Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QTU4

Protein Details
Accession B6QTU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39IDAVKNKKTKTIRQTARLFDHydrophilic
122-142SRNPDLKCKFARRLSRKRALCHydrophilic
463-483AVDQLQKRRTRRTQALLNEGIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 8.333, mito 7.5, cyto_mito 6.666, cyto 4.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG tmf:PMAA_005430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MIKKRTKSEPSYEGRISLSIDAVKNKKTKTIRQTARLFDVSEATLRNRLKGGITSKEAGIDRRKLTPTEEIALRNWILSLERRGLPPRREMAREMANVLLAERDKTKPPKKVGINWIDSFLSRNPDLKCKFARRLSRKRALCEDPVLINGFFERLLCLKQTYGIVDDDIYNFDETGFAMGIGATAKVIYSSDRQGKPSIIQPGNREWVTVVECVGSSSIIVPPLIIFKSRHNQAEWYTDPILPPDWSITHSPKGWTFDELGLQWLEKIFEPFTRPLTVGAYRLLILDGHSSHLTPEFDRACEKSNIITCCLPAHSSYILQPLDVGVFSVLKRLYGTAVENRIRIGLHHVDKIDFLAMLLSYGFKLIPYKILRAAFHILELFQEASPVQSRPNTSSSHSWSPKTPYNPRTVGRQGKAIKKLLNMTNLESNTPTSQALDQLLKGALITMHNAAILTSENHKLCEAVDQLQKRRTRRTQALLNEGILTVSEGRELAQALN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.46
3 0.4
4 0.31
5 0.26
6 0.22
7 0.24
8 0.29
9 0.32
10 0.37
11 0.41
12 0.41
13 0.48
14 0.51
15 0.58
16 0.61
17 0.68
18 0.71
19 0.75
20 0.82
21 0.79
22 0.79
23 0.71
24 0.62
25 0.52
26 0.45
27 0.37
28 0.31
29 0.27
30 0.22
31 0.27
32 0.26
33 0.27
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.3
38 0.33
39 0.33
40 0.37
41 0.37
42 0.36
43 0.4
44 0.39
45 0.38
46 0.4
47 0.4
48 0.38
49 0.42
50 0.45
51 0.41
52 0.43
53 0.45
54 0.42
55 0.4
56 0.42
57 0.37
58 0.36
59 0.38
60 0.34
61 0.27
62 0.22
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.27
70 0.35
71 0.43
72 0.44
73 0.48
74 0.51
75 0.51
76 0.53
77 0.53
78 0.52
79 0.52
80 0.49
81 0.44
82 0.36
83 0.31
84 0.28
85 0.25
86 0.2
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.22
92 0.33
93 0.41
94 0.46
95 0.52
96 0.6
97 0.65
98 0.71
99 0.74
100 0.74
101 0.73
102 0.65
103 0.61
104 0.53
105 0.45
106 0.39
107 0.31
108 0.26
109 0.2
110 0.24
111 0.23
112 0.32
113 0.34
114 0.37
115 0.43
116 0.46
117 0.54
118 0.57
119 0.66
120 0.67
121 0.76
122 0.81
123 0.82
124 0.8
125 0.78
126 0.78
127 0.72
128 0.66
129 0.59
130 0.51
131 0.42
132 0.39
133 0.35
134 0.26
135 0.21
136 0.16
137 0.12
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.07
177 0.13
178 0.21
179 0.23
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.28
184 0.31
185 0.35
186 0.3
187 0.32
188 0.33
189 0.36
190 0.4
191 0.38
192 0.33
193 0.24
194 0.22
195 0.21
196 0.18
197 0.14
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.06
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.13
215 0.2
216 0.24
217 0.26
218 0.25
219 0.27
220 0.28
221 0.33
222 0.3
223 0.28
224 0.26
225 0.25
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.14
230 0.13
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.13
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.18
239 0.19
240 0.23
241 0.22
242 0.2
243 0.19
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.08
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.24
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.17
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.04
313 0.06
314 0.06
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.14
323 0.15
324 0.23
325 0.25
326 0.25
327 0.25
328 0.25
329 0.23
330 0.21
331 0.21
332 0.22
333 0.22
334 0.25
335 0.26
336 0.25
337 0.26
338 0.26
339 0.2
340 0.12
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.07
352 0.07
353 0.15
354 0.17
355 0.2
356 0.25
357 0.28
358 0.28
359 0.31
360 0.35
361 0.27
362 0.26
363 0.24
364 0.19
365 0.15
366 0.17
367 0.13
368 0.09
369 0.1
370 0.08
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.15
376 0.18
377 0.21
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.34
382 0.39
383 0.45
384 0.47
385 0.45
386 0.47
387 0.51
388 0.54
389 0.56
390 0.58
391 0.54
392 0.59
393 0.63
394 0.6
395 0.63
396 0.65
397 0.66
398 0.58
399 0.61
400 0.6
401 0.62
402 0.68
403 0.65
404 0.59
405 0.54
406 0.59
407 0.55
408 0.55
409 0.49
410 0.45
411 0.47
412 0.44
413 0.41
414 0.34
415 0.32
416 0.26
417 0.25
418 0.21
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.18
426 0.18
427 0.16
428 0.15
429 0.13
430 0.11
431 0.1
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.13
442 0.19
443 0.2
444 0.21
445 0.21
446 0.21
447 0.2
448 0.24
449 0.24
450 0.24
451 0.31
452 0.38
453 0.44
454 0.51
455 0.58
456 0.57
457 0.65
458 0.68
459 0.7
460 0.73
461 0.75
462 0.78
463 0.8
464 0.83
465 0.76
466 0.68
467 0.58
468 0.48
469 0.39
470 0.29
471 0.22
472 0.13
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.11