Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HNZ1

Protein Details
Accession W7HNZ1    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-49MAELPPPTSQKPHKKHKKSKDVAIDTPSSDKAERKTKKRKLSAETDDTAHydrophilic
293-316SDDEDDARRRRKEKKEKKKRKRAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-21KPHKKHKKSKD
30-40DKAERKTKKRK
300-316RRRRKEKKEKKKRKRAE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAELPPPTSQKPHKKHKKSKDVAIDTPSSDKAERKTKKRKLSAETDDTASNVPAMATTTTKRRRRTLGTAAVSTPYVLTTISRYLPISPAYSATPHIGIQRDHLDPLVLKYDSTLAGVVLLHRDLQFHSSAAEICGESPFAFAWCRVEVLLFRPAVGMLLEGYVNDVSPSHVGMLYGNVFSVAVKAGGIPGGWQWSPNVNAHVGRKGADEGEGGVVVDSVMGRWIDADGEEVAGLQRFVVTAVKAEGGLLSLEGSFKDEDLPEEEEEEEEGHETAEKETVGRETTEIHGRVLSDDEDDARRRRKEKKEKKKRKRAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.9
3 0.93
4 0.94
5 0.92
6 0.93
7 0.92
8 0.89
9 0.84
10 0.79
11 0.71
12 0.61
13 0.56
14 0.47
15 0.39
16 0.33
17 0.31
18 0.32
19 0.39
20 0.46
21 0.53
22 0.63
23 0.7
24 0.78
25 0.84
26 0.87
27 0.84
28 0.86
29 0.85
30 0.81
31 0.75
32 0.66
33 0.57
34 0.48
35 0.41
36 0.3
37 0.21
38 0.13
39 0.09
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.1
44 0.12
45 0.22
46 0.32
47 0.39
48 0.45
49 0.5
50 0.57
51 0.62
52 0.69
53 0.69
54 0.69
55 0.67
56 0.64
57 0.58
58 0.52
59 0.44
60 0.35
61 0.25
62 0.14
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.19
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.15
93 0.16
94 0.17
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.14
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.17
188 0.19
189 0.21
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.07
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.14
248 0.17
249 0.15
250 0.17
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.18
272 0.26
273 0.25
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.24
278 0.24
279 0.2
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.2
284 0.24
285 0.3
286 0.36
287 0.42
288 0.47
289 0.56
290 0.65
291 0.72
292 0.79
293 0.83
294 0.87
295 0.91
296 0.96