FuNGI

B6Q794

Protein Details

Accession

B6Q794

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-175	NSWTSRKERKADANRWHARL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10, pero 9, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	tmf:PMAA_015580 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MEKDLAALSINEYPLKHSALLDSGSSIHVFNEFERFVNIRKAQVGDVLWAGSNQVPILGYGEVDIQVHGLGGKLQFLRLYNVAYCKDFVANLVSFYQLRKQGIWWDTRRGYNCLRGKTDQVLAYLKEKEGQFVLEYIKHDHPLVKTGFAIRRHRFNSWTSRKERKADANRWHARLGHPGPEVLKHLAGAAKGVRLTGISKGPTTVECESCGTSKAQRIIRREERTPPHAPGEHLAIDFHDFAESTMHGEKTLMLITDRFSGFMWDYYMTSHRGDEILETLKWFLDYLEKAYMISPVKIEMDNEIAKRPEVKHYLEHEKRIILQPSPAHTQALNGGAERSGAIIKTKGRSMRKGARLPFDLWPEIVRAAVYLYNRTPRYASNWKTPYDRFTTHAAWKSGIVIENQKPQLAHLKVYGCKAYALTTEYMKKENRLQRFNPRAWIGYLVGYDSTNVYRIWNPTTGRIIRTRDVIFNEDEVFSGNIEHLKDDLLHVSTQEITRLLTKLDLGTDADFDDEYADLIDHITDVVFDGDKVNIEPDRLTRSATGLGSQESSQLDSRNPSGPTLTIGEGLLDGIDKYTYPTPPETPPSALLAASITIVSNNDFDLHQSSALAAGMSTDGECTGGTLVQEATARERIGGAPSGVGTDRTGGSRADFEERTGGALDLRDSIGSPHLIASLDETIHGKQFPGDRFGESLRKNRECLGETPIRNNAASLTTQQGELNPWRFAFLAGTRHRQYEVNTVKFDYASLQRRLRSGRRLQSLLVRDLPPAPKSHREVETHPLGWLFEEAEKAHLKSHDPYGSWTTVPIGKAKGKQILDCMWIYVYKQDKKGRLVKCKARLVVRGDQEKRDDMRDTYAATLAARSFRTFMAIAARFDLELKQYDAVNAFVNAKLDEEIFMRMAPGYRESGKIYQLNKALYGLRRSPLLWQKELTSTLIKLGFRAVPHEPCCMLKSGVMLFFYVDDIVVAYKKSRQLEANSILNQLRAKYNISGGEDLEWFLGMRIIRDRSNKMIWLSQATYIDKIAKLADTQQADDTPMSREELLPYEGTATYKSQHQYQRKVGSIMYAAVSTRPDVAFAVSRLARFLSNPGPEHHKAADKVLCYLKRHRAYALRLGGGDDFSVLTDASFADNTLDRKSSQAYVMTLFGGTIGWQANKQDTVTTSTTEAELLALAQGVKEGKYVLRLLLELDIRFQTPTLHVYCDNQQTLGLLEKDAPRLRTKLRHVDIHNHWVRQEVQNGDVQVHYMPTKDMIANGLTKALSRQEHHNFLKQIGVDDIGERLAPQQKDIENPDIEELLSLNDMPDNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.24
3	0.23
4	0.2
5	0.21
6	0.22
7	0.24
8	0.2
9	0.19
10	0.17
11	0.17
12	0.17
13	0.15
14	0.12
15	0.12
16	0.13
17	0.12
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.21
22	0.23
23	0.24
24	0.33
25	0.34
26	0.32
27	0.35
28	0.36
29	0.34
30	0.37
31	0.34
32	0.27
33	0.25
34	0.22
35	0.19
36	0.16
37	0.17
38	0.13
39	0.13
40	0.1
41	0.1
42	0.09
43	0.09
44	0.12
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.09
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.06
57	0.08
58	0.08
59	0.12
60	0.13
61	0.14
62	0.16
63	0.17
64	0.22
65	0.21
66	0.24
67	0.23
68	0.29
69	0.3
70	0.3
71	0.29
72	0.26
73	0.26
74	0.23
75	0.21
76	0.21
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.19
81	0.18
82	0.2
83	0.25
84	0.25
85	0.26
86	0.26
87	0.27
88	0.34
89	0.4
90	0.47
91	0.45
92	0.49
93	0.52
94	0.59
95	0.6
96	0.57
97	0.57
98	0.57
99	0.6
100	0.58
101	0.59
102	0.55
103	0.56
104	0.55
105	0.55
106	0.48
107	0.44
108	0.41
109	0.37
110	0.38
111	0.36
112	0.31
113	0.3
114	0.28
115	0.26
116	0.24
117	0.23
118	0.19
119	0.19
120	0.22
121	0.2
122	0.22
123	0.26
124	0.27
125	0.27
126	0.28
127	0.3
128	0.27
129	0.31
130	0.31
131	0.27
132	0.26
133	0.32
134	0.37
135	0.41
136	0.5
137	0.47
138	0.55
139	0.58
140	0.6
141	0.57
142	0.58
143	0.61
144	0.61
145	0.66
146	0.65
147	0.71
148	0.74
149	0.76
150	0.77
151	0.77
152	0.77
153	0.77
154	0.79
155	0.8
156	0.81
157	0.78
158	0.73
159	0.64
160	0.56
161	0.56
162	0.5
163	0.46
164	0.39
165	0.38
166	0.37
167	0.36
168	0.38
169	0.3
170	0.26
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.18
175	0.18
176	0.15
177	0.15
178	0.15
179	0.15
180	0.13
181	0.12
182	0.13
183	0.15
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.19
188	0.2
189	0.2
190	0.25
191	0.25
192	0.21
193	0.22
194	0.24
195	0.24
196	0.24
197	0.25
198	0.21
199	0.22
200	0.26
201	0.31
202	0.36
203	0.41
204	0.46
205	0.54
206	0.62
207	0.64
208	0.63
209	0.66
210	0.67
211	0.67
212	0.67
213	0.61
214	0.58
215	0.53
216	0.51
217	0.43
218	0.4
219	0.35
220	0.3
221	0.26
222	0.2
223	0.2
224	0.18
225	0.16
226	0.11
227	0.09
228	0.09
229	0.11
230	0.1
231	0.1
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.14
239	0.11
240	0.09
241	0.1
242	0.11
243	0.16
244	0.16
245	0.15
246	0.14
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.15
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.12
262	0.14
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.1
271	0.12
272	0.13
273	0.15
274	0.18
275	0.17
276	0.18
277	0.18
278	0.22
279	0.18
280	0.18
281	0.15
282	0.14
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.13
287	0.16
288	0.19
289	0.2
290	0.21
291	0.21
292	0.21
293	0.25
294	0.25
295	0.28
296	0.3
297	0.32
298	0.36
299	0.42
300	0.53
301	0.53
302	0.56
303	0.51
304	0.47
305	0.47
306	0.46
307	0.43
308	0.32
309	0.33
310	0.31
311	0.33
312	0.37
313	0.34
314	0.29
315	0.26
316	0.25
317	0.23
318	0.23
319	0.19
320	0.14
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.11
330	0.14
331	0.17
332	0.21
333	0.28
334	0.33
335	0.38
336	0.46
337	0.53
338	0.59
339	0.64
340	0.65
341	0.65
342	0.63
343	0.6
344	0.56
345	0.51
346	0.42
347	0.35
348	0.3
349	0.24
350	0.21
351	0.18
352	0.13
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.1
357	0.12
358	0.14
359	0.21
360	0.22
361	0.23
362	0.23
363	0.22
364	0.3
365	0.37
366	0.39
367	0.42
368	0.46
369	0.48
370	0.52
371	0.52
372	0.49
373	0.45
374	0.43
375	0.35
376	0.37
377	0.39
378	0.4
379	0.45
380	0.41
381	0.35
382	0.33
383	0.32
384	0.28
385	0.25
386	0.2
387	0.2
388	0.22
389	0.29
390	0.29
391	0.29
392	0.27
393	0.26
394	0.34
395	0.28
396	0.27
397	0.24
398	0.28
399	0.29
400	0.32
401	0.32
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.18
406	0.15
407	0.15
408	0.14
409	0.16
410	0.2
411	0.21
412	0.25
413	0.25
414	0.26
415	0.32
416	0.38
417	0.44
418	0.47
419	0.51
420	0.57
421	0.65
422	0.64
423	0.62
424	0.56
425	0.5
426	0.43
427	0.4
428	0.3
429	0.23
430	0.21
431	0.15
432	0.13
433	0.12
434	0.11
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.11
441	0.13
442	0.16
443	0.2
444	0.2
445	0.22
446	0.29
447	0.3
448	0.3
449	0.34
450	0.35
451	0.32
452	0.36
453	0.34
454	0.31
455	0.32
456	0.31
457	0.26
458	0.24
459	0.23
460	0.18
461	0.16
462	0.14
463	0.12
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.08
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.08
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.14
525	0.14
526	0.15
527	0.14
528	0.15
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.12
536	0.13
537	0.1
538	0.12
539	0.11
540	0.12
541	0.12
542	0.13
543	0.15
544	0.17
545	0.17
546	0.16
547	0.15
548	0.15
549	0.15
550	0.16
551	0.14
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.06
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.05
564	0.07
565	0.08
566	0.1
567	0.12
568	0.14
569	0.17
570	0.21
571	0.21
572	0.21
573	0.21
574	0.22
575	0.2
576	0.17
577	0.15
578	0.11
579	0.09
580	0.07
581	0.06
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.08
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.1
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.08
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.05
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.08
636	0.07
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.12
641	0.12
642	0.12
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.12
647	0.11
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.05
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.07
672	0.08
673	0.13
674	0.14
675	0.17
676	0.18
677	0.17
678	0.19
679	0.21
680	0.26
681	0.24
682	0.3
683	0.34
684	0.35
685	0.35
686	0.37
687	0.38
688	0.34
689	0.33
690	0.32
691	0.32
692	0.31
693	0.33
694	0.33
695	0.3
696	0.27
697	0.25
698	0.19
699	0.13
700	0.13
701	0.12
702	0.11
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.11
707	0.12
708	0.15
709	0.17
710	0.15
711	0.15
712	0.15
713	0.15
714	0.15
715	0.14
716	0.13
717	0.19
718	0.21
719	0.28
720	0.28
721	0.29
722	0.3
723	0.29
724	0.29
725	0.31
726	0.35
727	0.33
728	0.33
729	0.33
730	0.32
731	0.3
732	0.28
733	0.2
734	0.19
735	0.22
736	0.27
737	0.3
738	0.31
739	0.34
740	0.39
741	0.42
742	0.44
743	0.46
744	0.48
745	0.51
746	0.51
747	0.5
748	0.51
749	0.49
750	0.44
751	0.39
752	0.31
753	0.26
754	0.28
755	0.29
756	0.23
757	0.22
758	0.23
759	0.25
760	0.28
761	0.33
762	0.34
763	0.35
764	0.38
765	0.41
766	0.42
767	0.36
768	0.33
769	0.28
770	0.23
771	0.2
772	0.17
773	0.11
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.13
781	0.14
782	0.15
783	0.16
784	0.22
785	0.22
786	0.21
787	0.24
788	0.26
789	0.26
790	0.24
791	0.22
792	0.18
793	0.17
794	0.17
795	0.16
796	0.16
797	0.18
798	0.22
799	0.25
800	0.31
801	0.29
802	0.3
803	0.31
804	0.31
805	0.3
806	0.26
807	0.23
808	0.17
809	0.16
810	0.15
811	0.17
812	0.21
813	0.23
814	0.3
815	0.35
816	0.39
817	0.46
818	0.54
819	0.58
820	0.61
821	0.66
822	0.67
823	0.71
824	0.73
825	0.7
826	0.66
827	0.64
828	0.6
829	0.58
830	0.56
831	0.56
832	0.52
833	0.51
834	0.49
835	0.47
836	0.42
837	0.38
838	0.34
839	0.25
840	0.27
841	0.24
842	0.23
843	0.2
844	0.19
845	0.16
846	0.14
847	0.14
848	0.1
849	0.12
850	0.11
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.13
855	0.13
856	0.12
857	0.18
858	0.2
859	0.19
860	0.19
861	0.2
862	0.17
863	0.17
864	0.17
865	0.11
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.11
870	0.12
871	0.12
872	0.13
873	0.12
874	0.11
875	0.11
876	0.1
877	0.11
878	0.1
879	0.1
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.09
884	0.09
885	0.09
886	0.08
887	0.08
888	0.08
889	0.09
890	0.09
891	0.1
892	0.12
893	0.13
894	0.15
895	0.18
896	0.2
897	0.24
898	0.28
899	0.28
900	0.3
901	0.33
902	0.32
903	0.29
904	0.28
905	0.28
906	0.26
907	0.29
908	0.27
909	0.24
910	0.25
911	0.25
912	0.3
913	0.34
914	0.36
915	0.34
916	0.32
917	0.33
918	0.35
919	0.36
920	0.31
921	0.25
922	0.2
923	0.21
924	0.23
925	0.21
926	0.18
927	0.19
928	0.19
929	0.17
930	0.21
931	0.21
932	0.24
933	0.26
934	0.29
935	0.27
936	0.27
937	0.28
938	0.26
939	0.23
940	0.17
941	0.18
942	0.17
943	0.18
944	0.17
945	0.16
946	0.13
947	0.13
948	0.12
949	0.1
950	0.07
951	0.05
952	0.05
953	0.05
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.1
958	0.15
959	0.17
960	0.21
961	0.25
962	0.29
963	0.37
964	0.42
965	0.45
966	0.41
967	0.43
968	0.4
969	0.37
970	0.33
971	0.27
972	0.23
973	0.19
974	0.2
975	0.18
976	0.21
977	0.22
978	0.24
979	0.24
980	0.21
981	0.22
982	0.19
983	0.18
984	0.15
985	0.11
986	0.08
987	0.07
988	0.09
989	0.07
990	0.09
991	0.13
992	0.16
993	0.2
994	0.26
995	0.3
996	0.33
997	0.36
998	0.38
999	0.36
1000	0.37
1001	0.34
1002	0.35
1003	0.32
1004	0.3
1005	0.31
1006	0.29
1007	0.27
1008	0.25
1009	0.25
1010	0.2
1011	0.19
1012	0.16
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.15
1016	0.2
1017	0.19
1018	0.2
1019	0.21
1020	0.21
1021	0.22
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.15
1025	0.15
1026	0.15
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.14
1030	0.17
1031	0.18
1032	0.15
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.15
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.13
1039	0.13
1040	0.18
1041	0.2
1042	0.25
1043	0.34
1044	0.42
1045	0.49
1046	0.57
1047	0.64
1048	0.62
1049	0.62
1050	0.54
1051	0.48
1052	0.41
1053	0.34
1054	0.25
1055	0.18
1056	0.15
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.11
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.13
1065	0.14
1066	0.14
1067	0.2
1068	0.18
1069	0.19
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.18
1073	0.16
1074	0.2
1075	0.21
1076	0.25
1077	0.27
1078	0.29
1079	0.36
1080	0.38
1081	0.41
1082	0.39
1083	0.39
1084	0.34
1085	0.39
1086	0.41
1087	0.33
1088	0.37
1089	0.4
1090	0.42
1091	0.41
1092	0.48
1093	0.51
1094	0.53
1095	0.54
1096	0.56
1097	0.56
1098	0.57
1099	0.62
1100	0.6
1101	0.52
1102	0.45
1103	0.45
1104	0.39
1105	0.31
1106	0.25
1107	0.16
1108	0.1
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.07
1112	0.05
1113	0.05
1114	0.06
1115	0.07
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.08
1119	0.11
1120	0.13
1121	0.16
1122	0.17
1123	0.16
1124	0.19
1125	0.21
1126	0.22
1127	0.22
1128	0.24
1129	0.22
1130	0.23
1131	0.23
1132	0.22
1133	0.18
1134	0.16
1135	0.13
1136	0.09
1137	0.08
1138	0.08
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.11
1142	0.13
1143	0.16
1144	0.18
1145	0.18
1146	0.18
1147	0.18
1148	0.24
1149	0.24
1150	0.24
1151	0.22
1152	0.21
1153	0.21
1154	0.19
1155	0.17
1156	0.11
1157	0.09
1158	0.08
1159	0.06
1160	0.06
1161	0.06
1162	0.05
1163	0.07
1164	0.08
1165	0.08
1166	0.08
1167	0.09
1168	0.1
1169	0.14
1170	0.15
1171	0.15
1172	0.16
1173	0.16
1174	0.17
1175	0.2
1176	0.22
1177	0.18
1178	0.2
1179	0.2
1180	0.19
1181	0.19
1182	0.18
1183	0.15
1184	0.15
1185	0.2
1186	0.19
1187	0.21
1188	0.22
1189	0.25
1190	0.32
1191	0.38
1192	0.37
1193	0.32
1194	0.3
1195	0.27
1196	0.27
1197	0.29
1198	0.22
1199	0.15
1200	0.18
1201	0.21
1202	0.28
1203	0.32
1204	0.33
1205	0.33
1206	0.38
1207	0.44
1208	0.5
1209	0.56
1210	0.59
1211	0.62
1212	0.67
1213	0.68
1214	0.73
1215	0.73
1216	0.74
1217	0.72
1218	0.62
1219	0.56
1220	0.52
1221	0.51
1222	0.46
1223	0.45
1224	0.37
1225	0.33
1226	0.35
1227	0.36
1228	0.32
1229	0.28
1230	0.24
1231	0.18
1232	0.17
1233	0.15
1234	0.12
1235	0.13
1236	0.13
1237	0.16
1238	0.16
1239	0.16
1240	0.16
1241	0.18
1242	0.19
1243	0.19
1244	0.2
1245	0.17
1246	0.17
1247	0.18
1248	0.22
1249	0.24
1250	0.25
1251	0.34
1252	0.4
1253	0.5
1254	0.55
1255	0.61
1256	0.57
1257	0.53
1258	0.55
1259	0.46
1260	0.4
1261	0.32
1262	0.29
1263	0.21
1264	0.19
1265	0.19
1266	0.14
1267	0.13
1268	0.11
1269	0.14
1270	0.2
1271	0.2
1272	0.21
1273	0.27
1274	0.28
1275	0.35
1276	0.41
1277	0.43
1278	0.37
1279	0.39
1280	0.39
1281	0.33
1282	0.31
1283	0.24
1284	0.19
1285	0.13
1286	0.12
1287	0.1
1288	0.09

B6Q794

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer