Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HVU6

Protein Details
Accession W7HVU6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-82TRDSPHYSRRRSPRSRSPADGHydrophilic
92-111DSDMRRRRSRSPDGAPRPKWBasic
166-206NSRSRSRSSSPRGKRHRTRSRSPKRERDRGRTKHREPERDTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-17GRKRGGPGRYGRD
72-75RSPR
96-108RRRRSRSPDGAPR
135-201RSKRSKYRSRSPSHGRRDKSRDRGGRDKRYHNSRSRSRSSSPRGKRHRTRSRSPKRERDRGRTKHRE
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDRGGRKRGGPGRYGRDGAGDRDRDRDDRRAPGGGPVGGGTGARYPRDDYYNERRDERYGGTRDSPHYSRRRSPRSRSPADGKSHHNYSQRDSDMRRRRSRSPDGAPRPKWADRDDTRYDRSHRYDRDDDYDSHRSKRSKYRSRSPSHGRRDKSRDRGGRDKRYHNSRSRSRSSSPRGKRHRTRSRSPKRERDRGRTKHREPERDTEMQNTGDGDGDDAMMAIMGFGGFTSTKGKKIEGNAVGGAKIEKQAQYRQYMNRVGGFNRALSPPGDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.53
3 0.52
4 0.49
5 0.47
6 0.46
7 0.44
8 0.39
9 0.43
10 0.46
11 0.46
12 0.48
13 0.52
14 0.49
15 0.5
16 0.52
17 0.5
18 0.47
19 0.47
20 0.46
21 0.37
22 0.32
23 0.24
24 0.21
25 0.17
26 0.17
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.14
31 0.15
32 0.17
33 0.2
34 0.24
35 0.26
36 0.29
37 0.38
38 0.46
39 0.47
40 0.48
41 0.46
42 0.45
43 0.46
44 0.43
45 0.42
46 0.37
47 0.38
48 0.39
49 0.4
50 0.41
51 0.44
52 0.42
53 0.42
54 0.47
55 0.5
56 0.54
57 0.61
58 0.69
59 0.71
60 0.78
61 0.8
62 0.82
63 0.81
64 0.8
65 0.77
66 0.75
67 0.72
68 0.68
69 0.63
70 0.59
71 0.58
72 0.56
73 0.55
74 0.49
75 0.46
76 0.49
77 0.46
78 0.44
79 0.43
80 0.48
81 0.51
82 0.59
83 0.63
84 0.6
85 0.65
86 0.7
87 0.75
88 0.73
89 0.73
90 0.74
91 0.76
92 0.8
93 0.74
94 0.7
95 0.67
96 0.61
97 0.55
98 0.47
99 0.46
100 0.4
101 0.46
102 0.47
103 0.46
104 0.47
105 0.47
106 0.48
107 0.45
108 0.47
109 0.47
110 0.43
111 0.46
112 0.47
113 0.46
114 0.47
115 0.44
116 0.4
117 0.39
118 0.44
119 0.38
120 0.36
121 0.38
122 0.35
123 0.37
124 0.45
125 0.49
126 0.51
127 0.57
128 0.65
129 0.7
130 0.74
131 0.78
132 0.79
133 0.78
134 0.79
135 0.79
136 0.72
137 0.71
138 0.74
139 0.74
140 0.73
141 0.73
142 0.69
143 0.68
144 0.75
145 0.76
146 0.78
147 0.76
148 0.75
149 0.73
150 0.76
151 0.77
152 0.75
153 0.75
154 0.73
155 0.74
156 0.73
157 0.7
158 0.66
159 0.67
160 0.68
161 0.69
162 0.7
163 0.72
164 0.75
165 0.8
166 0.84
167 0.86
168 0.88
169 0.85
170 0.87
171 0.88
172 0.89
173 0.9
174 0.9
175 0.9
176 0.89
177 0.91
178 0.89
179 0.89
180 0.88
181 0.88
182 0.89
183 0.89
184 0.85
185 0.85
186 0.85
187 0.84
188 0.79
189 0.77
190 0.73
191 0.68
192 0.63
193 0.57
194 0.51
195 0.41
196 0.36
197 0.28
198 0.21
199 0.16
200 0.14
201 0.11
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.12
218 0.13
219 0.18
220 0.2
221 0.22
222 0.25
223 0.3
224 0.39
225 0.36
226 0.38
227 0.37
228 0.36
229 0.35
230 0.31
231 0.27
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.21
237 0.28
238 0.33
239 0.39
240 0.45
241 0.49
242 0.54
243 0.56
244 0.55
245 0.54
246 0.51
247 0.46
248 0.46
249 0.41
250 0.36
251 0.33
252 0.31
253 0.26