Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7HRD0

Protein Details
Accession W7HRD0    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-122TASPYFPPPSRPSRKRKRAAGPAAVKDEHydrophilic
127-154DIPEPKPKPAKRTPAKPKRKNGEPIEIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-116SRPSRKRKRAAGP
130-147EPKPKPAKRTPAKPKRKN
509-518RPRRNIRRKR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MRSAKSRAAQKIRTFSNPTTTTQPKRARTSASTTTIVSKLPASRNRANTSRAVKREDEDPEVQEPSEESELSSAPSDLESAYSEAAASDDEEEYTASPYFPPPSRPSRKRKRAAGPAAVKDEDSSDDIPEPKPKPAKRTPAKPKRKNGEPIEIRYDPPDNWREFYDAIKEMRLRIPAPVDTVGCARLAQTDVPPVVKRFQHLIALMMSSQTKDQVTGDAMRRLQTELPGGLTLESILAVAPARLNEMIGQVGFHNRKTEYIKKAAVVLRDKFGGDIPSTIEDMMSLDGVGPKMSYLLEQCAWGRSSGIGVDVHVHRIANMFKWVPASSEPETTRIYLQSWLPRDLWTEINWLLVGFGQSVCLPRGRRCDICTLGPKSTGGNGACKAGVVVKGKTIKREIVVKQEIKQEVKVEEDGEGSVVKKEEEGVEPGPAWADAASPADPDTKAAVKEEQTGDEDIVVKKEEVVEDSVLERTDPLGMDPDVKVAIKEETTETQEFPVMPDIEDAVGRPRRNIRRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.65
3 0.66
4 0.6
5 0.55
6 0.55
7 0.58
8 0.57
9 0.6
10 0.66
11 0.64
12 0.7
13 0.71
14 0.7
15 0.67
16 0.68
17 0.67
18 0.63
19 0.57
20 0.5
21 0.5
22 0.44
23 0.38
24 0.31
25 0.26
26 0.27
27 0.33
28 0.39
29 0.43
30 0.49
31 0.57
32 0.63
33 0.64
34 0.62
35 0.62
36 0.64
37 0.65
38 0.63
39 0.6
40 0.56
41 0.53
42 0.56
43 0.53
44 0.5
45 0.44
46 0.42
47 0.39
48 0.38
49 0.36
50 0.29
51 0.24
52 0.22
53 0.2
54 0.16
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.09
85 0.11
86 0.16
87 0.17
88 0.23
89 0.27
90 0.37
91 0.48
92 0.57
93 0.66
94 0.73
95 0.82
96 0.85
97 0.89
98 0.89
99 0.89
100 0.89
101 0.88
102 0.85
103 0.8
104 0.76
105 0.67
106 0.56
107 0.45
108 0.37
109 0.28
110 0.23
111 0.17
112 0.13
113 0.15
114 0.17
115 0.18
116 0.24
117 0.24
118 0.28
119 0.36
120 0.39
121 0.45
122 0.53
123 0.62
124 0.65
125 0.74
126 0.78
127 0.81
128 0.89
129 0.89
130 0.91
131 0.89
132 0.89
133 0.88
134 0.83
135 0.83
136 0.78
137 0.74
138 0.72
139 0.63
140 0.55
141 0.48
142 0.43
143 0.33
144 0.32
145 0.33
146 0.27
147 0.27
148 0.28
149 0.28
150 0.27
151 0.28
152 0.26
153 0.23
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.25
159 0.26
160 0.21
161 0.2
162 0.22
163 0.19
164 0.21
165 0.21
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.21
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.13
194 0.12
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.14
204 0.17
205 0.19
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.21
210 0.2
211 0.16
212 0.15
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.17
244 0.22
245 0.29
246 0.28
247 0.32
248 0.33
249 0.32
250 0.37
251 0.36
252 0.35
253 0.33
254 0.3
255 0.26
256 0.25
257 0.25
258 0.2
259 0.19
260 0.15
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.07
296 0.06
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.13
305 0.11
306 0.14
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.2
314 0.18
315 0.24
316 0.24
317 0.25
318 0.26
319 0.25
320 0.24
321 0.2
322 0.19
323 0.16
324 0.19
325 0.22
326 0.24
327 0.26
328 0.25
329 0.25
330 0.26
331 0.26
332 0.25
333 0.19
334 0.2
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.13
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.13
349 0.15
350 0.19
351 0.27
352 0.32
353 0.35
354 0.36
355 0.44
356 0.43
357 0.47
358 0.51
359 0.48
360 0.44
361 0.42
362 0.39
363 0.32
364 0.31
365 0.29
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.2
371 0.19
372 0.17
373 0.14
374 0.18
375 0.17
376 0.17
377 0.21
378 0.29
379 0.3
380 0.35
381 0.36
382 0.34
383 0.34
384 0.42
385 0.4
386 0.43
387 0.51
388 0.49
389 0.5
390 0.55
391 0.56
392 0.5
393 0.49
394 0.43
395 0.35
396 0.35
397 0.32
398 0.25
399 0.2
400 0.19
401 0.16
402 0.13
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.14
412 0.17
413 0.16
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.14
419 0.12
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.12
428 0.12
429 0.13
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.19
434 0.22
435 0.22
436 0.28
437 0.29
438 0.28
439 0.28
440 0.28
441 0.26
442 0.23
443 0.24
444 0.19
445 0.18
446 0.18
447 0.15
448 0.14
449 0.16
450 0.16
451 0.15
452 0.17
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.18
457 0.16
458 0.15
459 0.13
460 0.1
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.13
465 0.13
466 0.16
467 0.16
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.14
473 0.16
474 0.14
475 0.16
476 0.18
477 0.2
478 0.26
479 0.28
480 0.27
481 0.26
482 0.27
483 0.25
484 0.23
485 0.26
486 0.21
487 0.2
488 0.2
489 0.2
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.19
494 0.25
495 0.25
496 0.3
497 0.39
498 0.49