Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HIJ0

Protein Details
Accession W7HIJ0    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-55PPDVDDAKLARRRRRRTSIKDQAILEHydrophilic
82-111QVQIWFQNRRQTNRRKSKPLKPHEMLPRNSHydrophilic
406-429KIQQLSPTKKDKPRKVVTATQKGPHydrophilic
484-504DPTSKARKVRAPQQPSWRSKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-45RRRRRR
348-357KALKAIRARG
362-363AK
369-370RK
382-383KK
412-446PTKKDKPRKVVTATQKGPKKATPSPPLSAVKNIKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MASISTTSPAPAQTFAFITHSPATLPNNLPPDVDDAKLARRRRRRTSIKDQAILEAEYAKNDRPNKDVRTDIAIRIGLEEKQVQIWFQNRRQTNRRKSKPLKPHEMLPRNSSNRCLDLSSDPFVSSPYTPRNDAAEIPCPSSRASSPCPAIEPVVKAEADIQDHHDEEVPMSDTTEIDISLDKPDIARKTSPIHFLLNPSSEILNASFQSTTTVADEPEMSQPGSAMKPAYSQSQESPRPFVNPRRTGLIASTEPTLLRRSSSLVRLSMSFDGKATVVLEDEEESCASPRSSQTSTLVESSQPSFHSESAGTVTPAKRRTVNAKIWESCCDSQSSLPAEPVKEDSPRKALKAIRARGVVAAAKAAADARKQRATSTTATEKKKRVLGPKSTNSIVPLTTPSAKKVKIQQLSPTKKDKPRKVVTATQKGPKKATPSPPLSAVKNIKRSPFRGLEKALNGGSRNDKPGFTIYQSSDEGDSEKENWDPTSKARKVRAPQQPSWRSKLERSILGDLGEERVPQPNELEVIENLMSLRDGLWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.22
4 0.2
5 0.23
6 0.22
7 0.21
8 0.2
9 0.23
10 0.25
11 0.27
12 0.3
13 0.31
14 0.34
15 0.34
16 0.34
17 0.31
18 0.34
19 0.3
20 0.28
21 0.25
22 0.22
23 0.3
24 0.37
25 0.44
26 0.46
27 0.54
28 0.63
29 0.71
30 0.8
31 0.82
32 0.85
33 0.89
34 0.91
35 0.91
36 0.87
37 0.78
38 0.71
39 0.63
40 0.53
41 0.43
42 0.36
43 0.26
44 0.22
45 0.23
46 0.21
47 0.24
48 0.3
49 0.32
50 0.33
51 0.41
52 0.44
53 0.48
54 0.5
55 0.46
56 0.48
57 0.49
58 0.45
59 0.42
60 0.38
61 0.32
62 0.3
63 0.29
64 0.22
65 0.21
66 0.21
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.19
72 0.26
73 0.31
74 0.36
75 0.44
76 0.47
77 0.55
78 0.65
79 0.72
80 0.76
81 0.79
82 0.82
83 0.85
84 0.88
85 0.9
86 0.91
87 0.9
88 0.9
89 0.82
90 0.81
91 0.81
92 0.81
93 0.74
94 0.7
95 0.69
96 0.65
97 0.63
98 0.59
99 0.52
100 0.45
101 0.43
102 0.38
103 0.31
104 0.31
105 0.33
106 0.31
107 0.28
108 0.25
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.24
116 0.26
117 0.27
118 0.3
119 0.29
120 0.32
121 0.31
122 0.32
123 0.3
124 0.32
125 0.31
126 0.29
127 0.27
128 0.26
129 0.25
130 0.22
131 0.25
132 0.28
133 0.3
134 0.3
135 0.32
136 0.31
137 0.3
138 0.27
139 0.24
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.16
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.18
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.13
172 0.15
173 0.17
174 0.18
175 0.19
176 0.24
177 0.28
178 0.32
179 0.3
180 0.31
181 0.29
182 0.31
183 0.32
184 0.28
185 0.25
186 0.21
187 0.19
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.1
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.25
222 0.31
223 0.3
224 0.32
225 0.29
226 0.32
227 0.35
228 0.4
229 0.42
230 0.41
231 0.42
232 0.43
233 0.43
234 0.4
235 0.36
236 0.32
237 0.23
238 0.19
239 0.19
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.13
249 0.17
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.14
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.17
281 0.19
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.13
300 0.15
301 0.18
302 0.2
303 0.21
304 0.22
305 0.24
306 0.31
307 0.36
308 0.42
309 0.46
310 0.5
311 0.52
312 0.51
313 0.52
314 0.5
315 0.43
316 0.36
317 0.29
318 0.23
319 0.2
320 0.22
321 0.22
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.2
328 0.18
329 0.21
330 0.22
331 0.23
332 0.29
333 0.3
334 0.31
335 0.34
336 0.35
337 0.39
338 0.46
339 0.48
340 0.46
341 0.46
342 0.45
343 0.4
344 0.38
345 0.31
346 0.21
347 0.17
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.1
354 0.15
355 0.19
356 0.24
357 0.24
358 0.25
359 0.28
360 0.31
361 0.31
362 0.32
363 0.37
364 0.41
365 0.48
366 0.53
367 0.54
368 0.55
369 0.58
370 0.57
371 0.57
372 0.59
373 0.62
374 0.66
375 0.69
376 0.69
377 0.64
378 0.59
379 0.51
380 0.44
381 0.33
382 0.24
383 0.2
384 0.18
385 0.22
386 0.22
387 0.24
388 0.28
389 0.29
390 0.33
391 0.4
392 0.46
393 0.46
394 0.49
395 0.54
396 0.59
397 0.67
398 0.69
399 0.68
400 0.67
401 0.71
402 0.78
403 0.78
404 0.77
405 0.77
406 0.8
407 0.78
408 0.79
409 0.8
410 0.81
411 0.77
412 0.75
413 0.73
414 0.68
415 0.64
416 0.59
417 0.55
418 0.53
419 0.57
420 0.58
421 0.58
422 0.57
423 0.61
424 0.61
425 0.56
426 0.56
427 0.55
428 0.54
429 0.57
430 0.58
431 0.59
432 0.61
433 0.62
434 0.62
435 0.62
436 0.61
437 0.58
438 0.59
439 0.58
440 0.54
441 0.55
442 0.49
443 0.43
444 0.37
445 0.34
446 0.36
447 0.33
448 0.36
449 0.33
450 0.32
451 0.31
452 0.34
453 0.34
454 0.3
455 0.33
456 0.29
457 0.33
458 0.33
459 0.32
460 0.29
461 0.26
462 0.24
463 0.19
464 0.19
465 0.15
466 0.16
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.19
471 0.2
472 0.26
473 0.35
474 0.39
475 0.46
476 0.52
477 0.59
478 0.65
479 0.73
480 0.76
481 0.73
482 0.76
483 0.79
484 0.82
485 0.8
486 0.78
487 0.76
488 0.71
489 0.68
490 0.7
491 0.65
492 0.61
493 0.61
494 0.6
495 0.54
496 0.49
497 0.44
498 0.35
499 0.31
500 0.25
501 0.2
502 0.15
503 0.21
504 0.22
505 0.22
506 0.22
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.25
511 0.17
512 0.2
513 0.19
514 0.18
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.1