Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q6D8

Protein Details
Accession B6Q6D8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-71GAASTKSGKSHHKRRKSRSLLGRFKDVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-62SGKSHHKRRKSRS
Subcellular Location(s) plas 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
KEGG tmf:PMAA_034150  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MPTTRRRKSSLGADIRGDTSAPAMSTMDINKSAPLSDITEQPQGAASTKSGKSHHKRRKSRSLLGRFKDVALKHTWLIPSLILAVLLSGYAINPSESNPLHSALFLSYPREPKYPGEPVMYGKGKKDFAFVAFYTVVLSFTREFLMQRVIRPWALYCNIRGKGKIARFMEQVYTAMYFAVFGPFGLWVMSRTNIWYFNTTAMFEGFPHREHTAEFKAYYLLQAAYWFQQAIVLLLQLEKPRKDFKELVGHHIITLALIFLSYRFHFTYMGIAVYITHDISDFFLATSKTLNYLDSPIIGPYFGLFVTVWIYLRHYINLKILWAVLTEFRTVGPFELNWETQQYKCWISQYITFALLASLQAVNLFWLYLILRILKKYLMDDVAQDERSEDEEEEGEEEEEEEEEEVSVSKAAAGEINEAEGVSSQVAVNGTSTDGRKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.56
3 0.48
4 0.38
5 0.27
6 0.19
7 0.16
8 0.12
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.23
25 0.25
26 0.29
27 0.28
28 0.27
29 0.27
30 0.23
31 0.23
32 0.19
33 0.17
34 0.21
35 0.23
36 0.28
37 0.3
38 0.4
39 0.48
40 0.58
41 0.67
42 0.71
43 0.79
44 0.85
45 0.92
46 0.91
47 0.91
48 0.91
49 0.91
50 0.9
51 0.84
52 0.82
53 0.72
54 0.65
55 0.61
56 0.5
57 0.43
58 0.38
59 0.36
60 0.28
61 0.31
62 0.3
63 0.24
64 0.25
65 0.2
66 0.16
67 0.14
68 0.13
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.13
83 0.13
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.14
91 0.17
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.23
96 0.26
97 0.27
98 0.28
99 0.28
100 0.35
101 0.38
102 0.37
103 0.36
104 0.35
105 0.35
106 0.41
107 0.43
108 0.37
109 0.33
110 0.34
111 0.33
112 0.32
113 0.32
114 0.26
115 0.23
116 0.26
117 0.24
118 0.23
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.1
125 0.12
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.18
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.23
140 0.19
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.27
145 0.31
146 0.31
147 0.31
148 0.29
149 0.33
150 0.35
151 0.4
152 0.34
153 0.34
154 0.34
155 0.35
156 0.33
157 0.27
158 0.23
159 0.16
160 0.15
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.1
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.14
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.12
207 0.08
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.09
224 0.12
225 0.12
226 0.14
227 0.2
228 0.21
229 0.27
230 0.28
231 0.3
232 0.38
233 0.39
234 0.43
235 0.42
236 0.4
237 0.34
238 0.32
239 0.27
240 0.16
241 0.15
242 0.08
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.05
248 0.05
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.08
287 0.06
288 0.07
289 0.05
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.08
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.2
304 0.21
305 0.19
306 0.17
307 0.16
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.13
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.21
326 0.22
327 0.2
328 0.25
329 0.24
330 0.22
331 0.23
332 0.25
333 0.25
334 0.25
335 0.3
336 0.3
337 0.29
338 0.27
339 0.26
340 0.23
341 0.2
342 0.18
343 0.12
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.22
365 0.2
366 0.19
367 0.2
368 0.24
369 0.27
370 0.27
371 0.25
372 0.21
373 0.19
374 0.21
375 0.21
376 0.17
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.13
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.1
400 0.1
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.14
419 0.17