Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HZ37

Protein Details
Accession W7HZ37    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-319PNPPNVRSSGRKRRREYGESHydrophilic
334-360SGYDEEEARKKKKKRKFPEYDDRVGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-349RKKKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.999, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MNANKVTSPRQNQHQSSTNSLPTPRSPTIDAMPTTGTDDAMDLDRASSLKRRRSQGDLGDDDRPRKSRSRSREPMEIDVPSAISPFSRPRRTVPTMEELLAMPMTGPPSWLNTKKHIPQRPDLTSNLIEKYGLSAIATSVARTNATGQKQKLRKSYKGKIGGLSGKNEVVTTVQQMVVPEGQEGWGQPVPQLIKGGLLEMLDIPDEEWHNLKVLGKELPRNGSLGRPLDFGALRKGLSNWSKGPIPDYDASWLALEEPPSRSGNSITSGHPAPNSAALNINKSGTPAASASPNGVNTVSPNPPNVRSSGRKRRREYGESGWEGYGEEPEDEVGSGYDEEEARKKKKKRKFPEYDDRVGGGGMINMPVNHAHAVGVGGGGYYQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.68
3 0.67
4 0.66
5 0.61
6 0.54
7 0.53
8 0.49
9 0.44
10 0.48
11 0.43
12 0.41
13 0.39
14 0.39
15 0.41
16 0.43
17 0.4
18 0.33
19 0.31
20 0.28
21 0.27
22 0.24
23 0.19
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.19
35 0.25
36 0.34
37 0.41
38 0.48
39 0.52
40 0.59
41 0.66
42 0.66
43 0.68
44 0.64
45 0.61
46 0.61
47 0.59
48 0.55
49 0.52
50 0.46
51 0.41
52 0.43
53 0.49
54 0.51
55 0.58
56 0.66
57 0.71
58 0.74
59 0.79
60 0.76
61 0.73
62 0.67
63 0.57
64 0.47
65 0.37
66 0.32
67 0.22
68 0.18
69 0.11
70 0.08
71 0.09
72 0.17
73 0.26
74 0.32
75 0.34
76 0.39
77 0.48
78 0.53
79 0.57
80 0.53
81 0.52
82 0.48
83 0.46
84 0.42
85 0.33
86 0.28
87 0.22
88 0.17
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.12
96 0.18
97 0.25
98 0.27
99 0.32
100 0.4
101 0.47
102 0.56
103 0.59
104 0.58
105 0.6
106 0.65
107 0.66
108 0.62
109 0.56
110 0.51
111 0.47
112 0.45
113 0.37
114 0.29
115 0.22
116 0.18
117 0.18
118 0.14
119 0.1
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.16
132 0.21
133 0.26
134 0.28
135 0.36
136 0.41
137 0.47
138 0.53
139 0.55
140 0.59
141 0.63
142 0.69
143 0.7
144 0.73
145 0.69
146 0.62
147 0.59
148 0.58
149 0.5
150 0.44
151 0.36
152 0.27
153 0.25
154 0.23
155 0.18
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.15
202 0.16
203 0.2
204 0.22
205 0.24
206 0.22
207 0.23
208 0.21
209 0.19
210 0.22
211 0.2
212 0.19
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.18
224 0.2
225 0.23
226 0.21
227 0.23
228 0.25
229 0.24
230 0.26
231 0.21
232 0.23
233 0.2
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.14
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.17
254 0.2
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.19
259 0.15
260 0.18
261 0.17
262 0.14
263 0.2
264 0.2
265 0.23
266 0.23
267 0.23
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.22
288 0.24
289 0.27
290 0.29
291 0.29
292 0.32
293 0.37
294 0.47
295 0.54
296 0.61
297 0.68
298 0.73
299 0.8
300 0.82
301 0.8
302 0.77
303 0.75
304 0.75
305 0.69
306 0.65
307 0.55
308 0.46
309 0.4
310 0.32
311 0.24
312 0.15
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.19
327 0.26
328 0.32
329 0.42
330 0.51
331 0.59
332 0.69
333 0.77
334 0.81
335 0.86
336 0.89
337 0.91
338 0.93
339 0.92
340 0.9
341 0.82
342 0.72
343 0.61
344 0.49
345 0.39
346 0.28
347 0.2
348 0.13
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.06