Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRK2

Protein Details
Accession A7TRK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22FSSLLPPPKHSNNNNNKSGQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG vpo:Kpol_1071p7  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSFSSLLPPPKHSNNNNNKSGQKLSNVNEIQVKALLAEKYREKDNEIHKNNVLETMFNGGVSFQDFLPVRQRNFDLSIPLPTQELIDETFRRTKDAFDILLSKKLEKPGNMVISNKIASMSSKVIHKVSNQNTERVITITQHAQDPLQPVTFKAKKVVAPPVESTQVPIFHKTDANVAESKKISDEEREKWNIPSAVSNWKNPKGYAIALDKRVNSGATVETDASKKFSELSSALEIADREAREELKMKAEAKKQLAEQELQEKEMKLRILSNRAREERERQRKSRYQGRITTGDNIDYSEREREDNRRVKKLDTEKALKRSRMSTADRLRELAYAQGRDISDKVILGAAKATETSEITYDSRLFSKAANANAKRSDDQVYENPLFVQQDINNIYRVNASKLDKTINEEKDSDINGSNSSNYSTHGPIEFTAAETDNGNSEGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.79
3 0.8
4 0.8
5 0.73
6 0.69
7 0.68
8 0.61
9 0.57
10 0.55
11 0.51
12 0.55
13 0.53
14 0.5
15 0.48
16 0.44
17 0.39
18 0.32
19 0.28
20 0.18
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.23
25 0.27
26 0.3
27 0.36
28 0.37
29 0.37
30 0.42
31 0.5
32 0.56
33 0.55
34 0.58
35 0.56
36 0.57
37 0.53
38 0.51
39 0.41
40 0.3
41 0.26
42 0.25
43 0.21
44 0.18
45 0.17
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.07
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.25
55 0.3
56 0.3
57 0.33
58 0.35
59 0.34
60 0.38
61 0.37
62 0.33
63 0.29
64 0.33
65 0.3
66 0.28
67 0.25
68 0.21
69 0.19
70 0.14
71 0.14
72 0.11
73 0.14
74 0.15
75 0.19
76 0.24
77 0.24
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.27
82 0.3
83 0.27
84 0.24
85 0.31
86 0.3
87 0.36
88 0.35
89 0.31
90 0.3
91 0.35
92 0.36
93 0.3
94 0.34
95 0.35
96 0.41
97 0.41
98 0.4
99 0.36
100 0.36
101 0.35
102 0.3
103 0.22
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.14
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.26
114 0.32
115 0.37
116 0.46
117 0.44
118 0.45
119 0.44
120 0.43
121 0.39
122 0.31
123 0.25
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.17
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.24
138 0.27
139 0.26
140 0.27
141 0.29
142 0.3
143 0.34
144 0.42
145 0.36
146 0.36
147 0.37
148 0.36
149 0.35
150 0.32
151 0.29
152 0.23
153 0.24
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.19
158 0.21
159 0.19
160 0.21
161 0.18
162 0.2
163 0.19
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.19
172 0.24
173 0.24
174 0.31
175 0.35
176 0.35
177 0.35
178 0.38
179 0.32
180 0.27
181 0.26
182 0.21
183 0.27
184 0.28
185 0.32
186 0.33
187 0.37
188 0.37
189 0.34
190 0.34
191 0.26
192 0.25
193 0.25
194 0.27
195 0.26
196 0.29
197 0.31
198 0.29
199 0.28
200 0.28
201 0.23
202 0.16
203 0.13
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.11
225 0.13
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.17
235 0.18
236 0.24
237 0.28
238 0.33
239 0.33
240 0.35
241 0.33
242 0.35
243 0.35
244 0.3
245 0.27
246 0.29
247 0.27
248 0.26
249 0.26
250 0.21
251 0.2
252 0.22
253 0.21
254 0.13
255 0.18
256 0.19
257 0.27
258 0.31
259 0.38
260 0.43
261 0.45
262 0.49
263 0.48
264 0.53
265 0.55
266 0.62
267 0.63
268 0.6
269 0.67
270 0.7
271 0.74
272 0.75
273 0.73
274 0.71
275 0.7
276 0.7
277 0.65
278 0.6
279 0.59
280 0.5
281 0.41
282 0.33
283 0.27
284 0.22
285 0.18
286 0.18
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.19
291 0.24
292 0.33
293 0.41
294 0.45
295 0.51
296 0.52
297 0.52
298 0.58
299 0.62
300 0.59
301 0.59
302 0.61
303 0.59
304 0.67
305 0.72
306 0.66
307 0.59
308 0.54
309 0.52
310 0.52
311 0.51
312 0.51
313 0.54
314 0.58
315 0.56
316 0.54
317 0.49
318 0.42
319 0.36
320 0.32
321 0.28
322 0.21
323 0.2
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.22
328 0.18
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.11
345 0.12
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.14
353 0.21
354 0.24
355 0.3
356 0.39
357 0.39
358 0.44
359 0.49
360 0.52
361 0.45
362 0.43
363 0.41
364 0.33
365 0.36
366 0.36
367 0.39
368 0.36
369 0.35
370 0.33
371 0.3
372 0.28
373 0.23
374 0.22
375 0.15
376 0.21
377 0.25
378 0.25
379 0.25
380 0.24
381 0.25
382 0.25
383 0.27
384 0.23
385 0.26
386 0.29
387 0.32
388 0.35
389 0.4
390 0.37
391 0.42
392 0.48
393 0.47
394 0.47
395 0.43
396 0.43
397 0.42
398 0.42
399 0.38
400 0.31
401 0.26
402 0.24
403 0.24
404 0.23
405 0.19
406 0.2
407 0.18
408 0.17
409 0.2
410 0.2
411 0.22
412 0.22
413 0.22
414 0.2
415 0.24
416 0.22
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.18
421 0.17
422 0.18
423 0.15
424 0.16