Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QM78

Protein Details
Accession B6QM78    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-140NELTKTPSKTRRSSKPNGASENHydrophilic
237-262ATRGGKRGVKKGKRKGRRARDTDEDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-256RGGKRGVKKGKRKGRRAR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG tmf:PMAA_059840  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MDVAESTEPVAQAGVDLSRVIGDVDISLDSLGDDGRSSSLSEIDDVSDNEPSDVELPQPQQSVPEEVDSEAETERLEDSPNNHRLQPNIKLTGMSRFESSPSKLAQSTTYDEMEEDEENELTKTPSKTRRSSKPNGASENIETPVLDDAESPHSHADVAGKKRKRSQANEDLDTEMGDDDEPLRKRRGSVGADEIQDEVGGDVLTTREETEEVGQHDASGKGTPLDETPDSAVPTIATRGGKRGVKKGKRKGRRARDTDEDLENGAENTEDQLQEDEETGDVADDANDADAVAKSEEELARKIAAIDALAVLEKEFATLREKIYDERIAKIDRELEQLTSPEPTHPELLRQLECLQRHRDKKINYEHTLYQYRMQSLMSRSLADRAQIHSTYFQRIRDTREKHSTAVSKQFYAIQHDRFKTEELGAHHYIPFPTRRSQQISQQTAYNQEVSVMAGVAKYVGFPAAPTLSAARTTEIDDDFDKMGVSQFYILLWGTFSSPRVRQISVEHRPVVAPQSGVRGGISSDMPRYTAAEETHHEQQPIWANPQYVQANRPAHLANLTSFTTPAAQKRVIDINAPNGSASTIADNASAANSSTGNTPYGIEQDHRQHAAGQPGTVDFDALDRKSGLRSQSSSPLDVRKGPSTNPTHLFEARHEVPTRNPGYSPPRFGLFGASKRESSPPLSTSNKPLGGIHSSGLMTGSGPSRMIAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.15
43 0.17
44 0.21
45 0.22
46 0.21
47 0.23
48 0.25
49 0.28
50 0.24
51 0.24
52 0.22
53 0.21
54 0.22
55 0.19
56 0.18
57 0.14
58 0.13
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.11
64 0.12
65 0.16
66 0.25
67 0.33
68 0.34
69 0.37
70 0.39
71 0.42
72 0.47
73 0.52
74 0.5
75 0.48
76 0.46
77 0.44
78 0.43
79 0.47
80 0.43
81 0.36
82 0.3
83 0.26
84 0.28
85 0.31
86 0.33
87 0.28
88 0.27
89 0.28
90 0.28
91 0.28
92 0.29
93 0.28
94 0.3
95 0.29
96 0.28
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.15
110 0.17
111 0.24
112 0.33
113 0.4
114 0.49
115 0.58
116 0.67
117 0.71
118 0.78
119 0.81
120 0.82
121 0.82
122 0.79
123 0.73
124 0.66
125 0.6
126 0.54
127 0.44
128 0.34
129 0.25
130 0.2
131 0.19
132 0.15
133 0.12
134 0.08
135 0.1
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.18
144 0.2
145 0.29
146 0.37
147 0.42
148 0.47
149 0.55
150 0.63
151 0.67
152 0.68
153 0.7
154 0.71
155 0.74
156 0.74
157 0.67
158 0.6
159 0.51
160 0.42
161 0.32
162 0.21
163 0.13
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.13
168 0.15
169 0.18
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.29
174 0.36
175 0.34
176 0.36
177 0.41
178 0.42
179 0.42
180 0.42
181 0.36
182 0.27
183 0.23
184 0.18
185 0.1
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.08
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.14
227 0.2
228 0.23
229 0.26
230 0.35
231 0.42
232 0.5
233 0.6
234 0.68
235 0.73
236 0.79
237 0.87
238 0.88
239 0.89
240 0.9
241 0.87
242 0.84
243 0.81
244 0.78
245 0.71
246 0.62
247 0.51
248 0.41
249 0.33
250 0.27
251 0.19
252 0.12
253 0.07
254 0.05
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.18
311 0.24
312 0.21
313 0.22
314 0.25
315 0.23
316 0.23
317 0.23
318 0.22
319 0.17
320 0.2
321 0.18
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.17
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.21
339 0.22
340 0.24
341 0.26
342 0.29
343 0.33
344 0.37
345 0.41
346 0.45
347 0.44
348 0.5
349 0.57
350 0.58
351 0.54
352 0.54
353 0.51
354 0.5
355 0.5
356 0.43
357 0.36
358 0.29
359 0.27
360 0.24
361 0.21
362 0.19
363 0.17
364 0.22
365 0.18
366 0.17
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.14
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.24
379 0.25
380 0.24
381 0.26
382 0.27
383 0.34
384 0.4
385 0.43
386 0.44
387 0.51
388 0.51
389 0.47
390 0.51
391 0.48
392 0.42
393 0.47
394 0.41
395 0.32
396 0.31
397 0.34
398 0.29
399 0.32
400 0.33
401 0.3
402 0.35
403 0.35
404 0.36
405 0.33
406 0.34
407 0.28
408 0.25
409 0.22
410 0.19
411 0.24
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.22
416 0.21
417 0.2
418 0.2
419 0.17
420 0.2
421 0.23
422 0.28
423 0.34
424 0.37
425 0.43
426 0.5
427 0.52
428 0.49
429 0.48
430 0.43
431 0.4
432 0.39
433 0.3
434 0.2
435 0.15
436 0.14
437 0.12
438 0.11
439 0.07
440 0.06
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.13
465 0.15
466 0.14
467 0.13
468 0.12
469 0.09
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.13
485 0.15
486 0.2
487 0.23
488 0.24
489 0.24
490 0.31
491 0.39
492 0.43
493 0.47
494 0.42
495 0.4
496 0.39
497 0.39
498 0.35
499 0.26
500 0.19
501 0.14
502 0.18
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.13
507 0.12
508 0.13
509 0.13
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.13
517 0.15
518 0.15
519 0.16
520 0.18
521 0.22
522 0.29
523 0.3
524 0.29
525 0.25
526 0.29
527 0.34
528 0.34
529 0.34
530 0.3
531 0.29
532 0.29
533 0.37
534 0.36
535 0.29
536 0.28
537 0.33
538 0.33
539 0.33
540 0.35
541 0.28
542 0.24
543 0.25
544 0.25
545 0.17
546 0.18
547 0.18
548 0.16
549 0.16
550 0.15
551 0.17
552 0.18
553 0.2
554 0.22
555 0.23
556 0.23
557 0.27
558 0.33
559 0.3
560 0.32
561 0.3
562 0.34
563 0.34
564 0.33
565 0.29
566 0.23
567 0.22
568 0.18
569 0.17
570 0.1
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.15
589 0.15
590 0.15
591 0.2
592 0.27
593 0.32
594 0.32
595 0.32
596 0.32
597 0.34
598 0.41
599 0.36
600 0.29
601 0.25
602 0.24
603 0.26
604 0.23
605 0.19
606 0.1
607 0.11
608 0.16
609 0.15
610 0.16
611 0.15
612 0.16
613 0.18
614 0.22
615 0.25
616 0.26
617 0.29
618 0.32
619 0.41
620 0.43
621 0.44
622 0.44
623 0.46
624 0.43
625 0.45
626 0.46
627 0.43
628 0.42
629 0.41
630 0.47
631 0.47
632 0.51
633 0.5
634 0.5
635 0.48
636 0.49
637 0.49
638 0.42
639 0.45
640 0.4
641 0.42
642 0.4
643 0.37
644 0.39
645 0.46
646 0.46
647 0.39
648 0.37
649 0.38
650 0.45
651 0.5
652 0.51
653 0.45
654 0.44
655 0.43
656 0.43
657 0.44
658 0.42
659 0.42
660 0.44
661 0.44
662 0.43
663 0.44
664 0.48
665 0.42
666 0.4
667 0.39
668 0.34
669 0.38
670 0.43
671 0.44
672 0.47
673 0.52
674 0.49
675 0.45
676 0.43
677 0.4
678 0.39
679 0.37
680 0.3
681 0.25
682 0.23
683 0.21
684 0.21
685 0.16
686 0.11
687 0.12
688 0.14
689 0.12
690 0.12