Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QID1

Protein Details
Accession B6QID1    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23LPAIIRPQCHRHQRYGDFFRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 8.333, nucl 7.5, cyto_nucl 6.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018850  Mt_escape_2_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039627  Yme2_C  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG tmf:PMAA_097170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10443  RNA12  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MRLPAIIRPQCHRHQRYGDFFRSAFNKQATVGRCTPVALIRSNSTATTITDASTNYSITETLEQGHISVGPNEGLLFINNILPLRLQWLYRLLWIGDSYAVNQVLKRVDKPSYAAADHWAIVRRALPPDMHVNIKEVIPRLSEGGLFIKYSLPDGEKRPKGEIAAAVEEYLKKNPIHPWFNPLDRVGVGCVLGKPWIEDMYHFPSPRLKVEFLPSSSNSTPEELTPEALYSLFRRYGKIKDIDRQPPDSKVLPKYAMVEFTRAKYAILARSCIHGVTIPETVSGGGGGSVLRITYERKVKAHWIREWLFTHPRIVIPAIAALIAGITVIIFDPIRTFFIKMKVKDLFNVDDKAIWSWIRDEVRKANFLSENRSEKKVFRALSDDRQEDINRLQAWLGENGNTFIVVQGPHGSGKREIVIDQALKDRKYKLIIDCNQIQDARSDAATISIAAQQVGYRPIFSWMNSFNSFIDLASQGIIGTKVGFSETLDSQLSKIWTNTATALRQIALESKKKDGSIMSDDDYLEAHPEKRPVVVIDNFLHKGRESNIVDEKLAEWGAALITGNIAHVIFLTPDASYSKTLGKALPSQVFRSISLGDCSLEVGRNFILRYLHNHDEDADKDDDESSTKPKAPPQGLEGLDRCIELVGGRLTDLEFMAHRIKSGESPKSALKHIIEQAAAEIAKAYVFDANSTYTQDAPTWTREQAWYLIKTIAEDKNGSVPYSNIIVSDLFNSADGERTLSALEQKELITVTAVNGRPAAIKPGRPIYHSAFKYLTQDDILRNRLDLGIVREMIARENQTIAKCEAELHLMGDPEKYPSDVKWRMRWVAKRLEDAHWRLEKFERQSKVLVEFLKTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.77
3 0.8
4 0.82
5 0.79
6 0.73
7 0.67
8 0.63
9 0.58
10 0.52
11 0.49
12 0.42
13 0.37
14 0.33
15 0.4
16 0.38
17 0.4
18 0.4
19 0.35
20 0.33
21 0.33
22 0.33
23 0.31
24 0.31
25 0.28
26 0.28
27 0.28
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.21
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.17
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.23
92 0.25
93 0.27
94 0.27
95 0.29
96 0.31
97 0.34
98 0.37
99 0.36
100 0.35
101 0.32
102 0.32
103 0.3
104 0.28
105 0.28
106 0.26
107 0.21
108 0.2
109 0.22
110 0.21
111 0.22
112 0.24
113 0.22
114 0.21
115 0.29
116 0.3
117 0.32
118 0.3
119 0.29
120 0.28
121 0.29
122 0.29
123 0.23
124 0.22
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.18
141 0.25
142 0.35
143 0.38
144 0.4
145 0.43
146 0.42
147 0.41
148 0.4
149 0.37
150 0.32
151 0.31
152 0.28
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.15
160 0.19
161 0.26
162 0.34
163 0.39
164 0.39
165 0.44
166 0.46
167 0.5
168 0.5
169 0.43
170 0.36
171 0.3
172 0.29
173 0.23
174 0.17
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.17
187 0.23
188 0.28
189 0.27
190 0.27
191 0.31
192 0.33
193 0.37
194 0.36
195 0.31
196 0.28
197 0.35
198 0.4
199 0.36
200 0.39
201 0.35
202 0.37
203 0.36
204 0.35
205 0.3
206 0.26
207 0.24
208 0.19
209 0.22
210 0.16
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.12
219 0.16
220 0.17
221 0.19
222 0.22
223 0.27
224 0.33
225 0.4
226 0.41
227 0.44
228 0.53
229 0.59
230 0.61
231 0.63
232 0.58
233 0.53
234 0.53
235 0.49
236 0.46
237 0.41
238 0.41
239 0.35
240 0.34
241 0.34
242 0.31
243 0.32
244 0.27
245 0.28
246 0.25
247 0.25
248 0.27
249 0.23
250 0.22
251 0.18
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.21
257 0.23
258 0.23
259 0.21
260 0.18
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.07
281 0.12
282 0.19
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.35
287 0.43
288 0.49
289 0.47
290 0.49
291 0.48
292 0.53
293 0.53
294 0.49
295 0.46
296 0.39
297 0.37
298 0.3
299 0.27
300 0.23
301 0.22
302 0.17
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.05
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.12
325 0.21
326 0.28
327 0.28
328 0.33
329 0.36
330 0.35
331 0.36
332 0.38
333 0.32
334 0.29
335 0.3
336 0.24
337 0.21
338 0.21
339 0.19
340 0.17
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.2
348 0.25
349 0.28
350 0.3
351 0.29
352 0.28
353 0.3
354 0.3
355 0.33
356 0.32
357 0.37
358 0.36
359 0.4
360 0.37
361 0.34
362 0.38
363 0.38
364 0.32
365 0.27
366 0.31
367 0.31
368 0.38
369 0.42
370 0.38
371 0.33
372 0.34
373 0.33
374 0.28
375 0.25
376 0.21
377 0.16
378 0.15
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.07
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.17
409 0.19
410 0.19
411 0.21
412 0.21
413 0.2
414 0.22
415 0.25
416 0.24
417 0.32
418 0.35
419 0.38
420 0.41
421 0.4
422 0.38
423 0.35
424 0.3
425 0.2
426 0.17
427 0.13
428 0.09
429 0.08
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.1
442 0.09
443 0.07
444 0.08
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.13
450 0.18
451 0.18
452 0.19
453 0.16
454 0.17
455 0.17
456 0.13
457 0.12
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.07
473 0.07
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.15
494 0.17
495 0.21
496 0.22
497 0.25
498 0.27
499 0.26
500 0.27
501 0.23
502 0.23
503 0.22
504 0.23
505 0.21
506 0.21
507 0.21
508 0.2
509 0.19
510 0.14
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.1
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.17
521 0.18
522 0.21
523 0.21
524 0.25
525 0.26
526 0.25
527 0.25
528 0.19
529 0.18
530 0.16
531 0.24
532 0.2
533 0.24
534 0.29
535 0.29
536 0.29
537 0.28
538 0.26
539 0.18
540 0.17
541 0.12
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.03
548 0.03
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.03
554 0.03
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.04
560 0.05
561 0.07
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.13
566 0.14
567 0.15
568 0.16
569 0.17
570 0.21
571 0.25
572 0.29
573 0.29
574 0.29
575 0.32
576 0.33
577 0.3
578 0.28
579 0.24
580 0.19
581 0.19
582 0.18
583 0.13
584 0.12
585 0.12
586 0.11
587 0.12
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.13
594 0.14
595 0.13
596 0.19
597 0.25
598 0.29
599 0.29
600 0.29
601 0.28
602 0.29
603 0.29
604 0.27
605 0.21
606 0.17
607 0.16
608 0.16
609 0.16
610 0.14
611 0.15
612 0.13
613 0.16
614 0.19
615 0.21
616 0.25
617 0.33
618 0.35
619 0.36
620 0.37
621 0.41
622 0.39
623 0.42
624 0.39
625 0.33
626 0.3
627 0.27
628 0.23
629 0.14
630 0.13
631 0.08
632 0.1
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.09
639 0.09
640 0.07
641 0.06
642 0.09
643 0.13
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.2
649 0.27
650 0.3
651 0.28
652 0.32
653 0.36
654 0.38
655 0.39
656 0.38
657 0.32
658 0.33
659 0.34
660 0.34
661 0.3
662 0.27
663 0.25
664 0.23
665 0.21
666 0.14
667 0.11
668 0.08
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.08
675 0.09
676 0.11
677 0.12
678 0.15
679 0.15
680 0.13
681 0.14
682 0.14
683 0.17
684 0.17
685 0.21
686 0.22
687 0.22
688 0.24
689 0.24
690 0.26
691 0.28
692 0.32
693 0.29
694 0.28
695 0.29
696 0.26
697 0.27
698 0.3
699 0.28
700 0.24
701 0.24
702 0.23
703 0.27
704 0.28
705 0.27
706 0.22
707 0.19
708 0.18
709 0.19
710 0.18
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.12
715 0.13
716 0.12
717 0.1
718 0.1
719 0.11
720 0.1
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.16
729 0.15
730 0.16
731 0.16
732 0.16
733 0.16
734 0.16
735 0.16
736 0.12
737 0.1
738 0.11
739 0.17
740 0.17
741 0.17
742 0.17
743 0.17
744 0.18
745 0.19
746 0.26
747 0.23
748 0.26
749 0.31
750 0.41
751 0.42
752 0.43
753 0.48
754 0.46
755 0.52
756 0.49
757 0.48
758 0.41
759 0.4
760 0.43
761 0.39
762 0.34
763 0.26
764 0.29
765 0.3
766 0.35
767 0.37
768 0.32
769 0.31
770 0.3
771 0.28
772 0.26
773 0.23
774 0.22
775 0.23
776 0.23
777 0.23
778 0.24
779 0.24
780 0.25
781 0.26
782 0.23
783 0.18
784 0.21
785 0.24
786 0.24
787 0.27
788 0.27
789 0.24
790 0.22
791 0.23
792 0.21
793 0.21
794 0.19
795 0.17
796 0.17
797 0.17
798 0.17
799 0.17
800 0.16
801 0.16
802 0.17
803 0.17
804 0.16
805 0.18
806 0.28
807 0.35
808 0.42
809 0.48
810 0.55
811 0.61
812 0.69
813 0.74
814 0.72
815 0.74
816 0.73
817 0.73
818 0.69
819 0.68
820 0.69
821 0.65
822 0.66
823 0.62
824 0.57
825 0.52
826 0.55
827 0.55
828 0.54
829 0.59
830 0.55
831 0.51
832 0.54
833 0.55
834 0.52
835 0.5
836 0.44
837 0.39