FuNGI

B6QH89

Protein Details

Accession

B6QH89

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-26	VFCRNVPGQLKPRHLKRELRPILA	Hydrophilic
56-79	LLARYPRVQKGQRVPERQRLKIRG	Hydrophilic
102-121	EEVQRRSQPRRPIVNNNVDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	tmf:PMAA_093500 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MEVFCRNVPGQLKPRHLKRELRPILAELDIVSFECRVHATGHATITIADITKARLLLARYPRVQKGQRVPERQRLKIRGTVIFIEEGRNQPDPLLISSLLDEEVQRRSQPRRPIVNNNVDSGGPRKFPIFTLSCGTFDFRGTEPVFIDQFTLLGTGTIHFGSNKLTITLAHPEDGQKNFKIESEYWSIYDALYVSNQGCPTVTFGCNYAPRLFEAPVKSTQQATLAAFMRDRRMPPPREEKKTRIGFLNPSHKYVVSSCFVYRVTLINEHDFSSVLRLSHNQNMPELVKWRELRFPAGVSFTTQLIAFFKVLSMWNFPFAVQFQLQMLVSNGELPPEKVTTLFPYVNTLLARKRPLVAAKIIKGLPRRLHHPDPHADSADVSLDTIIDTLEKIEEMQALEYLQPGQPGYLHYNQMEIHRLSVTPTGLYLDGPNVEAENRVLRKYRNQSDQFIRVRFIEESGDPLMYDISSNLDPIFDRFREVLRDGVIIADRHYRFLGFSHSSLRSRSCWFMAEFHDSVTGEFITVNKLISKLGDFDHIKAPSKFAARLGQTFSDTLTSISVDKDMVKRIDDVERNGRVFSDGCGTISKEILWRIYRDYPRNAAVRPTVFQVRISGAKGMLSLDPTLKGPTICLRDSMIKFRAEADNNIEICGSGIHSLPCYLNAPLIKILEDLGVPRDLFLELQREEVESLRQTVRSPQHAAVFLDQAHISKSTRLSWLITLLQSMGVNYNQDGFLKRAVELVILMKLRDLKYKARILVPDGVTLYGIMDETGYLKEGEIFVPILNEETKRRDILVQDDVLITRSPAFHPGDVQLANAVNVPEDSPLRKLHNCVVFSQKGTRDLPSQLSGGDLDGDIFNIIYDPRFRLRRLAKPADYPRVPGTELGRPVQIDDIQDFFVTFMQQDQLGRIATTHKILADQQVKGTFDPNCLTLAQLHSTAVDFSKTGTPVDIKMIPRYPPYRPDFMAPGPRVRVAESIEVLDNGDEYIWNNDSESVIDDDDDVRPPMRYYKSRRVLGALYRMINERDFVNGLEWDSLNRQTQTKSVNVLASVWEYVERETAGFLWDHCVKDAHYIRDVYEDSIQDLMYQYSDAPWKSSLTEVEVFIGNIMGQNHKQTAYQKESSRAMRDAYDDLVKWTMSLITGRGTDDERESLERSIACLWIALEDTRQKKSSLLPNQKKLSSYGWIAAVACLHEIDKLQRNAPF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.76
3	0.8
4	0.81
5	0.81
6	0.84
7	0.81
8	0.79
9	0.72
10	0.64
11	0.6
12	0.5
13	0.41
14	0.3
15	0.24
16	0.17
17	0.15
18	0.14
19	0.1
20	0.09
21	0.1
22	0.11
23	0.1
24	0.12
25	0.15
26	0.19
27	0.22
28	0.24
29	0.23
30	0.23
31	0.21
32	0.21
33	0.19
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.15
42	0.18
43	0.25
44	0.34
45	0.41
46	0.45
47	0.51
48	0.57
49	0.63
50	0.66
51	0.67
52	0.68
53	0.71
54	0.75
55	0.79
56	0.81
57	0.82
58	0.84
59	0.84
60	0.83
61	0.79
62	0.75
63	0.71
64	0.69
65	0.64
66	0.59
67	0.54
68	0.46
69	0.42
70	0.37
71	0.34
72	0.32
73	0.3
74	0.3
75	0.29
76	0.27
77	0.23
78	0.25
79	0.23
80	0.22
81	0.22
82	0.18
83	0.16
84	0.17
85	0.18
86	0.15
87	0.14
88	0.13
89	0.11
90	0.16
91	0.17
92	0.2
93	0.25
94	0.31
95	0.38
96	0.48
97	0.55
98	0.61
99	0.67
100	0.75
101	0.79
102	0.83
103	0.78
104	0.71
105	0.63
106	0.52
107	0.46
108	0.39
109	0.33
110	0.23
111	0.22
112	0.21
113	0.2
114	0.21
115	0.27
116	0.26
117	0.25
118	0.3
119	0.31
120	0.31
121	0.31
122	0.32
123	0.25
124	0.23
125	0.23
126	0.18
127	0.23
128	0.23
129	0.23
130	0.22
131	0.24
132	0.24
133	0.21
134	0.21
135	0.14
136	0.13
137	0.11
138	0.11
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.06
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.11
149	0.14
150	0.14
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.16
155	0.23
156	0.21
157	0.2
158	0.2
159	0.24
160	0.29
161	0.32
162	0.33
163	0.28
164	0.29
165	0.29
166	0.29
167	0.31
168	0.27
169	0.28
170	0.31
171	0.31
172	0.29
173	0.3
174	0.28
175	0.23
176	0.22
177	0.17
178	0.1
179	0.09
180	0.11
181	0.1
182	0.12
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.15
188	0.17
189	0.17
190	0.15
191	0.16
192	0.22
193	0.25
194	0.28
195	0.26
196	0.23
197	0.24
198	0.27
199	0.27
200	0.27
201	0.27
202	0.27
203	0.3
204	0.33
205	0.32
206	0.3
207	0.3
208	0.27
209	0.27
210	0.24
211	0.24
212	0.22
213	0.22
214	0.22
215	0.23
216	0.25
217	0.25
218	0.27
219	0.29
220	0.36
221	0.4
222	0.47
223	0.56
224	0.62
225	0.68
226	0.74
227	0.72
228	0.73
229	0.76
230	0.71
231	0.65
232	0.6
233	0.58
234	0.59
235	0.64
236	0.56
237	0.51
238	0.5
239	0.44
240	0.42
241	0.36
242	0.32
243	0.24
244	0.25
245	0.22
246	0.23
247	0.23
248	0.22
249	0.2
250	0.19
251	0.19
252	0.22
253	0.24
254	0.25
255	0.26
256	0.26
257	0.25
258	0.22
259	0.19
260	0.18
261	0.17
262	0.13
263	0.13
264	0.14
265	0.18
266	0.26
267	0.3
268	0.27
269	0.27
270	0.3
271	0.3
272	0.3
273	0.3
274	0.25
275	0.27
276	0.29
277	0.31
278	0.34
279	0.34
280	0.35
281	0.33
282	0.32
283	0.27
284	0.27
285	0.25
286	0.21
287	0.21
288	0.17
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.11
293	0.12
294	0.1
295	0.09
296	0.08
297	0.09
298	0.11
299	0.12
300	0.15
301	0.14
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.18
308	0.13
309	0.13
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.12
314	0.12
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.19
329	0.19
330	0.17
331	0.2
332	0.21
333	0.23
334	0.22
335	0.2
336	0.2
337	0.24
338	0.26
339	0.23
340	0.24
341	0.25
342	0.29
343	0.3
344	0.33
345	0.35
346	0.34
347	0.38
348	0.38
349	0.38
350	0.38
351	0.41
352	0.4
353	0.37
354	0.42
355	0.45
356	0.52
357	0.54
358	0.56
359	0.57
360	0.57
361	0.58
362	0.53
363	0.45
364	0.37
365	0.32
366	0.26
367	0.19
368	0.12
369	0.08
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.03
375	0.03
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.1
395	0.15
396	0.17
397	0.19
398	0.18
399	0.2
400	0.21
401	0.23
402	0.25
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.16
407	0.15
408	0.17
409	0.15
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.12
425	0.13
426	0.14
427	0.17
428	0.18
429	0.27
430	0.36
431	0.43
432	0.47
433	0.5
434	0.55
435	0.59
436	0.66
437	0.63
438	0.55
439	0.48
440	0.39
441	0.37
442	0.31
443	0.26
444	0.19
445	0.13
446	0.15
447	0.14
448	0.14
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.07
453	0.07
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.09
462	0.13
463	0.1
464	0.12
465	0.13
466	0.14
467	0.17
468	0.18
469	0.18
470	0.15
471	0.15
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.1
476	0.1
477	0.16
478	0.15
479	0.16
480	0.16
481	0.15
482	0.14
483	0.15
484	0.2
485	0.15
486	0.16
487	0.2
488	0.22
489	0.24
490	0.25
491	0.26
492	0.23
493	0.23
494	0.24
495	0.2
496	0.2
497	0.19
498	0.21
499	0.22
500	0.25
501	0.22
502	0.21
503	0.21
504	0.19
505	0.18
506	0.16
507	0.12
508	0.07
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.14
522	0.14
523	0.16
524	0.21
525	0.22
526	0.25
527	0.24
528	0.24
529	0.21
530	0.22
531	0.21
532	0.18
533	0.22
534	0.2
535	0.22
536	0.23
537	0.21
538	0.2
539	0.2
540	0.18
541	0.13
542	0.12
543	0.1
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.08
551	0.09
552	0.12
553	0.12
554	0.13
555	0.13
556	0.15
557	0.2
558	0.21
559	0.23
560	0.27
561	0.29
562	0.29
563	0.28
564	0.26
565	0.21
566	0.19
567	0.17
568	0.13
569	0.1
570	0.1
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.08
577	0.09
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.16
582	0.23
583	0.28
584	0.3
585	0.33
586	0.33
587	0.35
588	0.37
589	0.34
590	0.29
591	0.27
592	0.24
593	0.21
594	0.21
595	0.2
596	0.18
597	0.18
598	0.16
599	0.15
600	0.15
601	0.15
602	0.13
603	0.11
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.12
618	0.15
619	0.15
620	0.15
621	0.16
622	0.22
623	0.23
624	0.28
625	0.27
626	0.23
627	0.23
628	0.24
629	0.28
630	0.23
631	0.23
632	0.23
633	0.25
634	0.24
635	0.24
636	0.22
637	0.17
638	0.15
639	0.14
640	0.09
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.09
649	0.08
650	0.1
651	0.1
652	0.11
653	0.11
654	0.12
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.07
662	0.08
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.08
669	0.11
670	0.1
671	0.12
672	0.12
673	0.12
674	0.12
675	0.12
676	0.13
677	0.09
678	0.11
679	0.11
680	0.12
681	0.12
682	0.18
683	0.22
684	0.25
685	0.28
686	0.27
687	0.29
688	0.31
689	0.32
690	0.26
691	0.23
692	0.19
693	0.17
694	0.15
695	0.12
696	0.1
697	0.11
698	0.1
699	0.1
700	0.12
701	0.13
702	0.15
703	0.15
704	0.16
705	0.15
706	0.18
707	0.17
708	0.16
709	0.14
710	0.12
711	0.12
712	0.1
713	0.1
714	0.08
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.07
720	0.08
721	0.09
722	0.09
723	0.11
724	0.11
725	0.11
726	0.12
727	0.12
728	0.11
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.11
733	0.1
734	0.1
735	0.14
736	0.14
737	0.19
738	0.21
739	0.22
740	0.29
741	0.34
742	0.36
743	0.36
744	0.37
745	0.35
746	0.4
747	0.35
748	0.3
749	0.25
750	0.23
751	0.19
752	0.18
753	0.14
754	0.07
755	0.06
756	0.04
757	0.03
758	0.03
759	0.04
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.06
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.06
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.08
774	0.09
775	0.11
776	0.15
777	0.17
778	0.17
779	0.18
780	0.19
781	0.2
782	0.24
783	0.26
784	0.22
785	0.21
786	0.21
787	0.2
788	0.19
789	0.17
790	0.12
791	0.08
792	0.09
793	0.08
794	0.13
795	0.15
796	0.14
797	0.15
798	0.16
799	0.19
800	0.18
801	0.18
802	0.14
803	0.13
804	0.12
805	0.12
806	0.11
807	0.07
808	0.07
809	0.07
810	0.07
811	0.08
812	0.09
813	0.11
814	0.14
815	0.19
816	0.2
817	0.23
818	0.28
819	0.34
820	0.34
821	0.34
822	0.39
823	0.36
824	0.36
825	0.4
826	0.35
827	0.34
828	0.34
829	0.34
830	0.29
831	0.29
832	0.31
833	0.27
834	0.25
835	0.19
836	0.19
837	0.16
838	0.13
839	0.11
840	0.08
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.05
845	0.05
846	0.04
847	0.04
848	0.05
849	0.05
850	0.07
851	0.09
852	0.15
853	0.18
854	0.19
855	0.28
856	0.36
857	0.44
858	0.52
859	0.59
860	0.57
861	0.63
862	0.71
863	0.71
864	0.64
865	0.58
866	0.51
867	0.45
868	0.42
869	0.35
870	0.3
871	0.27
872	0.29
873	0.27
874	0.26
875	0.23
876	0.23
877	0.23
878	0.21
879	0.16
880	0.15
881	0.15
882	0.14
883	0.14
884	0.13
885	0.11
886	0.1
887	0.09
888	0.07
889	0.07
890	0.07
891	0.08
892	0.08
893	0.09
894	0.11
895	0.11
896	0.11
897	0.1
898	0.12
899	0.13
900	0.14
901	0.14
902	0.12
903	0.14
904	0.15
905	0.23
906	0.26
907	0.25
908	0.26
909	0.29
910	0.3
911	0.28
912	0.31
913	0.23
914	0.21
915	0.21
916	0.19
917	0.17
918	0.16
919	0.16
920	0.15
921	0.16
922	0.15
923	0.14
924	0.14
925	0.13
926	0.13
927	0.13
928	0.12
929	0.1
930	0.08
931	0.09
932	0.13
933	0.14
934	0.13
935	0.14
936	0.15
937	0.16
938	0.2
939	0.23
940	0.21
941	0.26
942	0.29
943	0.3
944	0.35
945	0.38
946	0.38
947	0.42
948	0.46
949	0.46
950	0.44
951	0.45
952	0.43
953	0.45
954	0.51
955	0.44
956	0.44
957	0.41
958	0.42
959	0.38
960	0.35
961	0.32
962	0.25
963	0.27
964	0.22
965	0.22
966	0.2
967	0.2
968	0.18
969	0.15
970	0.12
971	0.08
972	0.07
973	0.05
974	0.06
975	0.09
976	0.1
977	0.1
978	0.1
979	0.11
980	0.11
981	0.12
982	0.13
983	0.11
984	0.1
985	0.1
986	0.11
987	0.11
988	0.12
989	0.14
990	0.13
991	0.12
992	0.12
993	0.13
994	0.2
995	0.26
996	0.34
997	0.41
998	0.51
999	0.6
1000	0.64
1001	0.64
1002	0.62
1003	0.6
1004	0.58
1005	0.58
1006	0.52
1007	0.44
1008	0.41
1009	0.42
1010	0.39
1011	0.34
1012	0.28
1013	0.19
1014	0.17
1015	0.16
1016	0.15
1017	0.15
1018	0.14
1019	0.15
1020	0.16
1021	0.16
1022	0.14
1023	0.16
1024	0.19
1025	0.21
1026	0.22
1027	0.23
1028	0.23
1029	0.28
1030	0.3
1031	0.3
1032	0.31
1033	0.3
1034	0.3
1035	0.28
1036	0.27
1037	0.24
1038	0.22
1039	0.19
1040	0.15
1041	0.13
1042	0.12
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.12
1046	0.1
1047	0.1
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.14
1053	0.18
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.21
1057	0.2
1058	0.29
1059	0.35
1060	0.34
1061	0.34
1062	0.34
1063	0.34
1064	0.38
1065	0.38
1066	0.31
1067	0.29
1068	0.25
1069	0.22
1070	0.22
1071	0.21
1072	0.16
1073	0.16
1074	0.14
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.08
1078	0.1
1079	0.15
1080	0.15
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.18
1084	0.19
1085	0.22
1086	0.21
1087	0.22
1088	0.24
1089	0.22
1090	0.23
1091	0.22
1092	0.21
1093	0.18
1094	0.16
1095	0.11
1096	0.1
1097	0.11
1098	0.13
1099	0.14
1100	0.18
1101	0.2
1102	0.21
1103	0.24
1104	0.28
1105	0.36
1106	0.4
1107	0.46
1108	0.47
1109	0.51
1110	0.58
1111	0.6
1112	0.59
1113	0.53
1114	0.47
1115	0.42
1116	0.41
1117	0.36
1118	0.33
1119	0.31
1120	0.26
1121	0.26
1122	0.26
1123	0.23
1124	0.2
1125	0.18
1126	0.15
1127	0.12
1128	0.13
1129	0.12
1130	0.13
1131	0.15
1132	0.16
1133	0.17
1134	0.19
1135	0.2
1136	0.21
1137	0.22
1138	0.22
1139	0.24
1140	0.25
1141	0.24
1142	0.26
1143	0.24
1144	0.22
1145	0.22
1146	0.2
1147	0.17
1148	0.16
1149	0.14
1150	0.12
1151	0.14
1152	0.13
1153	0.16
1154	0.23
1155	0.28
1156	0.32
1157	0.34
1158	0.33
1159	0.34
1160	0.42
1161	0.47
1162	0.5
1163	0.57
1164	0.62
1165	0.7
1166	0.77
1167	0.78
1168	0.71
1169	0.65
1170	0.58
1171	0.53
1172	0.46
1173	0.4
1174	0.34
1175	0.32
1176	0.31
1177	0.28
1178	0.24
1179	0.19
1180	0.16
1181	0.12
1182	0.11
1183	0.11
1184	0.12
1185	0.18
1186	0.26
1187	0.29

B6QH89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer