FuNGI

W7HM86

Protein Details

Accession

W7HM86

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-56	RATGDPLVRPKPRKPPPKKPVGPAPSLK	Basic
175-198	GGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRDEE	Hydrophilic
388-412	LEKSRKAHGRKVKKYLKQREKNLIY	Basic
579-605	TTSPPPVIAKPKNPKKRRNPIGAGSGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-52	PNPMRRIRRATGDPLVRPKPRKPPPKKPVGPA
383-406	KEKRALEKSRKAHGRKVKKYLKQR
437-463	KEEEEKRKAAEKAAKEKEEEERKKEKQ
588-597	KPKNPKKRRN

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MASSIPPNTAATKPAPGPNGPNPMRRIRRATGDPLVRPKPRKPPPKKPVGPAPSLKPVIREEAEPDDDPSTYTEYKLVTTKKSLLRNMRFHCMRLYSKNEVNIMDPEEFIRPIKLHRRDPRGPLQGAKLGPGSDSAMLDPDEKDIDPEEKAKREAEKAEKERQQAENLARIAPHGGAVKQKKNMFKKKTQQVFQRDEEERRLKYEEYFPWFIEDYENKNTWVGNLEGGLSGTSVMLVMDEGMFKMIPVEKFYRFQQRNTFKTLSADQAEAAMKQKERINRWFMDVTKTDEKEAKLKEERENMRATKRLYTVKGDRLEGREAKPGFTDADELDFEEDFADDEAPPIIEGDEEELKVATKKMQREQLSANIFDIRNEKDYEREEKEKRALEKSRKAHGRKVKKYLKQREKNLIYDTDSDENPYASSEESIDSDEEAAKKEEEEKRKAAEKAAKEKEEEERKKEKQEQKEAEEAMKSLKAAAAGKAVAQPGTSPSTTTTTAATTTPSTTTTTPNKHPISTAKTLKRSGSPGPADSGVESAQPSKRIKKEDQPTATKPPISTNGLTPNPNSRLITIKRDPDNTTSPPPVIAKPKNPKKRRNPIGAGSGSEYETGGEMSDGATSDGGKAVKRARQMSADSAAGVPIRSGNPLGAKPAMVGKKSRSGSPDSSIQEKSKGPITEDEIKAVLTPEGIDFATISREFHGRVNPNNKAEFFKKLKGLSRLVDDRERGKVFYPREETT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.37
3	0.36
4	0.42
5	0.46
6	0.54
7	0.52
8	0.55
9	0.55
10	0.62
11	0.67
12	0.67
13	0.67
14	0.62
15	0.67
16	0.67
17	0.69
18	0.68
19	0.68
20	0.68
21	0.69
22	0.72
23	0.71
24	0.71
25	0.71
26	0.72
27	0.74
28	0.79
29	0.8
30	0.83
31	0.85
32	0.9
33	0.9
34	0.88
35	0.89
36	0.85
37	0.83
38	0.78
39	0.74
40	0.72
41	0.69
42	0.6
43	0.54
44	0.49
45	0.48
46	0.43
47	0.37
48	0.33
49	0.35
50	0.39
51	0.35
52	0.35
53	0.29
54	0.27
55	0.26
56	0.24
57	0.22
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.17
62	0.2
63	0.25
64	0.28
65	0.27
66	0.31
67	0.38
68	0.43
69	0.5
70	0.57
71	0.61
72	0.66
73	0.72
74	0.72
75	0.75
76	0.7
77	0.64
78	0.61
79	0.57
80	0.54
81	0.52
82	0.54
83	0.51
84	0.53
85	0.56
86	0.53
87	0.47
88	0.43
89	0.38
90	0.34
91	0.28
92	0.24
93	0.2
94	0.19
95	0.19
96	0.17
97	0.17
98	0.14
99	0.21
100	0.31
101	0.38
102	0.47
103	0.55
104	0.64
105	0.68
106	0.75
107	0.78
108	0.77
109	0.72
110	0.66
111	0.62
112	0.58
113	0.51
114	0.45
115	0.36
116	0.27
117	0.24
118	0.21
119	0.18
120	0.13
121	0.14
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.11
130	0.12
131	0.13
132	0.14
133	0.14
134	0.2
135	0.24
136	0.25
137	0.28
138	0.3
139	0.32
140	0.35
141	0.41
142	0.45
143	0.5
144	0.53
145	0.61
146	0.63
147	0.63
148	0.65
149	0.6
150	0.55
151	0.51
152	0.48
153	0.45
154	0.4
155	0.37
156	0.3
157	0.28
158	0.25
159	0.18
160	0.17
161	0.12
162	0.12
163	0.2
164	0.27
165	0.33
166	0.38
167	0.43
168	0.5
169	0.59
170	0.68
171	0.68
172	0.71
173	0.76
174	0.8
175	0.84
176	0.83
177	0.82
178	0.81
179	0.8
180	0.74
181	0.72
182	0.66
183	0.6
184	0.61
185	0.58
186	0.49
187	0.45
188	0.44
189	0.36
190	0.35
191	0.39
192	0.36
193	0.37
194	0.39
195	0.36
196	0.36
197	0.35
198	0.32
199	0.29
200	0.26
201	0.24
202	0.27
203	0.28
204	0.25
205	0.25
206	0.25
207	0.21
208	0.2
209	0.15
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.04
220	0.04
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.06
232	0.09
233	0.09
234	0.13
235	0.17
236	0.18
237	0.21
238	0.25
239	0.35
240	0.34
241	0.38
242	0.44
243	0.5
244	0.51
245	0.56
246	0.54
247	0.44
248	0.46
249	0.43
250	0.37
251	0.3
252	0.27
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.16
257	0.17
258	0.15
259	0.13
260	0.16
261	0.2
262	0.23
263	0.29
264	0.35
265	0.39
266	0.37
267	0.42
268	0.42
269	0.4
270	0.4
271	0.35
272	0.35
273	0.36
274	0.35
275	0.32
276	0.31
277	0.32
278	0.32
279	0.32
280	0.32
281	0.31
282	0.35
283	0.39
284	0.45
285	0.47
286	0.44
287	0.48
288	0.44
289	0.43
290	0.43
291	0.39
292	0.35
293	0.36
294	0.38
295	0.35
296	0.39
297	0.4
298	0.42
299	0.43
300	0.4
301	0.39
302	0.37
303	0.39
304	0.36
305	0.32
306	0.32
307	0.3
308	0.28
309	0.26
310	0.24
311	0.19
312	0.16
313	0.16
314	0.09
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.1
344	0.13
345	0.18
346	0.23
347	0.3
348	0.32
349	0.35
350	0.37
351	0.4
352	0.39
353	0.35
354	0.3
355	0.26
356	0.24
357	0.22
358	0.22
359	0.16
360	0.15
361	0.16
362	0.16
363	0.16
364	0.19
365	0.24
366	0.26
367	0.32
368	0.32
369	0.35
370	0.4
371	0.41
372	0.41
373	0.43
374	0.46
375	0.48
376	0.55
377	0.56
378	0.59
379	0.64
380	0.64
381	0.65
382	0.66
383	0.69
384	0.67
385	0.73
386	0.74
387	0.73
388	0.8
389	0.83
390	0.84
391	0.82
392	0.82
393	0.82
394	0.78
395	0.74
396	0.66
397	0.58
398	0.49
399	0.42
400	0.37
401	0.29
402	0.24
403	0.21
404	0.18
405	0.16
406	0.13
407	0.11
408	0.09
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.16
425	0.22
426	0.28
427	0.32
428	0.33
429	0.36
430	0.42
431	0.43
432	0.42
433	0.42
434	0.42
435	0.48
436	0.52
437	0.5
438	0.45
439	0.47
440	0.49
441	0.53
442	0.51
443	0.48
444	0.5
445	0.52
446	0.58
447	0.66
448	0.66
449	0.65
450	0.71
451	0.7
452	0.65
453	0.68
454	0.62
455	0.54
456	0.46
457	0.36
458	0.28
459	0.21
460	0.17
461	0.11
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.11
469	0.13
470	0.13
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.1
475	0.13
476	0.12
477	0.11
478	0.12
479	0.16
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.13
484	0.14
485	0.14
486	0.14
487	0.11
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.14
492	0.14
493	0.2
494	0.25
495	0.3
496	0.33
497	0.42
498	0.42
499	0.41
500	0.42
501	0.43
502	0.43
503	0.46
504	0.5
505	0.49
506	0.53
507	0.55
508	0.55
509	0.52
510	0.49
511	0.45
512	0.45
513	0.4
514	0.36
515	0.35
516	0.34
517	0.3
518	0.26
519	0.23
520	0.15
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.14
525	0.19
526	0.22
527	0.29
528	0.34
529	0.4
530	0.46
531	0.52
532	0.6
533	0.64
534	0.69
535	0.69
536	0.69
537	0.71
538	0.69
539	0.61
540	0.52
541	0.47
542	0.44
543	0.41
544	0.37
545	0.32
546	0.37
547	0.38
548	0.39
549	0.36
550	0.38
551	0.36
552	0.38
553	0.35
554	0.28
555	0.32
556	0.35
557	0.42
558	0.4
559	0.45
560	0.47
561	0.5
562	0.52
563	0.49
564	0.52
565	0.48
566	0.48
567	0.43
568	0.38
569	0.37
570	0.36
571	0.35
572	0.38
573	0.4
574	0.44
575	0.52
576	0.62
577	0.71
578	0.78
579	0.84
580	0.86
581	0.91
582	0.91
583	0.9
584	0.87
585	0.83
586	0.83
587	0.75
588	0.65
589	0.57
590	0.49
591	0.38
592	0.31
593	0.24
594	0.14
595	0.12
596	0.1
597	0.07
598	0.06
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.09
608	0.1
609	0.1
610	0.14
611	0.2
612	0.23
613	0.3
614	0.34
615	0.35
616	0.39
617	0.43
618	0.44
619	0.42
620	0.39
621	0.33
622	0.29
623	0.26
624	0.21
625	0.17
626	0.12
627	0.1
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.13
632	0.17
633	0.18
634	0.21
635	0.2
636	0.19
637	0.18
638	0.26
639	0.28
640	0.27
641	0.3
642	0.3
643	0.39
644	0.4
645	0.43
646	0.4
647	0.42
648	0.44
649	0.45
650	0.49
651	0.43
652	0.47
653	0.47
654	0.45
655	0.43
656	0.4
657	0.38
658	0.37
659	0.35
660	0.33
661	0.34
662	0.39
663	0.44
664	0.43
665	0.42
666	0.36
667	0.34
668	0.31
669	0.27
670	0.2
671	0.11
672	0.11
673	0.08
674	0.1
675	0.1
676	0.09
677	0.08
678	0.09
679	0.13
680	0.13
681	0.14
682	0.14
683	0.16
684	0.17
685	0.21
686	0.3
687	0.31
688	0.41
689	0.49
690	0.56
691	0.59
692	0.63
693	0.61
694	0.59
695	0.56
696	0.56
697	0.53
698	0.52
699	0.53
700	0.54
701	0.61
702	0.61
703	0.64
704	0.59
705	0.61
706	0.61
707	0.6
708	0.61
709	0.57
710	0.54
711	0.56
712	0.54
713	0.46
714	0.44
715	0.46
716	0.43
717	0.49

W7HM86

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer