Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059JJN7

Protein Details
Accession A0A059JJN7    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21DSTRGPPRVKNKAPAPQQISHydrophilic
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRINHydrophilic
613-640DINSIEKQMPRKVKKKRKVDDDRFEEYIHydrophilic
657-679LLSTARRWKEQQQQQQQQQQTQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
622-630PRKVKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MDSTRGPPRVKNKAPAPQQISAEQLLREAVDRQEPSLQAPTQRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFRRARSIFERALDVDSTSVVLWIRYAEAEMKNRNINHARNLFDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIAGTRQVFERWMSWEPDEGAWHAYIKLEKRYNELDRARAIFQRFITVHPETKNWIKWTRFEEENSTSDLVREVYGTAIETLGTDFMDEKLFIAYARYETKLKEYERARAIYKFALDRLPRSKSAALQSAYTVFEKQFGDRVGVEDVILSKRRVQYEEQIKENPKNYDLWFDLTRLEETSGDVDRIRETYERAIAQIPPSQEKRHWRRYIYLWIFYAVWEEMENEDAERARQIYTECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAEFEIRQLDLVLARKTLGQAIGMCPKDKLFRGYIDIERKLFEFSRCRKLFEKQIQWNPSQSESWIKFAELERGLDDVERARAIYELGINQTALDMPELLWKAYIDFEEYEEEYERTRNLYERLLKKTDHVKVWINYARFEINIPEGDEEDENEERPVSEEAKSRARKVFERANRVMKEKDMREERVALLNAWKAFEHTHGSPDDINSIEKQMPRKVKKKRKVDDDRFEEYIDYIFPADDESTAMISNLLSTARRWKEQQQQQQQQQQTQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.79
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.58
8 0.51
9 0.44
10 0.34
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.21
18 0.22
19 0.24
20 0.28
21 0.28
22 0.31
23 0.35
24 0.34
25 0.34
26 0.36
27 0.38
28 0.35
29 0.35
30 0.32
31 0.27
32 0.32
33 0.26
34 0.26
35 0.27
36 0.26
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.5
77 0.48
78 0.47
79 0.49
80 0.55
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.41
85 0.43
86 0.36
87 0.27
88 0.2
89 0.16
90 0.14
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.12
101 0.17
102 0.24
103 0.28
104 0.31
105 0.36
106 0.37
107 0.44
108 0.46
109 0.45
110 0.48
111 0.5
112 0.49
113 0.47
114 0.52
115 0.45
116 0.38
117 0.34
118 0.27
119 0.24
120 0.21
121 0.2
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.23
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.16
153 0.2
154 0.22
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.23
159 0.23
160 0.19
161 0.17
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.15
167 0.17
168 0.24
169 0.28
170 0.28
171 0.33
172 0.4
173 0.43
174 0.48
175 0.48
176 0.44
177 0.43
178 0.45
179 0.42
180 0.39
181 0.37
182 0.32
183 0.29
184 0.31
185 0.28
186 0.27
187 0.3
188 0.29
189 0.31
190 0.29
191 0.3
192 0.27
193 0.32
194 0.35
195 0.35
196 0.39
197 0.37
198 0.41
199 0.44
200 0.46
201 0.43
202 0.41
203 0.42
204 0.39
205 0.38
206 0.35
207 0.32
208 0.26
209 0.23
210 0.21
211 0.15
212 0.11
213 0.1
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.19
242 0.24
243 0.25
244 0.3
245 0.3
246 0.35
247 0.38
248 0.4
249 0.38
250 0.34
251 0.35
252 0.29
253 0.29
254 0.23
255 0.19
256 0.23
257 0.22
258 0.25
259 0.28
260 0.3
261 0.29
262 0.32
263 0.32
264 0.29
265 0.33
266 0.34
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.24
271 0.24
272 0.2
273 0.17
274 0.1
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.13
280 0.15
281 0.14
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.12
290 0.1
291 0.13
292 0.16
293 0.18
294 0.2
295 0.21
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.43
301 0.44
302 0.46
303 0.47
304 0.39
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.25
309 0.23
310 0.23
311 0.2
312 0.19
313 0.19
314 0.17
315 0.17
316 0.13
317 0.13
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.17
340 0.19
341 0.2
342 0.23
343 0.33
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.52
349 0.56
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.13
375 0.15
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.17
380 0.24
381 0.32
382 0.31
383 0.37
384 0.35
385 0.41
386 0.43
387 0.46
388 0.46
389 0.41
390 0.44
391 0.4
392 0.41
393 0.37
394 0.35
395 0.31
396 0.25
397 0.27
398 0.18
399 0.17
400 0.16
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.12
405 0.11
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.1
414 0.08
415 0.09
416 0.12
417 0.18
418 0.19
419 0.19
420 0.18
421 0.19
422 0.21
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.27
429 0.32
430 0.36
431 0.37
432 0.34
433 0.33
434 0.31
435 0.29
436 0.27
437 0.25
438 0.27
439 0.31
440 0.41
441 0.41
442 0.45
443 0.45
444 0.49
445 0.55
446 0.55
447 0.6
448 0.58
449 0.67
450 0.67
451 0.66
452 0.64
453 0.56
454 0.49
455 0.39
456 0.31
457 0.3
458 0.27
459 0.29
460 0.25
461 0.23
462 0.24
463 0.24
464 0.3
465 0.22
466 0.21
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.16
471 0.16
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.15
510 0.14
511 0.13
512 0.14
513 0.15
514 0.16
515 0.24
516 0.32
517 0.37
518 0.44
519 0.46
520 0.45
521 0.47
522 0.54
523 0.53
524 0.49
525 0.47
526 0.47
527 0.45
528 0.54
529 0.54
530 0.46
531 0.4
532 0.38
533 0.34
534 0.27
535 0.27
536 0.2
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.16
541 0.16
542 0.17
543 0.17
544 0.15
545 0.16
546 0.15
547 0.15
548 0.14
549 0.14
550 0.12
551 0.14
552 0.15
553 0.13
554 0.15
555 0.21
556 0.25
557 0.35
558 0.38
559 0.41
560 0.45
561 0.48
562 0.5
563 0.52
564 0.58
565 0.57
566 0.63
567 0.65
568 0.69
569 0.68
570 0.68
571 0.63
572 0.6
573 0.6
574 0.54
575 0.56
576 0.54
577 0.55
578 0.54
579 0.55
580 0.5
581 0.48
582 0.45
583 0.36
584 0.33
585 0.32
586 0.29
587 0.27
588 0.25
589 0.19
590 0.19
591 0.21
592 0.23
593 0.2
594 0.23
595 0.23
596 0.26
597 0.26
598 0.26
599 0.25
600 0.2
601 0.21
602 0.18
603 0.21
604 0.22
605 0.24
606 0.29
607 0.34
608 0.44
609 0.52
610 0.6
611 0.68
612 0.75
613 0.82
614 0.87
615 0.89
616 0.9
617 0.92
618 0.93
619 0.93
620 0.9
621 0.87
622 0.78
623 0.68
624 0.58
625 0.47
626 0.37
627 0.26
628 0.19
629 0.12
630 0.1
631 0.09
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.09
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.09
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.11
647 0.21
648 0.26
649 0.31
650 0.35
651 0.44
652 0.53
653 0.63
654 0.72
655 0.73
656 0.79
657 0.84
658 0.89
659 0.87