FuNGI

W7HR60

Protein Details

Accession

W7HR60

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
264-295	STTSGGGKKRDRDRKRRREKEREKEREKEKEK	Basic
426-449	KAEGGGKRQRYRNKDKRKDDTPAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-301	GGKKRDRDRKRRREKEREKEREKEKEKAAAAAA
309-317	DKAKKGDKK
426-443	KAEGGGKRQRYRNKDKRK
488-495	RGGRNKGR
563-581	RGRGRGFGPFAPRGGRGRG

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 8, extr 4, cyto_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MATPGIIKIKTRGKGNAITVMQPLASAVSAEPTATPSATPPVTTAPAPAPPAPKLKVVIRHLPASMTEQEYNILTADFLNKETVEWSSFTPGKVPQDRNKSTTYAIAYAKARSTESLVQIKAGLNGKALVDSRGQEARLQVEFSPFQKIPRIRGRPRHDGRSGTIDNDPEFITFLENLKHTGPNAATKSEGGDGEKTEEDHRKYYDPLTAPIPTYDAPIIEPGTKVTTTPLVEFIKQQKLNPKIKDKGKGKVIVLAADDEDAKSTTSGGGKKRDRDRKRRREKEREKEREKEKEKAAAAAAATAVSSSDKAKKGDKKAAAPAIATPVATKQSSEPTTRPSRRERGSAGLTAASILQRDLGLVAGPGRGRRNRGNAEATNTEQKSDQATQAPAPAKTTAPVATASSNNESSSQQATAPPPEAAAPAKAEGGGKRQRYRNKDKRKDDTPAAPPTPAQPSTSGTADVVPTPASTPAPSPSQQPPAQNSRGRGGRNKGRGANNRAPAAAQATPPQPSQPAAGNSAASTPTPAAAPSASEASASSSTPAIPTGPKSMQQGPSNHHGNRGRGRGFGPFAPRGGRGRGQSRGGGYHGAGGGGANSGASAPAAQAPAGGDQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.58
3	0.59
4	0.53
5	0.5
6	0.45
7	0.39
8	0.32
9	0.25
10	0.2
11	0.12
12	0.1
13	0.08
14	0.07
15	0.08
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.11
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.17
25	0.17
26	0.18
27	0.17
28	0.2
29	0.22
30	0.22
31	0.23
32	0.2
33	0.24
34	0.27
35	0.29
36	0.29
37	0.3
38	0.37
39	0.37
40	0.38
41	0.38
42	0.41
43	0.46
44	0.48
45	0.54
46	0.51
47	0.52
48	0.49
49	0.46
50	0.41
51	0.37
52	0.34
53	0.3
54	0.26
55	0.23
56	0.24
57	0.23
58	0.22
59	0.17
60	0.13
61	0.09
62	0.09
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.14
70	0.15
71	0.13
72	0.14
73	0.14
74	0.2
75	0.21
76	0.21
77	0.23
78	0.25
79	0.33
80	0.4
81	0.46
82	0.48
83	0.57
84	0.62
85	0.63
86	0.62
87	0.56
88	0.49
89	0.47
90	0.41
91	0.36
92	0.32
93	0.33
94	0.31
95	0.31
96	0.31
97	0.27
98	0.25
99	0.2
100	0.24
101	0.24
102	0.29
103	0.33
104	0.31
105	0.3
106	0.31
107	0.31
108	0.3
109	0.28
110	0.23
111	0.17
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.18
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.17
120	0.19
121	0.19
122	0.19
123	0.2
124	0.22
125	0.21
126	0.22
127	0.18
128	0.2
129	0.22
130	0.21
131	0.27
132	0.23
133	0.24
134	0.3
135	0.32
136	0.36
137	0.45
138	0.54
139	0.56
140	0.66
141	0.72
142	0.75
143	0.79
144	0.8
145	0.75
146	0.69
147	0.63
148	0.62
149	0.55
150	0.47
151	0.42
152	0.35
153	0.3
154	0.27
155	0.24
156	0.15
157	0.15
158	0.12
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.13
165	0.14
166	0.15
167	0.14
168	0.17
169	0.17
170	0.22
171	0.23
172	0.22
173	0.21
174	0.21
175	0.22
176	0.2
177	0.19
178	0.14
179	0.13
180	0.13
181	0.15
182	0.16
183	0.15
184	0.17
185	0.23
186	0.24
187	0.25
188	0.27
189	0.26
190	0.27
191	0.28
192	0.3
193	0.26
194	0.25
195	0.26
196	0.25
197	0.23
198	0.22
199	0.22
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.11
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.1
208	0.1
209	0.09
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.18
218	0.17
219	0.18
220	0.22
221	0.26
222	0.31
223	0.32
224	0.33
225	0.37
226	0.44
227	0.52
228	0.55
229	0.58
230	0.57
231	0.62
232	0.7
233	0.66
234	0.64
235	0.63
236	0.62
237	0.54
238	0.51
239	0.45
240	0.37
241	0.33
242	0.26
243	0.19
244	0.14
245	0.13
246	0.08
247	0.08
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.09
254	0.14
255	0.17
256	0.26
257	0.3
258	0.38
259	0.47
260	0.57
261	0.63
262	0.71
263	0.78
264	0.8
265	0.88
266	0.91
267	0.92
268	0.93
269	0.94
270	0.94
271	0.94
272	0.94
273	0.89
274	0.87
275	0.84
276	0.83
277	0.76
278	0.72
279	0.63
280	0.59
281	0.53
282	0.46
283	0.38
284	0.29
285	0.24
286	0.18
287	0.15
288	0.08
289	0.07
290	0.05
291	0.05
292	0.03
293	0.04
294	0.05
295	0.1
296	0.12
297	0.14
298	0.21
299	0.28
300	0.34
301	0.41
302	0.44
303	0.44
304	0.47
305	0.5
306	0.44
307	0.37
308	0.32
309	0.27
310	0.23
311	0.18
312	0.12
313	0.1
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.09
318	0.15
319	0.17
320	0.2
321	0.2
322	0.25
323	0.35
324	0.4
325	0.44
326	0.45
327	0.51
328	0.51
329	0.54
330	0.51
331	0.47
332	0.45
333	0.41
334	0.35
335	0.27
336	0.23
337	0.19
338	0.16
339	0.1
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.06
351	0.06
352	0.09
353	0.14
354	0.16
355	0.2
356	0.25
357	0.33
358	0.36
359	0.41
360	0.46
361	0.43
362	0.46
363	0.44
364	0.42
365	0.41
366	0.37
367	0.32
368	0.25
369	0.24
370	0.23
371	0.22
372	0.22
373	0.18
374	0.19
375	0.19
376	0.24
377	0.26
378	0.22
379	0.22
380	0.21
381	0.17
382	0.17
383	0.18
384	0.13
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.16
391	0.17
392	0.17
393	0.16
394	0.17
395	0.16
396	0.17
397	0.17
398	0.15
399	0.13
400	0.15
401	0.17
402	0.18
403	0.19
404	0.17
405	0.15
406	0.15
407	0.16
408	0.13
409	0.12
410	0.11
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.19
417	0.25
418	0.3
419	0.36
420	0.43
421	0.51
422	0.59
423	0.7
424	0.73
425	0.77
426	0.82
427	0.85
428	0.87
429	0.86
430	0.84
431	0.79
432	0.77
433	0.73
434	0.71
435	0.62
436	0.54
437	0.47
438	0.42
439	0.42
440	0.34
441	0.28
442	0.21
443	0.22
444	0.25
445	0.25
446	0.23
447	0.17
448	0.17
449	0.16
450	0.15
451	0.13
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.13
460	0.17
461	0.18
462	0.22
463	0.26
464	0.33
465	0.36
466	0.4
467	0.43
468	0.47
469	0.54
470	0.54
471	0.51
472	0.51
473	0.53
474	0.52
475	0.54
476	0.55
477	0.56
478	0.61
479	0.65
480	0.65
481	0.69
482	0.74
483	0.75
484	0.74
485	0.71
486	0.65
487	0.58
488	0.51
489	0.42
490	0.37
491	0.3
492	0.22
493	0.21
494	0.21
495	0.23
496	0.24
497	0.24
498	0.21
499	0.2
500	0.21
501	0.23
502	0.23
503	0.24
504	0.25
505	0.24
506	0.23
507	0.23
508	0.22
509	0.16
510	0.14
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.09
517	0.1
518	0.1
519	0.12
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.14
524	0.15
525	0.14
526	0.13
527	0.12
528	0.12
529	0.12
530	0.13
531	0.11
532	0.12
533	0.15
534	0.21
535	0.23
536	0.26
537	0.31
538	0.38
539	0.44
540	0.48
541	0.5
542	0.48
543	0.54
544	0.58
545	0.54
546	0.55
547	0.54
548	0.56
549	0.59
550	0.63
551	0.57
552	0.52
553	0.53
554	0.5
555	0.48
556	0.45
557	0.44
558	0.38
559	0.38
560	0.38
561	0.41
562	0.38
563	0.4
564	0.4
565	0.4
566	0.44
567	0.49
568	0.49
569	0.5
570	0.5
571	0.47
572	0.43
573	0.39
574	0.33
575	0.3
576	0.26
577	0.21
578	0.18
579	0.14
580	0.12
581	0.1
582	0.09
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.1

W7HR60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer