Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059J471

Protein Details
Accession A0A059J471    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-65SPSATRTPSHHHQQQQHQHQQQSHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MATPAKNNTANANPGVTPTQITSSPYPAPSAVPMGRPLSHISPSATRTPSHHHQQQQHQHQQQSHPGQQQQQQQQQQQQPPASSHSQAPAHQYTPMLDDAAGFSSPSALLALGLSGITPSPGPGGVAMTGGLSMGIGMGLSMSDAMGMGMGMPLDLPMHSLPGATAKDTEAEKRRNMSEVLSMLRSRVAGRGVCREAVERLGTLEGFECMWQENNLSIAGNSVDLEIEFGRGGTDADVVKDVTLRYATQDMAEGEKREAASAVLKRVLTFDNDDDDDGGDDHGDAEERVAAGEWKPVDAFHANLTRLARMDGLCREVNCFEAVEGVHESLQKVWDSTGRGTDPKLELKPDTDTDTDTKKPTSGPESRFWERLCRSSSVGCPTMHRGENVGLAIHYWADQRRLLDAQRTSLEEVLQAELSPPSASLSPKRSKGSSRRQVYNAVIECEAGYPSLRISKGWVGDPTVLPTQDENSNENNNENDINITSNDNNNNNNVNSNNNDNEGNNGGEDTNGKVGRTRTNWLEPGPTLVSTDPLLPSSPPNVRFVARLEPAIHVPIVVAAEVYRLVGIAMQQETRPPAAYDALVVPVERRPSRTWKGDGEGGYQEQEQEQENQEQEHQEEEEHVRTVPIFGQTEGAEDEVTRKKHVYSFHALEHVPGYTVRELPFSHPRQIEEVIPLLRQYALLGKLLGVFQLATKSDKGTKGKNEDADEEDRESDDEGYTQEGHHRMDNVDAAETRLDSLLSSTDQRDDETKRISISLRTPVSSPPTLLVVFPLAVSSSSSPSSRTASVTVEVLADGRLQVPCTRGIVEVEVESSSGPADTPTRAAEEKKLCGLLGRVLETCEDLGLLVESACKYAVRRHRSEPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.26
4 0.22
5 0.19
6 0.21
7 0.2
8 0.24
9 0.24
10 0.27
11 0.3
12 0.29
13 0.3
14 0.27
15 0.27
16 0.25
17 0.29
18 0.27
19 0.25
20 0.28
21 0.3
22 0.3
23 0.31
24 0.33
25 0.3
26 0.31
27 0.31
28 0.3
29 0.32
30 0.35
31 0.4
32 0.38
33 0.35
34 0.36
35 0.42
36 0.47
37 0.51
38 0.56
39 0.57
40 0.64
41 0.74
42 0.81
43 0.83
44 0.85
45 0.83
46 0.81
47 0.78
48 0.76
49 0.75
50 0.73
51 0.7
52 0.66
53 0.64
54 0.65
55 0.66
56 0.69
57 0.69
58 0.69
59 0.7
60 0.7
61 0.74
62 0.75
63 0.76
64 0.74
65 0.69
66 0.62
67 0.56
68 0.54
69 0.49
70 0.43
71 0.38
72 0.37
73 0.36
74 0.36
75 0.41
76 0.39
77 0.36
78 0.35
79 0.33
80 0.28
81 0.27
82 0.26
83 0.19
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.1
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.16
155 0.18
156 0.25
157 0.28
158 0.33
159 0.35
160 0.39
161 0.4
162 0.4
163 0.4
164 0.34
165 0.31
166 0.29
167 0.28
168 0.27
169 0.25
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.17
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.28
179 0.29
180 0.3
181 0.3
182 0.29
183 0.26
184 0.26
185 0.24
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.18
240 0.17
241 0.16
242 0.17
243 0.17
244 0.15
245 0.15
246 0.11
247 0.15
248 0.16
249 0.18
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.18
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.14
264 0.11
265 0.1
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.18
289 0.18
290 0.21
291 0.21
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.16
296 0.12
297 0.15
298 0.14
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.14
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.13
323 0.13
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.24
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.25
336 0.22
337 0.23
338 0.19
339 0.2
340 0.2
341 0.23
342 0.24
343 0.22
344 0.21
345 0.18
346 0.19
347 0.19
348 0.24
349 0.28
350 0.3
351 0.36
352 0.43
353 0.44
354 0.47
355 0.45
356 0.46
357 0.4
358 0.41
359 0.37
360 0.32
361 0.31
362 0.3
363 0.33
364 0.3
365 0.32
366 0.27
367 0.26
368 0.27
369 0.3
370 0.28
371 0.25
372 0.22
373 0.19
374 0.2
375 0.18
376 0.14
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.14
389 0.15
390 0.19
391 0.19
392 0.19
393 0.19
394 0.2
395 0.19
396 0.18
397 0.17
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.11
412 0.18
413 0.22
414 0.27
415 0.29
416 0.3
417 0.36
418 0.45
419 0.53
420 0.55
421 0.57
422 0.58
423 0.58
424 0.61
425 0.55
426 0.52
427 0.42
428 0.34
429 0.28
430 0.23
431 0.21
432 0.16
433 0.14
434 0.07
435 0.06
436 0.04
437 0.05
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.13
443 0.14
444 0.16
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.17
450 0.15
451 0.14
452 0.13
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.19
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.16
464 0.14
465 0.12
466 0.1
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.12
473 0.15
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.2
478 0.19
479 0.19
480 0.17
481 0.16
482 0.16
483 0.19
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.15
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.1
492 0.1
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.13
501 0.15
502 0.2
503 0.23
504 0.26
505 0.26
506 0.3
507 0.32
508 0.31
509 0.32
510 0.26
511 0.27
512 0.24
513 0.19
514 0.16
515 0.13
516 0.14
517 0.11
518 0.12
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.1
524 0.13
525 0.17
526 0.18
527 0.2
528 0.21
529 0.22
530 0.23
531 0.24
532 0.26
533 0.22
534 0.23
535 0.21
536 0.21
537 0.21
538 0.21
539 0.18
540 0.11
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.06
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.06
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.1
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.1
569 0.11
570 0.1
571 0.1
572 0.09
573 0.1
574 0.16
575 0.16
576 0.19
577 0.21
578 0.3
579 0.37
580 0.43
581 0.45
582 0.44
583 0.47
584 0.48
585 0.45
586 0.4
587 0.35
588 0.3
589 0.26
590 0.22
591 0.19
592 0.14
593 0.14
594 0.12
595 0.12
596 0.14
597 0.16
598 0.16
599 0.17
600 0.18
601 0.18
602 0.18
603 0.17
604 0.14
605 0.11
606 0.14
607 0.15
608 0.16
609 0.15
610 0.15
611 0.13
612 0.13
613 0.14
614 0.12
615 0.14
616 0.13
617 0.12
618 0.14
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.13
623 0.09
624 0.08
625 0.13
626 0.17
627 0.18
628 0.18
629 0.19
630 0.2
631 0.24
632 0.29
633 0.31
634 0.34
635 0.37
636 0.38
637 0.41
638 0.4
639 0.37
640 0.33
641 0.26
642 0.18
643 0.14
644 0.15
645 0.12
646 0.14
647 0.14
648 0.16
649 0.16
650 0.21
651 0.31
652 0.32
653 0.37
654 0.37
655 0.38
656 0.39
657 0.4
658 0.37
659 0.29
660 0.3
661 0.23
662 0.22
663 0.2
664 0.17
665 0.15
666 0.13
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.12
673 0.13
674 0.13
675 0.13
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.1
680 0.11
681 0.12
682 0.12
683 0.15
684 0.2
685 0.27
686 0.31
687 0.36
688 0.43
689 0.49
690 0.55
691 0.58
692 0.56
693 0.53
694 0.53
695 0.5
696 0.44
697 0.39
698 0.33
699 0.27
700 0.24
701 0.22
702 0.17
703 0.13
704 0.11
705 0.09
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.15
710 0.17
711 0.18
712 0.19
713 0.21
714 0.2
715 0.22
716 0.24
717 0.2
718 0.2
719 0.19
720 0.18
721 0.17
722 0.16
723 0.14
724 0.12
725 0.1
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.1
730 0.13
731 0.13
732 0.17
733 0.17
734 0.19
735 0.23
736 0.26
737 0.29
738 0.31
739 0.32
740 0.29
741 0.31
742 0.31
743 0.32
744 0.32
745 0.36
746 0.35
747 0.34
748 0.34
749 0.37
750 0.41
751 0.38
752 0.33
753 0.25
754 0.25
755 0.25
756 0.23
757 0.2
758 0.15
759 0.14
760 0.13
761 0.11
762 0.09
763 0.08
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.14
768 0.15
769 0.16
770 0.18
771 0.22
772 0.22
773 0.23
774 0.22
775 0.23
776 0.24
777 0.23
778 0.21
779 0.18
780 0.16
781 0.14
782 0.12
783 0.09
784 0.08
785 0.09
786 0.1
787 0.11
788 0.13
789 0.14
790 0.16
791 0.18
792 0.19
793 0.18
794 0.19
795 0.2
796 0.2
797 0.19
798 0.17
799 0.15
800 0.14
801 0.13
802 0.11
803 0.09
804 0.07
805 0.06
806 0.07
807 0.09
808 0.1
809 0.12
810 0.14
811 0.18
812 0.21
813 0.24
814 0.31
815 0.35
816 0.38
817 0.4
818 0.4
819 0.35
820 0.35
821 0.35
822 0.32
823 0.3
824 0.29
825 0.25
826 0.25
827 0.26
828 0.24
829 0.22
830 0.16
831 0.12
832 0.09
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.06
837 0.09
838 0.09
839 0.1
840 0.1
841 0.11
842 0.12
843 0.21
844 0.31
845 0.38
846 0.44