Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QHT2

Protein Details
Accession B6QHT2    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
430-452NDYRQRSPPGRRRRSPSPPQKDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-409RRRSGSPGWDRRREVSPPRRR
422-447PSRRGGRRNDYRQRSPPGRRRRSPSP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmf:PMAA_095320  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
CDD cd16984  CID_Nrd1_like  
Amino Acid Sequences MSSAVAELDGYLQSMQSLKPPGVSGSKIGSITQLCVANVQSESVLVQKLYTHFKRTPGTHKLGVLYVVDSVTRQWVEAARKAGQPLGSAAPDGTFAAGVNRVTELLPVLMADIINNAPEDQKEKIRKLVDIWERGQTFPLPMLATIKEKLNALPTKNIESTTPEGSPAPGANPLAGLQGAAAGASATPDTSSILKALADMAKQNPSAAAAPGALAQANPLSMLSAQSATPLLSASTSVDQAAQATTGPNVNPYGNPLAALGNFAPNAMPNTMPGAQPNPLAALLPQAAAGAQQPTAPTPDVFQQVQLLQLLAAQGIPQDQWATALQILSLSNNANPAAVAGLPNMGAAPGAYNMPDMSGQQGWGGLDRDGDRDRGRDRNFMRSPPSQYRRRSGSPGWDRRREVSPPRRRESPVYGEYGGDSPSRRGGRRNDYRQRSPPGRRRRSPSPPQKDVSLPPPGPKLVEWDYSIGQGNIKVLSRTLFVGGVTAPESHLRALFNQYGVVQTCIVNVDKRHAFIKMINRRDAMNAREGMETYKSGDMQLRTRWGVGFGPRDCSDYQTGISVIPIERLTEADRKWMLTAEYGGTGGKPIESGMVVEEPDIEIGAGVSSKAISRRMATDQGGKRGPQSSRTQNDRYQRRDRGMDVNGGGMYGGSGDQDYSNPPNPGVPPAVPGFGFQLPGMPMFPPGFMLGGAQPGSAPPPPPPGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.14
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.2
8 0.23
9 0.27
10 0.28
11 0.26
12 0.27
13 0.3
14 0.29
15 0.28
16 0.29
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.25
21 0.21
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.18
27 0.13
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.1
33 0.1
34 0.13
35 0.17
36 0.26
37 0.3
38 0.35
39 0.36
40 0.44
41 0.51
42 0.54
43 0.6
44 0.6
45 0.63
46 0.61
47 0.6
48 0.56
49 0.49
50 0.45
51 0.36
52 0.27
53 0.21
54 0.16
55 0.14
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.19
63 0.24
64 0.29
65 0.33
66 0.32
67 0.35
68 0.36
69 0.37
70 0.33
71 0.28
72 0.26
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.07
82 0.06
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.12
107 0.14
108 0.23
109 0.3
110 0.33
111 0.4
112 0.41
113 0.42
114 0.43
115 0.49
116 0.49
117 0.48
118 0.47
119 0.48
120 0.46
121 0.45
122 0.43
123 0.34
124 0.27
125 0.21
126 0.21
127 0.14
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.25
138 0.28
139 0.28
140 0.33
141 0.34
142 0.38
143 0.38
144 0.38
145 0.3
146 0.31
147 0.31
148 0.28
149 0.26
150 0.21
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.16
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.13
195 0.12
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.12
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.13
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.1
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.18
361 0.24
362 0.26
363 0.31
364 0.32
365 0.4
366 0.42
367 0.43
368 0.46
369 0.42
370 0.47
371 0.49
372 0.55
373 0.53
374 0.54
375 0.57
376 0.58
377 0.57
378 0.56
379 0.49
380 0.52
381 0.54
382 0.61
383 0.62
384 0.63
385 0.61
386 0.58
387 0.6
388 0.55
389 0.55
390 0.55
391 0.58
392 0.6
393 0.63
394 0.65
395 0.64
396 0.63
397 0.6
398 0.57
399 0.5
400 0.45
401 0.41
402 0.36
403 0.34
404 0.29
405 0.23
406 0.16
407 0.13
408 0.1
409 0.15
410 0.18
411 0.18
412 0.24
413 0.3
414 0.4
415 0.5
416 0.6
417 0.64
418 0.69
419 0.76
420 0.78
421 0.78
422 0.77
423 0.77
424 0.76
425 0.77
426 0.79
427 0.78
428 0.79
429 0.8
430 0.81
431 0.82
432 0.83
433 0.82
434 0.79
435 0.74
436 0.69
437 0.63
438 0.56
439 0.5
440 0.47
441 0.38
442 0.34
443 0.34
444 0.32
445 0.29
446 0.26
447 0.26
448 0.21
449 0.23
450 0.22
451 0.21
452 0.21
453 0.22
454 0.23
455 0.17
456 0.14
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.15
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.16
487 0.17
488 0.16
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.18
497 0.19
498 0.21
499 0.21
500 0.21
501 0.22
502 0.24
503 0.34
504 0.37
505 0.42
506 0.44
507 0.44
508 0.44
509 0.47
510 0.47
511 0.4
512 0.36
513 0.32
514 0.3
515 0.3
516 0.29
517 0.26
518 0.23
519 0.2
520 0.16
521 0.16
522 0.14
523 0.15
524 0.19
525 0.2
526 0.22
527 0.26
528 0.28
529 0.27
530 0.28
531 0.27
532 0.25
533 0.25
534 0.27
535 0.3
536 0.26
537 0.32
538 0.31
539 0.34
540 0.32
541 0.33
542 0.3
543 0.24
544 0.24
545 0.19
546 0.19
547 0.16
548 0.16
549 0.14
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.11
554 0.1
555 0.12
556 0.15
557 0.19
558 0.19
559 0.24
560 0.25
561 0.25
562 0.25
563 0.26
564 0.23
565 0.19
566 0.21
567 0.15
568 0.15
569 0.14
570 0.13
571 0.11
572 0.11
573 0.1
574 0.08
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.06
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.07
597 0.09
598 0.12
599 0.14
600 0.17
601 0.21
602 0.26
603 0.32
604 0.33
605 0.4
606 0.43
607 0.49
608 0.5
609 0.47
610 0.45
611 0.46
612 0.45
613 0.43
614 0.46
615 0.48
616 0.54
617 0.61
618 0.65
619 0.65
620 0.73
621 0.76
622 0.75
623 0.75
624 0.74
625 0.74
626 0.73
627 0.7
628 0.68
629 0.63
630 0.61
631 0.51
632 0.45
633 0.38
634 0.32
635 0.27
636 0.18
637 0.13
638 0.07
639 0.06
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.06
644 0.07
645 0.12
646 0.17
647 0.22
648 0.23
649 0.23
650 0.26
651 0.27
652 0.31
653 0.31
654 0.26
655 0.25
656 0.26
657 0.28
658 0.24
659 0.24
660 0.23
661 0.2
662 0.21
663 0.16
664 0.18
665 0.17
666 0.18
667 0.17
668 0.14
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.13
673 0.13
674 0.13
675 0.12
676 0.13
677 0.11
678 0.14
679 0.14
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.15
684 0.16
685 0.17
686 0.16