Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7IA65

Protein Details
Accession W7IA65    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-115DKERSKLKRVLKILKERPGKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-125ERSKLKRVLKILKERPGKISEEGIKRVAR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 7.5, extr 5, cyto_nucl 4.5, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MNTHTPMAAPPHNAMTPGNLAAFPFSPAVSQALAGSSPHPGLKRSPHSAALAPSLSSSGLQFGSPASSTTGTKYLQSLNALLGGDAGSVVGGGEDKERSKLKRVLKILKERPGKISEEGIKRVARRAGMQYHTDSAGVVKGVHTLIISGIIVVVDIDFKGGAVTRVALSFAETSGPTAEFSDRAAKILEQTLSPGSYSMTSSLAQFADNLERFARSDRLSHLPSLNCFSAVTGLYVSMMKIWEKETASMGEVEAMCKGMGRPGMHLRGKVGFCIDYWKERRSIPTATAGKGKGKGEDESGRYWRVVVDVDELPNEGYITPVRNSEDWVSDNVLKAADGLFSHDAYEVDWIEPPLNNYEPATKPEVLARLNNTRFIAKLDPPVVIGLQDEVEILNAAGASAMSQVMPEPLETVLCPKMRGSREPLAHSRVVHSGKDQTAIFQVLRKYACFDTIFHAAFPQDISPPLGTTSKEQQAQQAQQQQQQQPLKQQKEDRMELDDFLADDTPSKAIPVDISMNALPLGLSLLFPHSAEKVSQVEVNIMNNAELQILAVTDGVAADAEAVKKVVEVAEDVGILVEWVRRSMKVGAGDGDGMVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.25
4 0.23
5 0.22
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.16
11 0.14
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.24
29 0.33
30 0.4
31 0.45
32 0.48
33 0.49
34 0.51
35 0.53
36 0.5
37 0.45
38 0.38
39 0.31
40 0.27
41 0.23
42 0.2
43 0.16
44 0.13
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.15
56 0.17
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.25
63 0.26
64 0.24
65 0.2
66 0.22
67 0.21
68 0.18
69 0.14
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.14
84 0.19
85 0.22
86 0.31
87 0.38
88 0.45
89 0.52
90 0.6
91 0.66
92 0.71
93 0.79
94 0.79
95 0.81
96 0.81
97 0.74
98 0.71
99 0.65
100 0.59
101 0.5
102 0.49
103 0.48
104 0.46
105 0.46
106 0.45
107 0.44
108 0.42
109 0.45
110 0.41
111 0.34
112 0.32
113 0.36
114 0.39
115 0.39
116 0.42
117 0.39
118 0.38
119 0.37
120 0.33
121 0.26
122 0.19
123 0.16
124 0.12
125 0.1
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.2
175 0.19
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.17
201 0.19
202 0.14
203 0.16
204 0.19
205 0.24
206 0.26
207 0.28
208 0.29
209 0.27
210 0.28
211 0.3
212 0.26
213 0.2
214 0.18
215 0.16
216 0.14
217 0.12
218 0.11
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.17
250 0.25
251 0.27
252 0.27
253 0.26
254 0.29
255 0.29
256 0.26
257 0.22
258 0.15
259 0.13
260 0.19
261 0.18
262 0.2
263 0.24
264 0.25
265 0.26
266 0.27
267 0.3
268 0.28
269 0.29
270 0.23
271 0.29
272 0.3
273 0.29
274 0.32
275 0.3
276 0.29
277 0.3
278 0.29
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.21
283 0.24
284 0.24
285 0.23
286 0.25
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.17
291 0.13
292 0.12
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.07
306 0.07
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.16
345 0.16
346 0.19
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.21
351 0.25
352 0.22
353 0.23
354 0.24
355 0.28
356 0.29
357 0.32
358 0.3
359 0.27
360 0.26
361 0.26
362 0.26
363 0.19
364 0.23
365 0.22
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.18
370 0.14
371 0.12
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.09
399 0.13
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.22
404 0.25
405 0.29
406 0.34
407 0.37
408 0.41
409 0.47
410 0.51
411 0.48
412 0.47
413 0.44
414 0.39
415 0.38
416 0.36
417 0.31
418 0.28
419 0.29
420 0.27
421 0.3
422 0.27
423 0.21
424 0.21
425 0.23
426 0.21
427 0.18
428 0.19
429 0.2
430 0.21
431 0.2
432 0.22
433 0.2
434 0.24
435 0.22
436 0.22
437 0.22
438 0.27
439 0.27
440 0.23
441 0.23
442 0.19
443 0.18
444 0.17
445 0.14
446 0.09
447 0.1
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.14
452 0.15
453 0.15
454 0.18
455 0.24
456 0.28
457 0.31
458 0.31
459 0.36
460 0.42
461 0.45
462 0.48
463 0.51
464 0.49
465 0.51
466 0.58
467 0.55
468 0.57
469 0.58
470 0.54
471 0.55
472 0.61
473 0.61
474 0.61
475 0.64
476 0.64
477 0.66
478 0.67
479 0.6
480 0.56
481 0.51
482 0.44
483 0.39
484 0.3
485 0.22
486 0.18
487 0.16
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.11
498 0.14
499 0.13
500 0.17
501 0.16
502 0.17
503 0.16
504 0.15
505 0.12
506 0.08
507 0.09
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.19
522 0.18
523 0.21
524 0.21
525 0.22
526 0.21
527 0.19
528 0.17
529 0.16
530 0.15
531 0.12
532 0.09
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.06
546 0.07
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.09
564 0.08
565 0.11
566 0.13
567 0.13
568 0.17
569 0.21
570 0.25
571 0.28
572 0.3
573 0.3
574 0.3
575 0.3