Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q203

Protein Details
Accession B6Q203    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-82DSRTSTKDDRRYRSRSRDRYTRKRDRSWSHDSHBasic
226-246IYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-166RYRSRSRDRYTRKRDRSWSHDSHERTRDRARDRDRDGGKRESYRDGRDARDRDRSTSRDRYSSRHGPAKSGRPDRSRSPRNGTRSRDYPARDSKPDYRDGKRDGRAR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG tmf:PMAA_018000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MTEPPTKRARRIDSSAMWDANDKRSLLSHTPEADADQPRQSRHGSSRPDDSRTSTKDDRRYRSRSRDRYTRKRDRSWSHDSHERTRDRARDRDRDGGKRESYRDGRDARDRDRSTSRDRYSSRHGPAKSGRPDRSRSPRNGTRSRDYPARDSKPDYRDGKRDGRARPDQRHTNGASKRDTHEEDIEDADMMSDIEDTDDIEAMMRKAVGFTRFRSTKNTKVPGNDIYGVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.59
4 0.51
5 0.47
6 0.43
7 0.4
8 0.37
9 0.3
10 0.25
11 0.26
12 0.32
13 0.31
14 0.33
15 0.33
16 0.31
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.31
22 0.29
23 0.31
24 0.31
25 0.31
26 0.34
27 0.34
28 0.34
29 0.38
30 0.44
31 0.45
32 0.46
33 0.55
34 0.56
35 0.59
36 0.55
37 0.53
38 0.53
39 0.48
40 0.52
41 0.5
42 0.53
43 0.58
44 0.65
45 0.68
46 0.69
47 0.74
48 0.75
49 0.79
50 0.82
51 0.83
52 0.82
53 0.85
54 0.86
55 0.89
56 0.9
57 0.9
58 0.88
59 0.87
60 0.88
61 0.86
62 0.83
63 0.81
64 0.77
65 0.72
66 0.71
67 0.67
68 0.65
69 0.65
70 0.59
71 0.55
72 0.54
73 0.56
74 0.54
75 0.59
76 0.59
77 0.59
78 0.62
79 0.66
80 0.66
81 0.66
82 0.65
83 0.62
84 0.59
85 0.54
86 0.51
87 0.49
88 0.48
89 0.44
90 0.45
91 0.41
92 0.41
93 0.45
94 0.46
95 0.43
96 0.48
97 0.46
98 0.44
99 0.47
100 0.47
101 0.46
102 0.51
103 0.49
104 0.47
105 0.48
106 0.48
107 0.5
108 0.54
109 0.51
110 0.49
111 0.47
112 0.44
113 0.48
114 0.52
115 0.52
116 0.52
117 0.53
118 0.5
119 0.54
120 0.57
121 0.62
122 0.61
123 0.58
124 0.59
125 0.6
126 0.64
127 0.69
128 0.67
129 0.63
130 0.59
131 0.58
132 0.54
133 0.5
134 0.49
135 0.49
136 0.49
137 0.46
138 0.48
139 0.51
140 0.49
141 0.54
142 0.53
143 0.48
144 0.49
145 0.52
146 0.55
147 0.54
148 0.58
149 0.54
150 0.57
151 0.62
152 0.65
153 0.67
154 0.68
155 0.69
156 0.66
157 0.67
158 0.62
159 0.61
160 0.57
161 0.54
162 0.49
163 0.43
164 0.43
165 0.43
166 0.43
167 0.37
168 0.36
169 0.32
170 0.3
171 0.28
172 0.25
173 0.19
174 0.16
175 0.12
176 0.09
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.08
194 0.11
195 0.16
196 0.18
197 0.22
198 0.31
199 0.34
200 0.36
201 0.44
202 0.48
203 0.52
204 0.59
205 0.64
206 0.59
207 0.61
208 0.64
209 0.6
210 0.59
211 0.54
212 0.46
213 0.43
214 0.46
215 0.47
216 0.47
217 0.46
218 0.44
219 0.49
220 0.57
221 0.61
222 0.65
223 0.69
224 0.74
225 0.78
226 0.83
227 0.82
228 0.78
229 0.72
230 0.64
231 0.57
232 0.54
233 0.5
234 0.45
235 0.39