FuNGI

B6QA38

Protein Details

Accession

B6QA38

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
74-97	IETPEQRKLRKARGQPPPQRNSLN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 7, cyto_mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	tmf:PMAA_072800 -
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MALAPTDTKWTVGFDTLRRENLFKNPPKDKSAYPMLQAAIRPHIDSFNALFGESKIMEEALKDMGAKTFLDGDIETPEQRKLRKARGQPPPQRNSLNLRITEIFLDKAVLPPTNKFVPRQASASADYRNIYPAECRERHATYRGRLRARLQYQVNNGEWRESVRELGQVPLMLRSNRCHLESFSPQELVDHKEESEELGGYFIVNGNEKLIRMLIMPKRNFPMAINRPSFQKRGVGFTTFGVQIRSARPDQTTQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKQEYLVPVMMILKALVETNDREIFEGIVGNASSKGSANTFVTDRVELLLRTFHGYKIWSRSDARAYLGKKFRPVLFAPATWTHEECGTEFLRKIVLPHLGNQNVTTTQDYDKFKLILFMIRKLYSFVAGDCASDNPDAVSNQEIMLGGYVYGMLLKERLEEWLLSFGRLLRDWSYKGGNLKFTDPMFEKDFISKVIKRTNENLGGALEYFLSTGNLVSPTGLDMQQASGFTVVAEKINFYRFISHFRMVHRGTFFAQLKTTTVRKLLPESWGFMCPVHTPDGSPCGLLNHLAHKCLVSTSDLDVAHIPRVLAQLGIKTESSAEVTESVCVQLNGRVIGYCSPKQAKMIHDTLRFWKVEGTHGIPKELEIGYIPNMQGGQYPGIYMSSQPARMYRPVKYLALDKLDYVGPFEQPFMEIACLEEDIRSGLSTHIEFTPTNMFSIIANMTPFSDNNQSPRNMYQCQMSKQTMGTPGTSIAFRTDNKMYRLQTGQTPIVRSPLYNEYGLDNFPNGCNAIVAILSYSAYDMDDAMIINKSSHERGFGHGTVYKTKFYNLDDKDSRRNKSKREISKLFGFAPGAEIKAEWRTTLDEDGLPHPGVKVKEGSYVAAWYNVRYDAGSDSYVNVDGQTHFLKYKDAEEGYIDTVRLVGNENGNEPLQAISVKYRVPRKPIIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPAIDMPFSESGIMPDLIINPHAFPSRMTIAQIIESMAGKAGALHGHPVDCTPFQFNEENTAADYFGHQLRKAGYNYHGNEPMYSGITGKEFAADIYLGVVHYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVNSVTGQPVKGRSKGGGIRVGEMERDSLLAHGCAFLLQDRLMNCSDSTRAWICRDCGSFLSTQVAVSSNGPSGGLADAASKAALAAAAKATPNNQVITSNLSRISSVNALGGTNGIVRCRRCAREAVFDDSRAMIWEDGDGNRFVGGDNVTVVVVPGVLRYLDVELAAMGIRLKFKVDH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.35
3	0.39
4	0.44
5	0.44
6	0.45
7	0.44
8	0.49
9	0.56
10	0.55
11	0.6
12	0.64
13	0.67
14	0.71
15	0.71
16	0.65
17	0.62
18	0.63
19	0.57
20	0.51
21	0.5
22	0.45
23	0.43
24	0.43
25	0.39
26	0.35
27	0.32
28	0.3
29	0.27
30	0.28
31	0.25
32	0.26
33	0.24
34	0.22
35	0.21
36	0.2
37	0.19
38	0.18
39	0.21
40	0.18
41	0.17
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.12
52	0.14
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.14
57	0.15
58	0.14
59	0.14
60	0.17
61	0.19
62	0.19
63	0.18
64	0.23
65	0.26
66	0.29
67	0.37
68	0.41
69	0.49
70	0.57
71	0.66
72	0.71
73	0.77
74	0.86
75	0.87
76	0.9
77	0.86
78	0.84
79	0.78
80	0.73
81	0.71
82	0.69
83	0.66
84	0.57
85	0.55
86	0.49
87	0.46
88	0.44
89	0.37
90	0.28
91	0.2
92	0.21
93	0.16
94	0.18
95	0.19
96	0.2
97	0.2
98	0.22
99	0.27
100	0.33
101	0.35
102	0.34
103	0.39
104	0.43
105	0.44
106	0.45
107	0.42
108	0.39
109	0.41
110	0.42
111	0.38
112	0.33
113	0.31
114	0.28
115	0.29
116	0.25
117	0.21
118	0.21
119	0.26
120	0.33
121	0.33
122	0.37
123	0.4
124	0.45
125	0.48
126	0.53
127	0.53
128	0.52
129	0.61
130	0.65
131	0.65
132	0.65
133	0.67
134	0.69
135	0.65
136	0.66
137	0.62
138	0.61
139	0.62
140	0.64
141	0.61
142	0.56
143	0.52
144	0.45
145	0.39
146	0.34
147	0.31
148	0.25
149	0.24
150	0.2
151	0.23
152	0.22
153	0.23
154	0.22
155	0.19
156	0.19
157	0.21
158	0.23
159	0.22
160	0.24
161	0.26
162	0.31
163	0.33
164	0.35
165	0.33
166	0.32
167	0.37
168	0.43
169	0.46
170	0.42
171	0.4
172	0.37
173	0.37
174	0.36
175	0.33
176	0.28
177	0.23
178	0.19
179	0.19
180	0.19
181	0.19
182	0.18
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.19
201	0.24
202	0.32
203	0.34
204	0.38
205	0.41
206	0.42
207	0.42
208	0.35
209	0.39
210	0.39
211	0.47
212	0.46
213	0.44
214	0.49
215	0.53
216	0.53
217	0.44
218	0.42
219	0.35
220	0.38
221	0.4
222	0.36
223	0.33
224	0.31
225	0.33
226	0.27
227	0.26
228	0.2
229	0.18
230	0.18
231	0.2
232	0.24
233	0.22
234	0.23
235	0.25
236	0.28
237	0.31
238	0.35
239	0.35
240	0.34
241	0.35
242	0.33
243	0.32
244	0.29
245	0.25
246	0.18
247	0.16
248	0.13
249	0.13
250	0.12
251	0.13
252	0.13
253	0.15
254	0.15
255	0.18
256	0.25
257	0.24
258	0.34
259	0.36
260	0.38
261	0.38
262	0.45
263	0.46
264	0.44
265	0.43
266	0.33
267	0.29
268	0.27
269	0.25
270	0.18
271	0.12
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.13
279	0.16
280	0.16
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.15
285	0.14
286	0.1
287	0.09
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.1
297	0.11
298	0.13
299	0.14
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.14
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.15
311	0.15
312	0.14
313	0.15
314	0.17
315	0.21
316	0.26
317	0.28
318	0.29
319	0.31
320	0.34
321	0.37
322	0.37
323	0.36
324	0.35
325	0.34
326	0.38
327	0.43
328	0.41
329	0.4
330	0.43
331	0.42
332	0.41
333	0.4
334	0.4
335	0.36
336	0.34
337	0.34
338	0.34
339	0.35
340	0.31
341	0.3
342	0.23
343	0.21
344	0.21
345	0.17
346	0.17
347	0.15
348	0.16
349	0.15
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.15
355	0.21
356	0.19
357	0.24
358	0.31
359	0.32
360	0.32
361	0.31
362	0.29
363	0.23
364	0.24
365	0.21
366	0.15
367	0.15
368	0.21
369	0.24
370	0.24
371	0.25
372	0.24
373	0.23
374	0.24
375	0.23
376	0.22
377	0.22
378	0.25
379	0.26
380	0.26
381	0.26
382	0.25
383	0.25
384	0.2
385	0.18
386	0.14
387	0.14
388	0.13
389	0.14
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.07
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.16
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.16
427	0.16
428	0.17
429	0.18
430	0.14
431	0.17
432	0.18
433	0.2
434	0.21
435	0.22
436	0.27
437	0.28
438	0.29
439	0.28
440	0.28
441	0.29
442	0.27
443	0.28
444	0.24
445	0.26
446	0.24
447	0.24
448	0.23
449	0.21
450	0.21
451	0.2
452	0.23
453	0.22
454	0.23
455	0.29
456	0.31
457	0.32
458	0.36
459	0.4
460	0.39
461	0.37
462	0.34
463	0.27
464	0.25
465	0.22
466	0.18
467	0.11
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.15
501	0.15
502	0.21
503	0.26
504	0.28
505	0.29
506	0.3
507	0.37
508	0.33
509	0.36
510	0.3
511	0.27
512	0.25
513	0.3
514	0.3
515	0.23
516	0.23
517	0.2
518	0.2
519	0.22
520	0.22
521	0.16
522	0.17
523	0.18
524	0.18
525	0.22
526	0.23
527	0.24
528	0.24
529	0.25
530	0.24
531	0.24
532	0.23
533	0.18
534	0.18
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.12
539	0.11
540	0.12
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.12
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.14
550	0.15
551	0.15
552	0.15
553	0.14
554	0.14
555	0.13
556	0.13
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.11
568	0.08
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.11
598	0.15
599	0.14
600	0.17
601	0.19
602	0.19
603	0.22
604	0.25
605	0.24
606	0.25
607	0.3
608	0.32
609	0.33
610	0.34
611	0.35
612	0.35
613	0.33
614	0.27
615	0.24
616	0.18
617	0.19
618	0.2
619	0.21
620	0.21
621	0.22
622	0.22
623	0.2
624	0.19
625	0.19
626	0.16
627	0.12
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.1
632	0.1
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.09
638	0.08
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.08
646	0.08
647	0.1
648	0.1
649	0.11
650	0.13
651	0.19
652	0.22
653	0.21
654	0.24
655	0.26
656	0.27
657	0.26
658	0.28
659	0.25
660	0.26
661	0.24
662	0.19
663	0.18
664	0.18
665	0.16
666	0.15
667	0.12
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.08
672	0.07
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.1
693	0.09
694	0.11
695	0.15
696	0.14
697	0.14
698	0.12
699	0.12
700	0.11
701	0.13
702	0.11
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.08
708	0.08
709	0.09
710	0.14
711	0.14
712	0.18
713	0.22
714	0.22
715	0.23
716	0.26
717	0.28
718	0.24
719	0.24
720	0.27
721	0.28
722	0.31
723	0.34
724	0.32
725	0.29
726	0.28
727	0.3
728	0.28
729	0.25
730	0.22
731	0.17
732	0.17
733	0.16
734	0.16
735	0.13
736	0.1
737	0.11
738	0.11
739	0.15
740	0.19
741	0.22
742	0.25
743	0.31
744	0.3
745	0.31
746	0.33
747	0.3
748	0.29
749	0.29
750	0.3
751	0.27
752	0.28
753	0.24
754	0.26
755	0.24
756	0.21
757	0.2
758	0.2
759	0.21
760	0.19
761	0.19
762	0.18
763	0.19
764	0.19
765	0.15
766	0.11
767	0.1
768	0.09
769	0.09
770	0.08
771	0.07
772	0.06
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.05
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.05
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.09
795	0.1
796	0.11
797	0.13
798	0.13
799	0.17
800	0.22
801	0.21
802	0.22
803	0.24
804	0.25
805	0.29
806	0.3
807	0.29
808	0.24
809	0.25
810	0.25
811	0.25
812	0.32
813	0.28
814	0.35
815	0.38
816	0.42
817	0.51
818	0.54
819	0.56
820	0.57
821	0.6
822	0.58
823	0.63
824	0.69
825	0.69
826	0.73
827	0.74
828	0.69
829	0.7
830	0.66
831	0.57
832	0.49
833	0.39
834	0.28
835	0.26
836	0.21
837	0.14
838	0.11
839	0.1
840	0.1
841	0.13
842	0.13
843	0.1
844	0.11
845	0.12
846	0.14
847	0.15
848	0.15
849	0.13
850	0.15
851	0.16
852	0.17
853	0.16
854	0.14
855	0.13
856	0.16
857	0.15
858	0.15
859	0.16
860	0.15
861	0.2
862	0.21
863	0.21
864	0.18
865	0.19
866	0.18
867	0.19
868	0.18
869	0.14
870	0.14
871	0.14
872	0.13
873	0.11
874	0.12
875	0.1
876	0.11
877	0.12
878	0.11
879	0.11
880	0.12
881	0.12
882	0.11
883	0.1
884	0.09
885	0.08
886	0.11
887	0.11
888	0.12
889	0.12
890	0.12
891	0.15
892	0.14
893	0.17
894	0.19
895	0.18
896	0.18
897	0.18
898	0.2
899	0.2
900	0.2
901	0.17
902	0.12
903	0.12
904	0.11
905	0.1
906	0.11
907	0.1
908	0.12
909	0.13
910	0.14
911	0.16
912	0.16
913	0.15
914	0.13
915	0.11
916	0.09
917	0.09
918	0.08
919	0.09
920	0.11
921	0.14
922	0.18
923	0.27
924	0.3
925	0.37
926	0.42
927	0.45
928	0.52
929	0.59
930	0.62
931	0.58
932	0.57
933	0.57
934	0.53
935	0.5
936	0.49
937	0.41
938	0.38
939	0.37
940	0.38
941	0.35
942	0.41
943	0.45
944	0.38
945	0.38
946	0.33
947	0.34
948	0.31
949	0.29
950	0.22
951	0.16
952	0.15
953	0.15
954	0.17
955	0.13
956	0.13
957	0.12
958	0.11
959	0.11
960	0.13
961	0.13
962	0.09
963	0.09
964	0.1
965	0.1
966	0.11
967	0.11
968	0.09
969	0.11
970	0.12
971	0.12
972	0.11
973	0.16
974	0.18
975	0.19
976	0.19
977	0.19
978	0.19
979	0.19
980	0.19
981	0.14
982	0.12
983	0.11
984	0.1
985	0.08
986	0.07
987	0.06
988	0.06
989	0.06
990	0.07
991	0.07
992	0.09
993	0.1
994	0.1
995	0.1
996	0.11
997	0.14
998	0.13
999	0.15
1000	0.16
1001	0.16
1002	0.19
1003	0.22
1004	0.22
1005	0.26
1006	0.26
1007	0.25
1008	0.22
1009	0.22
1010	0.18
1011	0.15
1012	0.16
1013	0.12
1014	0.15
1015	0.17
1016	0.16
1017	0.18
1018	0.21
1019	0.27
1020	0.27
1021	0.29
1022	0.3
1023	0.36
1024	0.39
1025	0.43
1026	0.45
1027	0.4
1028	0.39
1029	0.36
1030	0.32
1031	0.25
1032	0.21
1033	0.16
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.11
1038	0.11
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.1
1042	0.08
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.11
1051	0.12
1052	0.14
1053	0.19
1054	0.21
1055	0.25
1056	0.33
1057	0.38
1058	0.42
1059	0.5
1060	0.51
1061	0.48
1062	0.47
1063	0.47
1064	0.4
1065	0.38
1066	0.34
1067	0.3
1068	0.29
1069	0.29
1070	0.3
1071	0.27
1072	0.27
1073	0.26
1074	0.26
1075	0.22
1076	0.23
1077	0.29
1078	0.32
1079	0.33
1080	0.34
1081	0.32
1082	0.38
1083	0.41
1084	0.44
1085	0.43
1086	0.39
1087	0.39
1088	0.4
1089	0.39
1090	0.32
1091	0.27
1092	0.23
1093	0.15
1094	0.15
1095	0.12
1096	0.1
1097	0.1
1098	0.1
1099	0.09
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.1
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.16
1110	0.17
1111	0.18
1112	0.17
1113	0.17
1114	0.19
1115	0.17
1116	0.22
1117	0.23
1118	0.26
1119	0.29
1120	0.33
1121	0.33
1122	0.38
1123	0.4
1124	0.37
1125	0.34
1126	0.33
1127	0.3
1128	0.27
1129	0.29
1130	0.22
1131	0.19
1132	0.18
1133	0.17
1134	0.16
1135	0.16
1136	0.16
1137	0.13
1138	0.13
1139	0.13
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.1
1143	0.09
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.07
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.07
1153	0.06
1154	0.07
1155	0.08
1156	0.09
1157	0.11
1158	0.12
1159	0.13
1160	0.18
1161	0.21
1162	0.21
1163	0.21
1164	0.2
1165	0.21
1166	0.28
1167	0.29
1168	0.26
1169	0.25
1170	0.24
1171	0.24
1172	0.23
1173	0.26
1174	0.2
1175	0.19
1176	0.18
1177	0.17
1178	0.16
1179	0.15
1180	0.15
1181	0.12
1182	0.13
1183	0.13
1184	0.15
1185	0.19
1186	0.21
1187	0.28
1188	0.36
1189	0.4
1190	0.4
1191	0.48
1192	0.5
1193	0.56
1194	0.59
1195	0.6
1196	0.56
1197	0.53
1198	0.51
1199	0.42
1200	0.37
1201	0.28
1202	0.25
1203	0.17
1204	0.13
1205	0.14
1206	0.15
1207	0.16
1208	0.18
1209	0.17
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.15
1213	0.13
1214	0.13
1215	0.13
1216	0.11
1217	0.11
1218	0.11
1219	0.11
1220	0.11
1221	0.11
1222	0.08
1223	0.07
1224	0.06
1225	0.05
1226	0.06
1227	0.06
1228	0.06
1229	0.07
1230	0.09
1231	0.09
1232	0.09
1233	0.09
1234	0.08
1235	0.08
1236	0.08
1237	0.08
1238	0.07
1239	0.09
1240	0.11
1241	0.11

B6QA38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer