Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HIM0

Protein Details
Accession W7HIM0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-161ITTAKKSKGKGKPKAAKETEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-158KKSKGKGKPKAAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, cyto 10.5, mito 9, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDSVSPPPPPPPCKYFAKGQCFRSASCSFSHDLSNASDVEIYEVDISELLPGRQPAQLPSRGVNPESLAYEKYLHPPTPPSQIISFKDSRHYNKARLIAGMTHVQFAAGFHVTDAHIQDLLASPGLLSALEVFIIKGMDTSITTAKKSKGKGKPKAAKETEPRSTGITSEPVAALVKRCPNLQVLHLIGCGDIDDTVVKTAVKYCPNIREIKITGLPTKPGSITTASLVYLIIRGENLANGLREINFTNQKLDPRVVTVLSDVRPDLNITEGSQWESKNGGVGLGLSSQEGTYFYNSGYVVGIDGTSLRFKECYCPLWDQTEITCLEGLRELCDAGGPDGFWSDGGASSSSDQIQHASDSSESGCSHKPDRNNKAALETTLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.63
4 0.68
5 0.68
6 0.67
7 0.71
8 0.65
9 0.62
10 0.6
11 0.52
12 0.43
13 0.38
14 0.37
15 0.3
16 0.29
17 0.3
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.22
22 0.19
23 0.17
24 0.16
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.16
41 0.17
42 0.2
43 0.25
44 0.3
45 0.31
46 0.32
47 0.37
48 0.38
49 0.38
50 0.34
51 0.29
52 0.26
53 0.26
54 0.25
55 0.19
56 0.18
57 0.2
58 0.2
59 0.24
60 0.27
61 0.25
62 0.25
63 0.3
64 0.32
65 0.37
66 0.37
67 0.34
68 0.33
69 0.39
70 0.41
71 0.42
72 0.43
73 0.36
74 0.42
75 0.46
76 0.47
77 0.5
78 0.53
79 0.52
80 0.54
81 0.59
82 0.53
83 0.47
84 0.43
85 0.34
86 0.32
87 0.31
88 0.25
89 0.2
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.07
128 0.1
129 0.12
130 0.13
131 0.16
132 0.2
133 0.25
134 0.29
135 0.37
136 0.43
137 0.52
138 0.61
139 0.69
140 0.74
141 0.76
142 0.83
143 0.77
144 0.75
145 0.73
146 0.71
147 0.65
148 0.58
149 0.51
150 0.43
151 0.39
152 0.31
153 0.25
154 0.19
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.07
188 0.11
189 0.14
190 0.16
191 0.19
192 0.24
193 0.28
194 0.31
195 0.3
196 0.31
197 0.3
198 0.31
199 0.32
200 0.28
201 0.28
202 0.25
203 0.26
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.14
233 0.18
234 0.19
235 0.22
236 0.23
237 0.26
238 0.28
239 0.28
240 0.23
241 0.21
242 0.22
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.15
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.11
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.18
299 0.21
300 0.24
301 0.27
302 0.33
303 0.35
304 0.39
305 0.39
306 0.34
307 0.31
308 0.32
309 0.28
310 0.23
311 0.21
312 0.16
313 0.15
314 0.18
315 0.17
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.1
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.17
349 0.16
350 0.19
351 0.22
352 0.25
353 0.3
354 0.34
355 0.42
356 0.5
357 0.59
358 0.65
359 0.66
360 0.63
361 0.65
362 0.63