Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QJN9

Protein Details
Accession B6QJN9    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-221VDGKRVKKDPKSKPSKDERKASBasic
360-379EVSLKEKLQKRKSQALDEGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-219GKRVKKDPKSKPSKDERK
343-354RGQSKKTKKIKA
365-388EKLQKRKSQALDEGKAPVKATKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG tmf:PMAA_091140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPAATQALTTKVTSGTPYQLDDNQVLRASSALLRHIKSEQKDQEEASTKKTLIGDDDDESDAEGSPSTSELVWLVITTKKHVVDKNRLKPSKISIPNSLNKSSSLNICLITADPQRSVKDIIADPAFPSELSSRITKVIGLTKLRDRYKSFESRRQLLSEHDVFLADDRIIMRLVETLGKVFYQSSKRPIPIRIEQIEKVDGKRVKKDPKSKPSKDERKASFAPLQVVAKEIEKALNCAPVYLAPSTTTSVRVGSTKFTPEQLAENVKAVVNGLTEKFITKGWRNVKAIHVKGTSTMALPIWLADELWLDETDVLEQEEEKKAIENDKSGNKRRNPEEDDAARGQSKKTKKIKAAADEDEVSLKEKLQKRKSQALDEGKAPVKATKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.23
4 0.25
5 0.27
6 0.29
7 0.31
8 0.32
9 0.3
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.21
14 0.18
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.2
19 0.25
20 0.26
21 0.28
22 0.33
23 0.38
24 0.4
25 0.48
26 0.5
27 0.5
28 0.53
29 0.51
30 0.54
31 0.56
32 0.53
33 0.48
34 0.45
35 0.38
36 0.39
37 0.39
38 0.32
39 0.26
40 0.29
41 0.27
42 0.24
43 0.27
44 0.24
45 0.22
46 0.22
47 0.18
48 0.14
49 0.11
50 0.09
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.19
66 0.21
67 0.27
68 0.32
69 0.39
70 0.47
71 0.57
72 0.64
73 0.7
74 0.71
75 0.68
76 0.67
77 0.66
78 0.65
79 0.63
80 0.58
81 0.55
82 0.6
83 0.64
84 0.65
85 0.6
86 0.5
87 0.43
88 0.41
89 0.34
90 0.29
91 0.25
92 0.21
93 0.18
94 0.17
95 0.17
96 0.14
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.19
102 0.2
103 0.22
104 0.23
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.21
109 0.2
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.12
115 0.13
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.18
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.29
130 0.37
131 0.39
132 0.42
133 0.39
134 0.39
135 0.45
136 0.52
137 0.52
138 0.53
139 0.57
140 0.57
141 0.57
142 0.53
143 0.47
144 0.39
145 0.39
146 0.32
147 0.27
148 0.22
149 0.2
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.14
171 0.17
172 0.22
173 0.25
174 0.29
175 0.31
176 0.35
177 0.37
178 0.37
179 0.42
180 0.39
181 0.39
182 0.38
183 0.37
184 0.36
185 0.31
186 0.26
187 0.26
188 0.26
189 0.25
190 0.31
191 0.36
192 0.43
193 0.5
194 0.6
195 0.63
196 0.7
197 0.79
198 0.77
199 0.79
200 0.81
201 0.83
202 0.8
203 0.79
204 0.72
205 0.69
206 0.65
207 0.61
208 0.54
209 0.45
210 0.4
211 0.33
212 0.3
213 0.22
214 0.21
215 0.18
216 0.13
217 0.12
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.09
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.16
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.19
247 0.18
248 0.21
249 0.22
250 0.24
251 0.2
252 0.21
253 0.2
254 0.19
255 0.18
256 0.15
257 0.12
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.16
267 0.19
268 0.27
269 0.33
270 0.41
271 0.43
272 0.45
273 0.52
274 0.56
275 0.54
276 0.53
277 0.47
278 0.39
279 0.38
280 0.38
281 0.3
282 0.21
283 0.2
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.07
304 0.1
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.17
310 0.22
311 0.24
312 0.25
313 0.28
314 0.38
315 0.47
316 0.53
317 0.6
318 0.62
319 0.68
320 0.72
321 0.76
322 0.73
323 0.7
324 0.71
325 0.65
326 0.65
327 0.58
328 0.54
329 0.48
330 0.42
331 0.38
332 0.37
333 0.41
334 0.45
335 0.52
336 0.59
337 0.63
338 0.71
339 0.77
340 0.79
341 0.79
342 0.74
343 0.7
344 0.62
345 0.55
346 0.48
347 0.39
348 0.32
349 0.24
350 0.21
351 0.24
352 0.3
353 0.4
354 0.48
355 0.56
356 0.62
357 0.72
358 0.77
359 0.77
360 0.8
361 0.8
362 0.74
363 0.68
364 0.67
365 0.6
366 0.54
367 0.46
368 0.41