Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059JJW8

Protein Details
Accession A0A059JJW8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-67DDRGTDPKRKPRKILTVSRSBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR025721  Exosome_cplx_N_dom  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF14382  ECR1_N  
PF10447  EXOSC1  
Amino Acid Sequences MATGIPSIAVPGLRLGDSSTFTSGPGTYVRDSSICASIAGPVILKTDDDRGTDPKRKPRKILTVSRSPQTDTPNHTQKQQQAKSPLKFNTLPAVDSIVLARVTRVQKRQATVSILMVVDDQNNDLIDTNMRTILSSAPIITTAGTDSTSTSNTADDLRFQAIIRKEDVRAVEKDRVVMEDMFRVGDIVRAYVISVGDQSSYYCSTARNELGVVMARSEGGNMMFPVSWKEMRDPITGLGEARKVAKPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.12
4 0.15
5 0.17
6 0.18
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.2
21 0.17
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.2
37 0.25
38 0.32
39 0.4
40 0.46
41 0.51
42 0.6
43 0.64
44 0.69
45 0.72
46 0.75
47 0.77
48 0.81
49 0.78
50 0.78
51 0.75
52 0.73
53 0.64
54 0.56
55 0.5
56 0.45
57 0.42
58 0.38
59 0.42
60 0.47
61 0.46
62 0.47
63 0.48
64 0.51
65 0.57
66 0.54
67 0.52
68 0.53
69 0.61
70 0.61
71 0.64
72 0.58
73 0.53
74 0.5
75 0.45
76 0.42
77 0.34
78 0.31
79 0.24
80 0.24
81 0.18
82 0.17
83 0.16
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.11
89 0.15
90 0.2
91 0.23
92 0.29
93 0.32
94 0.34
95 0.37
96 0.35
97 0.34
98 0.31
99 0.28
100 0.22
101 0.19
102 0.17
103 0.14
104 0.11
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.16
148 0.18
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.26
155 0.25
156 0.24
157 0.27
158 0.3
159 0.28
160 0.3
161 0.27
162 0.26
163 0.24
164 0.22
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.08
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.13
191 0.15
192 0.2
193 0.21
194 0.19
195 0.18
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.18
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.07
207 0.09
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.14
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.24
217 0.28
218 0.32
219 0.34
220 0.32
221 0.31
222 0.32
223 0.31
224 0.29
225 0.26
226 0.24
227 0.23
228 0.25