FuNGI

B6QJ31

Protein Details

Accession

B6QJ31

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
138-181	YVNPEKRTTDWKPNPKIQQRFVELEKQKNPKARKLRWVKEQLNI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-177	KNPKARKLRWVKE
182-184	KAK

Subcellular Location(s)

mito_nucl 11.166, nucl 11, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	tmf:PMAA_090390 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MPKRGIKPKDLSQKWRDLIMDMRLCGFRGVSEEQLTRDFIAASEHVIPKFHDIWSNRMLEFDLDLETSGLIQAPTVDRIIEVFDTWAENAPKPQQASNRDMAMASLAGKSDQQGNESNDARPIKCLDGKEHGFEECLYVNPEKRTTDWKPNPKIQQRFVELEKQKNPKARKLRWVKEQLNIKAKEQKKAAGSESSNEKGDEEERANSAWDDNPYCGVAIDTSMSATEQSKDFKNSFILDTGSSAHVTNNIDNLRNMGTEERWLLVGNSRVKMVGPGTMNLFPTEPVNDIIKKKGILLKKVWYVKGMHTNLISVSLLQRNGILYDAKNRRLWSERTEADLCNVEWDGSLYFVKWNAKPSSNPPLRNELAFSSFEKTTLKDSALAWHKRYGHVSLKAIKKLEDAIEGAIVTTSELHGKNEDDLQEKCEICAMNDNKRQVSRVPIPKPNRAFHTLFVDIIVMTQAITREQYALHTVCPFAKFHALATVDSKAVVADMKAIIEKIEHTFRTHVEVVHTDGESSLNGLAFRTWCNGRHTLLYVTVPDTPEQNGPSERAGGLITKRARHKIQEANIPFVLWPYAMKASIHTINRTPTKALNWKTLYEIAYGKKPYVGNLFVFGAKAYVRIKNKKSQKMAARAQIGYLVGYEAHNIWQIWVDHPKGFRVIRARDVIFDETKRYDPKHPFAREIIKNGVPIYIDNADWGNLEDTNDDVIYGSVDENIHLQPFVSRFSPISGGNTQNMDQPMAEKPESIEIEQQPPKYSQEMEIDAEEQEYEAQKEQESAVYEDILVDQEDIESTGGVEVNIEEEEEEAEPGDEYEDKDIEEGDIPIRSRSTDIPQRQLPRISTPTNQKAPFDPDDVKNSLPTPPEELSPLTNVLRRQEGLPGNPEKINTSPTNENILTTPRVRIALKGAHSPESLLSTTKRQRKEARALFARQKLLQDSTLAYTFLAAQEKKPGIDAFICASDASFGDNDDRTSSEGYLVMLYGGPIDWRATKQRLVTTSTTEAELRAITEAAKRLHVWKRVFKSIGYTPDRELCIQCDNKQTILLLTAEDPQFRTNLKHVDIYHHWLRQEIRCNRLRVEWVGTKEMIADGFTKILHGQAYLDWRQHQGLVDITTLIHE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.72
3	0.63
4	0.55
5	0.52
6	0.52
7	0.48
8	0.38
9	0.4
10	0.35
11	0.35
12	0.32
13	0.26
14	0.17
15	0.18
16	0.2
17	0.21
18	0.26
19	0.27
20	0.28
21	0.3
22	0.31
23	0.27
24	0.24
25	0.2
26	0.15
27	0.17
28	0.15
29	0.16
30	0.21
31	0.24
32	0.23
33	0.24
34	0.25
35	0.27
36	0.29
37	0.28
38	0.29
39	0.28
40	0.34
41	0.39
42	0.42
43	0.36
44	0.35
45	0.34
46	0.27
47	0.26
48	0.2
49	0.15
50	0.12
51	0.12
52	0.11
53	0.1
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.06
58	0.06
59	0.08
60	0.09
61	0.11
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.14
67	0.12
68	0.11
69	0.1
70	0.1
71	0.12
72	0.13
73	0.18
74	0.18
75	0.19
76	0.23
77	0.26
78	0.3
79	0.31
80	0.36
81	0.38
82	0.43
83	0.48
84	0.49
85	0.47
86	0.43
87	0.4
88	0.35
89	0.28
90	0.22
91	0.17
92	0.12
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.17
98	0.17
99	0.19
100	0.25
101	0.28
102	0.35
103	0.36
104	0.36
105	0.36
106	0.39
107	0.36
108	0.33
109	0.32
110	0.31
111	0.34
112	0.36
113	0.34
114	0.4
115	0.43
116	0.44
117	0.43
118	0.38
119	0.34
120	0.31
121	0.28
122	0.2
123	0.18
124	0.17
125	0.19
126	0.23
127	0.25
128	0.29
129	0.28
130	0.3
131	0.37
132	0.41
133	0.49
134	0.55
135	0.62
136	0.67
137	0.74
138	0.82
139	0.83
140	0.85
141	0.81
142	0.8
143	0.75
144	0.72
145	0.67
146	0.67
