
245 0.34
246 0.38
247 0.37
248 0.43
249 0.48
250 0.54
251 0.52
252 0.54
253 0.59
254 0.57
255 0.62
256 0.64
257 0.62
258 0.55
259 0.58
260 0.51
261 0.46
262 0.43
263 0.36
264 0.32
265 0.29
266 0.29
267 0.25
268 0.26
269 0.26
270 0.25
271 0.25
272 0.22
273 0.22
274 0.25
275 0.26
276 0.26
277 0.29
278 0.38
279 0.45
280 0.49
281 0.54
282 0.51
283 0.5
284 0.47
285 0.43
286 0.37
287 0.32
288 0.27
289 0.23
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.14
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.1
304 0.13
305 0.16
306 0.19
307 0.21
308 0.24
309 0.35
310 0.41
311 0.44
312 0.46
313 0.5
314 0.49
315 0.54
316 0.53
317 0.47
318 0.43
319 0.42
320 0.4
321 0.35
322 0.33
323 0.27
324 0.25
325 0.22
326 0.19
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.11
337 0.11
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.19
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.14
350 0.2
351 0.24
352 0.26
353 0.27
354 0.31
355 0.34
356 0.43
357 0.46
358 0.43
359 0.44
360 0.5
361 0.56
362 0.59
363 0.64
364 0.63
365 0.63
366 0.65
367 0.63
368 0.57
369 0.53
370 0.5
371 0.51
372 0.54
373 0.61
374 0.63
375 0.68
376 0.75
377 0.79
378 0.81
379 0.81
380 0.79
381 0.8
382 0.77
383 0.75
384 0.69
385 0.65
386 0.58
387 0.52
388 0.44
389 0.37
390 0.34
391 0.27
392 0.26
393 0.22
394 0.2
395 0.15
396 0.16
397 0.19
398 0.21
399 0.23
400 0.25
401 0.29
402 0.32
403 0.34
404 0.33
405 0.35
406 0.34
407 0.38
408 0.43
409 0.45
410 0.51
411 0.51
412 0.54
413 0.49
414 0.45
415 0.4
416 0.33
417 0.3
418 0.23
419 0.2
420 0.17
421 0.16
422 0.15
423 0.14
424 0.12
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.12
430 0.15
431 0.17
432 0.23
433 0.25
434 0.28
435 0.34
436 0.34
437 0.37
438 0.38
439 0.42
440 0.41
441 0.43
442 0.43
443 0.42
444 0.48
445 0.48
446 0.49
447 0.48
448 0.45
449 0.49
450 0.5
451 0.52
452 0.49
453 0.46
454 0.46
455 0.42
456 0.42
457 0.34
458 0.32
459 0.25
460 0.23
461 0.19
462 0.14
463 0.13
464 0.1
465 0.15
466 0.17
467 0.23
468 0.29
469 0.38
470 0.46
471 0.55
472 0.63