Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7IEH8

Protein Details
Accession W7IEH8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MEDAKSRRKKKVLLMGKSGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-11SRRKKK
Subcellular Location(s) plas 8, cyto_mito 6.833, mito 6.5, cyto 6, cyto_nucl 5.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006762  Gtr1_RagA  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR039397  RagA/B  
IPR034804  SQR/QFR_C/D  
IPR018495  Succ_DH_cyt_bsu_CS  
IPR014314  Succ_DH_cytb556  
IPR000701  SuccDH_FuR_B_TM-su  
Gene Ontology GO:1990131  C:Gtr1-Gtr2 GTPase complex  
GO:0045281  C:succinate dehydrogenase complex  
GO:0009055  F:electron transfer activity  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000104  F:succinate dehydrogenase activity  
GO:0006099  P:tricarboxylic acid cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF04670  Gtr1_RagA  
PF01127  Sdh_cyt  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01001  SDH_CYT_2  
CDD cd11384  RagA_like  
cd03499  SQR_TypeC_SdhC  
Amino Acid Sequences MEDAKSRRKKKVLLMGKSGSGKSSMRSIVFSNYVAKDTRRLGATIDVEHNHVRFLGGLTLNLWDCGGQNAFIDNYLSSQRDHIFKHVEVLIYVFDIESREFDRDLLIYISCVEALRDNSPGAHIFCLIHKMDLVQPEYRDAAFQEHAVILRRKSLGMEITCFATSIWDETLYKAWATIVYTLIPNGPILERHLTAFAEIAEAEEVILFERTTFLVIAHVTRGPVQNPFPDRFEKISNIVKQFKQSCSKMASNFTAFELRAHKFSAFIDILTPNTYILVVMPANAAESTTTLMNIATCRKHFEKLEVIDRAVGSLLTTESVPASSASSILASQRLARPVSPHLTIYQPQLTWYLSMTNRITGVAISGIFYLFTIGYVLASPFGVNMSAASVSRKWGELSAPVKLAIKAPLATMFSFHCWNGVRHLVWDSARELSVRGVYRTGYGVLGLTVASTVGLLLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.75
3 0.73
4 0.7
5 0.61
6 0.51
7 0.44
8 0.36
9 0.29
10 0.32
11 0.3
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.3
16 0.32
17 0.32
18 0.31
19 0.28
20 0.3
21 0.3
22 0.29
23 0.3
24 0.3
25 0.33
26 0.29
27 0.28
28 0.27
29 0.32
30 0.34
31 0.32
32 0.34
33 0.3
34 0.32
35 0.34
36 0.32
37 0.25
38 0.22
39 0.18
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.09
51 0.09
52 0.12
53 0.12
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.09
61 0.1
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.16
66 0.19
67 0.23
68 0.25
69 0.28
70 0.31
71 0.3
72 0.34
73 0.33
74 0.3
75 0.25
76 0.24
77 0.19
78 0.14
79 0.14
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.19
120 0.21
121 0.19
122 0.19
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.18
127 0.14
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.17
135 0.19
136 0.16
137 0.19
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.2
144 0.22
145 0.19
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.16
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.17
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.25
218 0.25
219 0.26
220 0.23
221 0.24
222 0.29
223 0.3
224 0.33
225 0.35
226 0.34
227 0.37
228 0.39
229 0.39
230 0.4
231 0.37
232 0.36
233 0.37
234 0.39
235 0.36
236 0.37
237 0.35
238 0.29
239 0.28
240 0.26
241 0.22
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.18
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.06
263 0.05
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.19
285 0.21
286 0.26
287 0.26
288 0.29
289 0.34
290 0.36
291 0.43
292 0.39
293 0.37
294 0.35
295 0.33
296 0.29
297 0.21
298 0.16
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.14
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.21
324 0.25
325 0.29
326 0.28
327 0.25
328 0.24
329 0.27
330 0.28
331 0.3
332 0.28
333 0.24
334 0.23
335 0.24
336 0.23
337 0.19
338 0.18
339 0.19
340 0.16
341 0.22
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.21
346 0.2
347 0.14
348 0.14
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.11
376 0.11
377 0.13
378 0.15
379 0.16
380 0.15
381 0.16
382 0.18
383 0.23
384 0.25
385 0.27
386 0.27
387 0.27
388 0.28
389 0.27
390 0.27
391 0.23
392 0.23
393 0.19
394 0.19
395 0.21
396 0.22
397 0.21
398 0.2
399 0.19
400 0.19
401 0.21
402 0.2
403 0.21
404 0.21
405 0.22
406 0.27
407 0.31
408 0.28
409 0.28
410 0.31
411 0.32
412 0.3
413 0.32
414 0.28
415 0.25
416 0.25
417 0.23
418 0.21
419 0.19
420 0.24
421 0.24
422 0.23
423 0.22
424 0.22
425 0.23
426 0.24
427 0.23
428 0.17
429 0.15
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.09
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.04