Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7I4K5

Protein Details
Accession W7I4K5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-403AHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-395PKKTRKR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVYPREPKIKLNTPKPPLGGVMTAASNHAIPRPSPTPSKTLPSPTMTTSITITTPVNGNTLAAPGANNIRTSERRRGAPNKLGSDTSVHSRIKKDRGADVDEDGDSIALNQPPRKKLKPMPRVITTQYILDKYKDKPPSLTLHMHPTHFRFDQQDGTFNYNSAMRSILEYIAQETIPADAVEVFRDARLPFYEGRLIVHIHDHRTSAKDVDGGSAKPKNDMLFSLNKWNEHLTPSPLVAFPVSKDVKEEPITNGETKPAGVDNTSKPTEEAKRVFKTVMHPTPASLHAEICLLAITPALPPNARGRHGSVAQTPATPSSAHPLTIATSNTKPMPTILNDKTALTFEADYLLATGPPLVLTPAESPAHAAAILNALAHPLHSRPVPPKKTRKRTVKEMAVDEAKAAEEERLMLIMDERHLPSAIGATDDGPVSSSGFEPSFKRWKALESFKQKYEEEMVKKEQERRAQHEKDRQKLLKEQQQQRVTAEAQARVAAAAVANTPTEQSPLDSKGSLREMIQRSGNLIQAQMQAQQQQAAQANREPTTPAQAQAVQAHAQAAAREQVIREQAVREQAVREQAVREQAAREQAVREHTTPIAATPIAQVVAHTPTSAPQQTTATQGSPIAAASSPFAAFHGSPPMQSRTSTHSSQPGSRQQSPHMSTVQSQSIQHQHHAQPMPGSPAMHASPMMRAGSQAMHNAPAMNQGSPLARNIAMAGGQHNMNHALAAQQHLMMQNAARNQNAINIAKTTAQQMAGHTTPEHQKMMLQRAFIMRQQQQQQHLLAVQAAHQAQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQSMMESMGVAGMHHAMAGRGFMPGMGNAGMHMNGMMGGMPMNVNGYPQMAILPNGIPVGMMNGINGASLQGFSPAQLNMIMRGRGQPPQGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.71
3 0.71
4 0.76
5 0.72
6 0.64
7 0.57
8 0.5
9 0.41
10 0.32
11 0.28
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.17
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.22
22 0.25
23 0.29
24 0.36
25 0.39
26 0.42
27 0.45
28 0.52
29 0.5
30 0.54
31 0.55
32 0.53
33 0.53
34 0.48
35 0.48
36 0.42
37 0.38
38 0.31
39 0.27
40 0.22
41 0.21
42 0.18
43 0.16
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.25
60 0.31
61 0.38
62 0.46
63 0.46
64 0.5
65 0.58
66 0.65
67 0.68
68 0.71
69 0.73
70 0.69
71 0.66
72 0.62
73 0.54
74 0.49
75 0.43
76 0.39
77 0.38
78 0.34
79 0.35
80 0.41
81 0.47
82 0.51
83 0.54
84 0.52
85 0.52
86 0.55
87 0.57
88 0.53
89 0.48
90 0.42
91 0.37
92 0.33
93 0.25
94 0.19
95 0.13
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.15
100 0.19
101 0.26
102 0.34
103 0.42
104 0.46
105 0.52
106 0.59
107 0.67
108 0.73
109 0.76
110 0.77
111 0.75
112 0.76
113 0.71
114 0.69
115 0.59
116 0.53
117 0.47
118 0.42
119 0.38
120 0.35
121 0.36
122 0.32
123 0.39
124 0.42
125 0.4
126 0.4
127 0.43
128 0.47
129 0.49
130 0.52
131 0.46
132 0.49
133 0.5
134 0.49
135 0.48
136 0.44
137 0.44
138 0.38
139 0.38
140 0.32
141 0.32
142 0.38
143 0.35
144 0.39
145 0.35
146 0.4
147 0.37
148 0.33
149 0.31
150 0.26
151 0.24
152 0.18
153 0.17
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.23
183 0.2
184 0.22
185 0.21
186 0.2
187 0.18
188 0.25
189 0.24
190 0.24
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.28
195 0.29
196 0.23
197 0.21
198 0.2
199 0.19
200 0.21
201 0.21
202 0.19
203 0.22
204 0.25
205 0.24
206 0.24
207 0.25
208 0.23
209 0.22
210 0.23
211 0.21
212 0.23
213 0.26
214 0.34
215 0.34
216 0.33
217 0.33
218 0.34
219 0.31
220 0.29
221 0.29
222 0.23
223 0.23
224 0.23
225 0.23
226 0.2
227 0.2
228 0.16
229 0.14
230 0.11
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.19
235 0.2
236 0.25
237 0.27
238 0.28
239 0.22
240 0.26
241 0.29
242 0.28
243 0.26
244 0.23
245 0.21
246 0.19
247 0.17
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.14
252 0.16
253 0.22
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.27
258 0.31
259 0.34
260 0.37
261 0.38
262 0.41
263 0.42
264 0.42
265 0.39
266 0.4
267 0.43
268 0.43
269 0.39
270 0.36
271 0.35
272 0.37
273 0.37
274 0.34
275 0.24
276 0.18
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.11
281 0.09
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.17
292 0.21
293 0.22
294 0.24
295 0.26
296 0.3
297 0.32
298 0.34
299 0.29
300 0.29
301 0.28
302 0.26
303 0.23
304 0.19
305 0.17
306 0.15
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.16
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.16
324 0.16
325 0.23
326 0.22
327 0.26
328 0.27
329 0.27
330 0.27
331 0.24
332 0.22
333 0.15
334 0.13
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.05
350 0.06
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.1
372 0.18
373 0.29
374 0.37
375 0.45
376 0.56
377 0.65
378 0.75
379 0.83
380 0.85
381 0.83
382 0.84
383 0.85
384 0.83
385 0.77
386 0.68
387 0.63
388 0.53
389 0.46
390 0.35
391 0.26
392 0.17
393 0.12
394 0.1
395 0.06
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.13
429 0.21
430 0.21
431 0.23
432 0.22
433 0.26
434 0.31
435 0.38
436 0.43
437 0.44
438 0.48
439 0.48
440 0.52
441 0.48
442 0.43
443 0.39
444 0.37
445 0.3
446 0.3
447 0.31
448 0.31
449 0.34
450 0.39
451 0.38
452 0.4
453 0.41
454 0.45
455 0.52
456 0.54
457 0.58
458 0.62
459 0.65
460 0.63
461 0.68
462 0.63
463 0.56
464 0.57
465 0.58
466 0.57
467 0.59
468 0.61
469 0.61
470 0.63
471 0.61
472 0.54
473 0.49
474 0.41
475 0.36
476 0.3
477 0.22
478 0.18
479 0.17
480 0.16
481 0.13
482 0.12
483 0.07
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.11
497 0.12
498 0.12
499 0.13
500 0.15
501 0.17
502 0.16
503 0.15
504 0.21
505 0.22
506 0.24
507 0.26
508 0.22
509 0.23
510 0.24
511 0.25
512 0.17
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.15
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.14
523 0.16
524 0.19
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.21
529 0.2
530 0.2
531 0.18
532 0.14
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.19
541 0.14
542 0.13
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.1
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.13
558 0.17
559 0.18
560 0.16
561 0.15
562 0.17
563 0.2
564 0.19
565 0.18
566 0.15
567 0.17
568 0.2
569 0.2
570 0.18
571 0.15
572 0.17
573 0.2
574 0.2
575 0.19
576 0.16
577 0.17
578 0.22
579 0.24
580 0.23
581 0.21
582 0.2
583 0.2
584 0.19
585 0.17
586 0.14
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.1
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.09
600 0.14
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.17
605 0.18
606 0.22
607 0.22
608 0.18
609 0.17
610 0.16
611 0.15
612 0.13
613 0.12
614 0.08
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.16
626 0.15
627 0.16
628 0.2
629 0.23
630 0.23
631 0.23
632 0.24
633 0.24
634 0.3
635 0.31
636 0.3
637 0.33
638 0.35
639 0.39
640 0.44
641 0.46
642 0.48
643 0.51
644 0.5
645 0.48
646 0.55
647 0.53
648 0.5
649 0.43
650 0.37
651 0.34
652 0.36
653 0.35
654 0.28
655 0.25
656 0.26
657 0.31
658 0.31
659 0.32
660 0.34
661 0.32
662 0.39
663 0.4
664 0.37
665 0.32
666 0.32
667 0.34
668 0.29
669 0.27
670 0.19
671 0.2
672 0.2
673 0.18
674 0.17
675 0.13
676 0.13
677 0.15
678 0.16
679 0.12
680 0.11
681 0.12
682 0.14
683 0.15
684 0.16
685 0.15
686 0.16
687 0.16
688 0.16
689 0.15
690 0.19
691 0.18
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.17
698 0.13
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.11
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.11
710 0.12
711 0.11
712 0.11
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.12
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.13
721 0.14
722 0.13
723 0.13
724 0.13
725 0.18
726 0.2
727 0.19
728 0.19
729 0.18
730 0.23
731 0.27
732 0.26
733 0.22
734 0.21
735 0.22
736 0.23
737 0.23
738 0.21
739 0.17
740 0.18
741 0.17
742 0.18
743 0.22
744 0.21
745 0.22
746 0.2
747 0.22
748 0.26
749 0.29
750 0.28
751 0.22
752 0.25
753 0.3
754 0.4
755 0.38
756 0.32
757 0.32
758 0.36
759 0.39
760 0.38
761 0.4
762 0.35
763 0.41
764 0.49
765 0.52
766 0.52
767 0.54
768 0.53
769 0.47
770 0.42
771 0.35
772 0.28
773 0.22
774 0.18
775 0.18
776 0.17
777 0.16
778 0.16
779 0.19
780 0.21
781 0.29
782 0.34
783 0.36
784 0.42
785 0.49
786 0.57
787 0.63
788 0.68
789 0.68
790 0.7
791 0.71
792 0.75
793 0.76
794 0.76
795 0.74
796 0.73
797 0.74
798 0.75
799 0.75
800 0.74
801 0.74
802 0.72
803 0.72
804 0.67
805 0.62
806 0.55
807 0.48
808 0.4
809 0.32
810 0.24
811 0.17
812 0.13
813 0.11
814 0.09
815 0.07
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.09
832 0.08
833 0.08
834 0.1
835 0.1
836 0.09
837 0.08
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.04
843 0.05
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.07
848 0.07
849 0.07
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.11
855 0.11
856 0.12
857 0.13
858 0.13
859 0.13
860 0.13
861 0.12
862 0.1
863 0.09
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.1
871 0.1
872 0.07
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.08
877 0.08
878 0.09
879 0.12
880 0.11
881 0.12
882 0.14
883 0.15
884 0.18
885 0.23
886 0.23
887 0.22
888 0.28
889 0.3
890 0.33