Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QS19

Protein Details
Accession B6QS19    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-80ARKMSGDKKLSKQAEKKKPSKKGQYKKKYEEDEEEDBasic
158-185IIARSKKLWERLRRKSHVPRDERKKLVABasic
657-677QKSELLKTLKKNKKALEKVAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-72KGITAGARKMSGDKKLSKQAEKKKPSKKGQYKKK
146-182AQERKAAKPNADIIARSKKLWERLRRKSHVPRDERKK
666-688KKNKKALEKVAAGPKDSSDKTKK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tmf:PMAA_043940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MSGTKRKVDSADDRNGKRTKTKTNIAPTAVGTKSTFQKKGITAGARKMSGDKKLSKQAEKKKPSKKGQYKKKYEEDEEEDDDDMNSDISSDESDVSMDDDVDDSEPVEEEEAEEEEEEETENSNGDVNADNKSSSRESHAKQKALAQERKAAKPNADIIARSKKLWERLRRKSHVPRDERKKLVAELFEIITGRVDDFVFKHDSVRVIQTALKYASLEQRKMIVRELQGHYKDLAESRYAKFLLGKMLVHGDADIRDMIVPEFYGHVKRLIRHPEASWIMDDIYRTVATKQQKAIMLREWYGPEYAIFRDNNETSVTAELSTILSESPEKRPPIMRNLFELINQLVQKKTTGFTMLHDAMLQYFLNTKPGSSEANEFIELIKGDEEGDLAKNMAFTKSGARLMCLCLAYSSAKDRKLLLRFYRDTIKMMAGDVNGHLVILAAYGVIDDTKLSSKSIFPELLNQETEETARHEELLLQINDIIARVPVLYPFVGDKVKWLLPAGDEDILNEIFEIRKETSKKEPSIRRQELVQAASPSLLEFIAARAESLMETSFGCQFLSEVLFSADGDKSAALNAVAVAAKSKIEAQDSPFVGRMLKSLVQGGRYNNAEKKIEKVDPALNFDTLLYDNIKDDILAWATGPQTFVIVALAESEDFAQKSELLKTLKKNKKALEKVAAGPKDSSDKTKKAGPSSSGAKLLLSKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.69
3 0.65
4 0.64
5 0.63
6 0.63
7 0.62
8 0.69
9 0.7
10 0.75
11 0.79
12 0.74
13 0.69
14 0.6
15 0.58
16 0.49
17 0.42
18 0.33
19 0.3
20 0.35
21 0.4
22 0.41
23 0.36
24 0.43
25 0.43
26 0.48
27 0.51
28 0.51
29 0.48
30 0.54
31 0.58
32 0.52
33 0.51
34 0.51
35 0.48
36 0.48
37 0.5
38 0.49
39 0.51
40 0.6
41 0.67
42 0.7
43 0.74
44 0.77
45 0.8
46 0.83
47 0.86
48 0.86
49 0.89
50 0.9
51 0.91
52 0.91
53 0.91
54 0.92
55 0.93
56 0.94
57 0.93
58 0.93
59 0.9
60 0.85
61 0.83
62 0.79
63 0.75
64 0.68
65 0.6
66 0.5
67 0.42
68 0.35
69 0.26
70 0.19
71 0.12
72 0.08
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.24
123 0.29
124 0.32
125 0.42
126 0.5
127 0.48
128 0.48
129 0.53
130 0.55
131 0.57
132 0.6
133 0.53
134 0.54
135 0.57
136 0.61
137 0.62
138 0.56
139 0.48
140 0.46
141 0.48
142 0.45
143 0.4
144 0.35
145 0.34
146 0.41
147 0.4
148 0.36
149 0.36
150 0.35
151 0.43
152 0.51
153 0.56
154 0.57
155 0.66
156 0.77
157 0.78
158 0.83
159 0.84
160 0.85
161 0.85
162 0.84
163 0.84
164 0.84
165 0.87
166 0.81
167 0.74
168 0.67
169 0.61
170 0.56
171 0.47
172 0.39
173 0.31
174 0.28
175 0.24
176 0.21
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.11
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.19
192 0.21
193 0.19
194 0.16
195 0.19
196 0.18
197 0.2
198 0.19
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.23
203 0.26
204 0.26
205 0.23
206 0.28
207 0.3
208 0.31
209 0.32
210 0.29
211 0.27
212 0.34
213 0.37
214 0.38
215 0.37
216 0.37
217 0.34
218 0.3
219 0.28
220 0.22
221 0.2
222 0.15
223 0.18
224 0.18
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.21
231 0.19
232 0.18
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.13
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.09
252 0.09
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.24
257 0.31
258 0.34
259 0.34
260 0.34
261 0.37
262 0.38
263 0.37
264 0.3
265 0.23
266 0.2
267 0.18
268 0.17
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.13
275 0.17
276 0.21
277 0.22
278 0.25
279 0.28
280 0.3
281 0.32
282 0.32
283 0.3
284 0.28
285 0.28
286 0.25
287 0.22
288 0.2
289 0.18
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.06
313 0.08
314 0.12
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.24
319 0.27
320 0.35
321 0.4
322 0.37
323 0.36
324 0.38
325 0.37
326 0.32
327 0.3
328 0.21
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.15
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.13
366 0.11
367 0.09
368 0.07
369 0.05
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.09
384 0.12
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.16
389 0.17
390 0.19
391 0.17
392 0.14
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.16
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.22
402 0.27
403 0.31
404 0.38
405 0.37
406 0.42
407 0.42
408 0.44
409 0.49
410 0.43
411 0.4
412 0.34
413 0.3
414 0.22
415 0.2
416 0.19
417 0.12
418 0.12
419 0.1
420 0.09
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.04
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.1
441 0.13
442 0.17
443 0.18
444 0.16
445 0.23
446 0.26
447 0.28
448 0.27
449 0.24
450 0.21
451 0.2
452 0.2
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.11
460 0.13
461 0.19
462 0.17
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.11
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.15
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.15
487 0.14
488 0.17
489 0.18
490 0.15
491 0.13
492 0.13
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.1
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.11
501 0.1
502 0.16
503 0.19
504 0.23
505 0.33
506 0.4
507 0.46
508 0.52
509 0.61
510 0.65
511 0.74
512 0.76
513 0.67
514 0.61
515 0.62
516 0.58
517 0.51
518 0.45
519 0.35
520 0.29
521 0.28
522 0.26
523 0.19
524 0.14
525 0.1
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.08
536 0.08
537 0.06
538 0.07
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.11
553 0.1
554 0.08
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.11
571 0.11
572 0.14
573 0.16
574 0.2
575 0.27
576 0.29
577 0.31
578 0.3
579 0.28
580 0.26
581 0.24
582 0.21
583 0.18
584 0.19
585 0.18
586 0.22
587 0.23
588 0.26
589 0.3
590 0.31
591 0.32
592 0.33
593 0.37
594 0.36
595 0.4
596 0.4
597 0.37
598 0.4
599 0.41
600 0.42
601 0.39
602 0.39
603 0.4
604 0.4
605 0.45
606 0.42
607 0.35
608 0.32
609 0.29
610 0.26
611 0.21
612 0.19
613 0.14
614 0.12
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.11
619 0.11
620 0.12
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.14
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.1
641 0.09
642 0.1
643 0.1
644 0.12
645 0.14
646 0.17
647 0.22
648 0.24
649 0.3
650 0.39
651 0.49
652 0.57
653 0.63
654 0.68
655 0.71
656 0.78
657 0.81
658 0.81
659 0.79
660 0.76
661 0.75
662 0.77
663 0.71
664 0.62
665 0.53
666 0.47
667 0.45
668 0.41
669 0.42
670 0.41
671 0.43
672 0.44
673 0.51
674 0.55
675 0.54
676 0.59
677 0.54
678 0.54
679 0.56
680 0.57
681 0.53
682 0.47
683 0.41