147	0.63
148	0.63
149	0.64
150	0.63
151	0.62
152	0.65
153	0.67
154	0.67
155	0.72
156	0.71
157	0.73
158	0.77
159	0.8
160	0.82
161	0.87
162	0.81
163	0.78
164	0.8
165	0.78
166	0.77
167	0.7
168	0.64
169	0.63
170	0.62
171	0.62
172	0.55
173	0.51
174	0.46
175	0.49
176	0.48
177	0.46
178	0.44
179	0.41
180	0.45
181	0.43
182	0.39
183	0.34
184	0.31
185	0.25
186	0.25
187	0.24
188	0.19
189	0.19
190	0.19
191	0.19
192	0.2
193	0.18
194	0.19
195	0.17
196	0.18
197	0.18
198	0.18
199	0.18
200	0.18
201	0.17
202	0.16
203	0.13
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.14
216	0.17
217	0.22
218	0.22
219	0.23
220	0.26
221	0.26
222	0.26
223	0.24
224	0.22
225	0.18
226	0.18
227	0.18
228	0.16
229	0.15
230	0.13
231	0.12
232	0.14
233	0.16
234	0.15
235	0.19
236	0.2
237	0.2
238	0.2
239	0.22
240	0.19
241	0.18
242	0.18
243	0.15
244	0.13
245	0.14
246	0.15
247	0.14
248	0.13
249	0.13
250	0.13
251	0.14
252	0.2
253	0.22
254	0.22
255	0.22
256	0.22
257	0.21
258	0.23
259	0.2
260	0.18
261	0.15
262	0.15
263	0.18
264	0.2
265	0.21
266	0.19
267	0.19
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.12
272	0.12
273	0.15
274	0.19
275	0.2
276	0.23
277	0.24
278	0.23
279	0.25
280	0.29
281	0.32
282	0.34
283	0.37
284	0.41
285	0.46
286	0.52
287	0.49
288	0.46
289	0.43
290	0.42
291	0.47
292	0.42
293	0.37
294	0.31
295	0.31
296	0.28
297	0.27
298	0.22
299	0.12
300	0.13
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.12
309	0.09
310	0.19
311	0.25
312	0.29
313	0.32
314	0.32
315	0.35
316	0.39
317	0.42
318	0.38
319	0.4
320	0.38
321	0.41
322	0.43
323	0.39
324	0.35
325	0.34
326	0.28
327	0.21
328	0.2
329	0.13
330	0.11
331	0.11
332	0.09
333	0.08
334	0.09
335	0.07
336	0.08
337	0.11
338	0.15
339	0.16
340	0.22
341	0.24
342	0.27
343	0.3
344	0.35
345	0.43
346	0.46
347	0.49
348	0.46
349	0.5
350	0.48
351	0.46
352	0.42
353	0.33
354	0.29
355	0.26
356	0.24
357	0.2
358	0.19
359	0.19
360	0.18
361	0.17
362	0.17
363	0.17
364	0.17
365	0.15
366	0.15
367	0.23
368	0.31
369	0.34
370	0.32
371	0.36
372	0.36
373	0.37
374	0.39
375	0.37
376	0.35
377	0.36
378	0.39
379	0.41
380	0.45
381	0.47
382	0.45
383	0.4
384	0.34
385	0.31
386	0.27
387	0.22
388	0.17
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.11
393	0.08
394	0.07
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.07
399	0.08
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.12
404	0.14
405	0.16
406	0.15
407	0.15
408	0.17
409	0.2
410	0.2
411	0.19
412	0.19
413	0.17
414	0.14
415	0.23
416	0.24
417	0.29
418	0.33
419	0.36
420	0.35
421	0.36
422	0.37
423	0.3
424	0.34
425	0.34
426	0.39
427	0.43
428	0.5
429	0.54
430	0.61
431	0.65
432	0.61
433	0.57
434	0.54
435	0.49
436	0.42
437	0.43
438	0.36
439	0.3
440	0.27
441	0.22
442	0.15
443	0.14
444	0.11
445	0.05
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.12
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.11
464	0.14
465	0.13
466	0.12
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.18
471	0.18
472	0.14
473	0.14
474	0.14
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.08
488	0.11
489	0.12
490	0.13
491	0.14
492	0.15
493	0.2
494	0.2
495	0.18
496	0.16
497	0.17
498	0.18
499	0.18
500	0.17
501	0.12
502	0.11
503	0.11
504	0.09
505	0.08
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.09
514	0.1
515	0.12
516	0.17
517	0.19
518	0.2
519	0.2
520	0.22
521	0.2
522	0.2
523	0.18
524	0.14
525	0.13
526	0.14
527	0.13
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.12
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.12
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.14
544	0.15
545	0.19
546	0.22
547	0.26
548	0.28
549	0.29
550	0.36
551	0.37
552	0.4
553	0.45
554	0.44
555	0.43
556	0.41
557	0.38
558	0.31
559	0.24
560	0.19
561	0.1
562	0.08
563	0.06
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.11
569	0.16
570	0.17
571	0.17
572	0.18
573	0.22
574	0.25
575	0.25
576	0.24
577	0.2
578	0.25
579	0.31
580	0.32
581	0.35
582	0.34
583	0.34
584	0.35
585	0.36
586	0.31
587	0.25
588	0.26
589	0.19
590	0.21
591	0.21
592	0.19
593	0.2
594	0.19
595	0.19
596	0.2
597	0.2
598	0.16
599	0.17
600	0.18
601	0.15
602	0.15
603	0.13
604	0.1
605	0.07
606	0.1
607	0.1
608	0.14
609	0.21
610	0.28
611	0.33
612	0.41
613	0.5
614	0.56
615	0.6
616	0.62
617	0.64
618	0.66
619	0.68
620	0.66
621	0.61
622	0.52
623	0.47
624	0.4
625	0.32
626	0.23
627	0.17
628	0.1
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.09
638	0.1
639	0.11
640	0.15
641	0.16
642	0.17
643	0.18
644	0.19
645	0.21
646	0.2
647	0.22
648	0.25
649	0.27
650	0.3
651	0.34
652	0.33
653	0.3
654	0.33
655	0.32
656	0.27
657	0.25
658	0.23
659	0.2
660	0.22
661	0.24
662	0.24
663	0.28
664	0.32
665	0.4
666	0.47
667	0.47
668	0.48
669	0.5
670	0.56
671	0.51
672	0.49
673	0.46
674	0.38
675	0.36
676	0.33
677	0.29
678	0.2
679	0.17
680	0.16
681	0.12
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.08
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.07
708	0.07
709	0.08
710	0.09
711	0.11
712	0.1
713	0.11
714	0.11
715	0.13
716	0.15
717	0.14
718	0.17
719	0.19
720	0.2
721	0.21
722	0.22
723	0.21
724	0.22
725	0.22
726	0.18
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.18
731	0.17
732	0.14
733	0.14
734	0.19
735	0.21
736	0.2
737	0.23
738	0.2
739	0.28
740	0.31
741	0.32
742	0.28
743	0.29
744	0.3
745	0.26
746	0.25
747	0.21
748	0.22
749	0.24
750	0.23
751	0.22
752	0.21
753	0.19
754	0.18
755	0.14
756	0.1
757	0.08
758	0.07
759	0.08
760	0.08
761	0.09
762	0.09
763	0.1
764	0.1
765	0.12
766	0.13
767	0.14
768	0.13
769	0.12
770	0.12
771	0.11
772	0.11
773	0.09
774	0.07
775	0.06
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.04
782	0.04
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.04
788	0.05
789	0.05
790	0.05
791	0.04
792	0.04
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.08
804	0.08
805	0.08
806	0.08
807	0.09
808	0.08
809	0.09
810	0.09
811	0.08
812	0.1
813	0.11
814	0.12
815	0.12
816	0.12
817	0.13
818	0.15
819	0.22
820	0.29
821	0.34
822	0.4
823	0.46
824	0.51
825	0.54
826	0.56
827	0.5
828	0.48
829	0.48
830	0.45
831	0.45
832	0.49
833	0.53
834	0.57
835	0.56
836	0.5
837	0.48
838	0.51
839	0.48
840	0.43
841	0.39
842	0.34
843	0.38
844	0.39
845	0.36
846	0.31
847	0.29
848	0.27
849	0.25
850	0.23
851	0.22
852	0.21
853	0.21
854	0.22
855	0.22
856	0.21
857	0.2
858	0.22
859	0.18
860	0.2
861	0.21
862	0.22
863	0.24
864	0.23
865	0.22
866	0.27
867	0.29
868	0.29
869	0.35
870	0.36
871	0.35
872	0.36
873	0.35
874	0.3
875	0.28
876	0.3
877	0.25
878	0.27
879	0.28
880	0.29
881	0.36
882	0.33
883	0.32
884	0.28
885	0.3
886	0.28
887	0.25
888	0.25
889	0.2
890	0.23
891	0.22
892	0.23
893	0.25
894	0.27
895	0.29
896	0.34
897	0.34
898	0.34
899	0.34
900	0.33
901	0.28
902	0.25
903	0.23
904	0.19
905	0.19
906	0.24
907	0.33
908	0.4
909	0.44
910	0.49
911	0.57
912	0.65
913	0.73
914	0.73
915	0.75
916	0.74
917	0.77
918	0.77
919	0.75
920	0.7
921	0.61
922	0.56
923	0.49
924	0.45
925	0.38
926	0.31
927	0.27
928	0.25
929	0.24
930	0.21
931	0.17
932	0.14
933	0.14
934	0.14
935	0.19
936	0.16
937	0.16
938	0.24
939	0.25
940	0.25
941	0.27
942	0.25
943	0.21
944	0.22
945	0.23
946	0.18
947	0.18
948	0.18
949	0.15
950	0.15
951	0.13
952	0.11
953	0.11
954	0.09
955	0.08
956	0.11
957	0.12
958	0.13
959	0.14
960	0.15
961	0.14
962	0.16
963	0.16
964	0.14
965	0.14
966	0.13
967	0.12
968	0.11
969	0.1
970	0.08
971	0.07
972	0.06
973	0.06
974	0.05
975	0.06
976	0.08
977	0.09
978	0.13
979	0.2
980	0.24
981	0.29
982	0.33
983	0.39
984	0.41
985	0.45
986	0.44
987	0.43
988	0.44
989	0.41
990	0.38
991	0.32
992	0.29
993	0.24
994	0.21
995	0.16
996	0.12
997	0.11
998	0.1
999	0.14
1000	0.19
1001	0.19
1002	0.22
1003	0.22
1004	0.29
1005	0.37
1006	0.44
1007	0.48
1008	0.52
1009	0.58
1010	0.65
1011	0.65
1012	0.58
1013	0.57
1014	0.56
1015	0.59
1016	0.55
1017	0.51
1018	0.45
1019	0.49
1020	0.51
1021	0.46
1022	0.4
1023	0.33
1024	0.37
1025	0.39
1026	0.4
1027	0.43
1028	0.43
1029	0.41
1030	0.41
1031	0.39
1032	0.3
1033	0.28
1034	0.24
1035	0.16
1036	0.15
1037	0.2
1038	0.2
1039	0.2
1040	0.21
1041	0.19
1042	0.21
1043	0.21
1044	0.24
1045	0.24
1046	0.3
1047	0.31
1048	0.36
1049	0.37
1050	0.43
1051	0.46
1052	0.5
1053	0.51
1054	0.48
1055	0.45
1056	0.44
1057	0.48
1058	0.47
1059	0.53
1060	0.53
1061	0.54
1062	0.58
1063	0.61
1064	0.6
1065	0.6
1066	0.58
1067	0.52
1068	0.53
1069	0.52
1070	0.49
1071	0.5
1072	0.47
1073	0.41
1074	0.36
1075	0.32
1076	0.24
1077	0.18
1078	0.15
1079	0.11
1080	0.12
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.11
1084	0.13
1085	0.12
1086	0.11
1087	0.12
1088	0.14
1089	0.22
1090	0.25
1091	0.29
1092	0.29
1093	0.31
1094	0.33
1095	0.34
1096	0.31
1097	0.27
1098	0.27
1099	0.25
1100	0.23
1101	0.21

B6QJ31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer