Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7I4M1

Protein Details
Accession W7I4M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-330RDKGKPASPTSPNSKKRRKSKAAGMGPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-329KGKPASPTSPNSKKRRKSKAAGMGP
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAQPASEPPLDEIQWRSPGFIQAFGPLNTNNVLTYFFNSPFFDRSSNNSSLYMQAQTNASLQHLIHNRVQFEKRLKSMVGVEFVVAAEDPANSIWVIKKQMRRSPVDAQVLDVYFVVGENIYMAPTIHGIMTSRLLSATSAISKAQELSASLTHFSPESGYTYLPPQPTQPSQPGSTTTSFSQSSSAPTAVSAQSSVPPPPPSTLSNVPPSSVDVTIARESLNMQSSLNASLRFSAAPGGYLDDNPITDPQQLMMGSSQSQSHSQSHSQSHSQSQSSLMKDRAAAKEALPTVSTAAAIAAANRDKGKPASPTSPNSKKRRKSKAAGMGPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.33
4 0.31
5 0.37
6 0.35
7 0.34
8 0.29
9 0.26
10 0.3
11 0.28
12 0.29
13 0.22
14 0.23
15 0.21
16 0.21
17 0.16
18 0.13
19 0.15
20 0.13
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.21
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.26
29 0.25
30 0.23
31 0.29
32 0.33
33 0.35
34 0.34
35 0.33
36 0.31
37 0.31
38 0.31
39 0.27
40 0.21
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.19
50 0.23
51 0.26
52 0.29
53 0.32
54 0.33
55 0.37
56 0.39
57 0.39
58 0.41
59 0.44
60 0.42
61 0.42
62 0.41
63 0.37
64 0.41
65 0.37
66 0.32
67 0.25
68 0.23
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.1
73 0.07
74 0.05
75 0.04
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.1
83 0.16
84 0.21
85 0.28
86 0.36
87 0.41
88 0.47
89 0.51
90 0.54
91 0.56
92 0.59
93 0.59
94 0.51
95 0.48
96 0.44
97 0.38
98 0.32
99 0.24
100 0.16
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.11
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.16
155 0.18
156 0.21
157 0.23
158 0.22
159 0.23
160 0.24
161 0.25
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.19
166 0.2
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.11
175 0.1
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.18
189 0.17
190 0.22
191 0.25
192 0.26
193 0.32
194 0.31
195 0.3
196 0.27
197 0.28
198 0.24
199 0.2
200 0.17
201 0.11
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.14
248 0.17
249 0.19
250 0.22
251 0.25
252 0.29
253 0.33
254 0.36
255 0.38
256 0.38
257 0.42
258 0.42
259 0.4
260 0.35
261 0.36
262 0.37
263 0.37
264 0.39
265 0.34
266 0.3
267 0.33
268 0.38
269 0.36
270 0.34
271 0.31
272 0.27
273 0.32
274 0.32
275 0.3
276 0.23
277 0.2
278 0.18
279 0.17
280 0.17
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.11
287 0.12
288 0.15
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.23
293 0.28
294 0.3
295 0.35
296 0.41
297 0.46
298 0.53
299 0.59
300 0.67
301 0.72
302 0.76
303 0.81
304 0.82
305 0.86
306 0.9
307 0.9
308 0.89
309 0.9
310 0.9