Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7I8E0

Protein Details
Accession W7I8E0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-267EPEPPRKKKARLSSPATKKRPTBasic
335-362LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-265PPRKKKARLSSPATKKR
342-353GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MADKGKPWIFAPNRCDPGHDSSAAPSAATAQDPELLSLVSHYLESHGFTQARGKLLQEATKRKIKLEPAKSKSLIDIYQTFKAASTTPAAQLAREAADDTSDTLSAHSTHSSTIATIPKPVNPRKRQRSASVSSEASDSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSSDSESSESDDSSSDSSSESSDDDEPKSASGNNSDSSESSESDASSDSSTPSPSPEPEPPRKKKARLSSPATKKRPTSSMISDNPGSTTDNTASAEQGPEISKVEKAKNKPFSRIDINQIQYENDLLKDNRFNGNAYAQRAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDFAPKSYKFMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.53
4 0.54
5 0.5
6 0.45
7 0.36
8 0.32
9 0.37
10 0.33
11 0.28
12 0.2
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.09
30 0.09
31 0.12
32 0.12
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.24
37 0.26
38 0.28
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.37
44 0.39
45 0.45
46 0.48
47 0.55
48 0.55
49 0.51
50 0.53
51 0.56
52 0.58
53 0.6
54 0.65
55 0.63
56 0.71
57 0.7
58 0.65
59 0.57
60 0.51
61 0.42
62 0.35
63 0.35
64 0.31
65 0.32
66 0.32
67 0.29
68 0.25
69 0.24
70 0.2
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.15
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.13
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.21
105 0.24
106 0.32
107 0.4
108 0.47
109 0.52
110 0.62
111 0.68
112 0.76
113 0.77
114 0.77
115 0.77
116 0.72
117 0.69
118 0.63
119 0.54
120 0.45
121 0.4
122 0.32
123 0.24
124 0.18
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.08
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.16
216 0.15
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.18
232 0.24
233 0.32
234 0.41
235 0.52
236 0.57
237 0.65
238 0.72
239 0.75
240 0.76
241 0.78
242 0.79
243 0.78
244 0.79
245 0.79
246 0.82
247 0.85
248 0.83
249 0.77
250 0.7
251 0.66
252 0.62
253 0.55
254 0.5
255 0.47
256 0.5
257 0.48
258 0.49
259 0.45
260 0.4
261 0.38
262 0.32
263 0.27
264 0.19
265 0.18
266 0.15
267 0.15
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.15
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.19
281 0.27
282 0.32
283 0.39
284 0.48
285 0.56
286 0.6
287 0.65
288 0.65
289 0.64
290 0.66
291 0.63
292 0.61
293 0.59
294 0.58
295 0.53
296 0.49
297 0.43
298 0.34
299 0.31
300 0.25
301 0.17
302 0.19
303 0.16
304 0.2
305 0.24
306 0.26
307 0.3
308 0.3
309 0.31
310 0.29
311 0.36
312 0.37
313 0.37
314 0.38
315 0.33
316 0.34
317 0.33
318 0.31
319 0.25
320 0.21
321 0.17
322 0.2
323 0.22
324 0.2
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.26
329 0.3
330 0.34
331 0.43
332 0.54
333 0.63
334 0.73
335 0.81
336 0.84
337 0.9
338 0.91
339 0.9
340 0.9
341 0.87
342 0.86
343 0.85
344 0.78
345 0.68
346 0.59
347 0.56
348 0.46
349 0.4
350 0.34
351 0.25