Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q3F6

Protein Details
Accession B6Q3F6    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-507AEKKAPKKTAPKKTTARKKKVIBasic
676-699STVSPTPKLRRSNRIKAQQSNCEEHydrophilic
723-744DDMQRLRKSRPKATVKSKEPLPHydrophilic
758-777DLNPRVHKNQKDTPKAKKIDHydrophilic
842-863EDIEKGKDKKKRIARVSVLDMRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-506EKKAPKKTAPKKTTARKKKV
732-734RPK
848-853KDKKKR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito_nucl 10.666, cyto_mito 8.166, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
IPR037316  Yen1_H3TH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG tmf:PMAA_019630  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09906  H3TH_YEN1  
cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGIPGLGKAIGNADRIALSRLAVRHLEVSKRPIRIAVDISIWLFQLQAGRGGQNPELRTLFFRLVRLLALPIHPLFVYDGKQKPPFKRGKATTGRSYGSAPIINLSKILIDLFKFPRHDAPGEAEAECARLQQAGVVDAVMSNDVDTLMFGSGLTVMNFSKEGSTGTSAATHIDCYTTKTQLDVEANVKLTRAGMVLFAMLSGGDYLPSGVTKCGPGLAGEIAKAGFGEDLFEIIYSNEDEVEAKLAEWRERLQYELDENESGYFQSKHKAVRIPDTFPDRQILSFYAKPIVSTEREIEKLRQRLVEAWDHEINALELRNFVSNYFDWKYRSGARKLIRNLAEPLILTRLRLARSPIATFGYGSYVPNADLPVLQRIYRSRMHFSTGCIPQVQVEMIPADVVGLDLDAEEPNPPPELSQLTEASLQPAEDEDDAGSETVPPEEQAPKFNAPKNPYNPFEPEKIWVFETVAKMGIPDVVDRWQKQEAEKKAPKKTAPKKTTARKKKVIDPSMKPGGILRYATVTKPGSDMNSVKKAHILDAAGLSSSSPQQPSSQSTYSSQYSVMSDTGIFSSQSPRQSQKSMKLSGLAMDELASQFATTCSIGDGYIDVRDSYFRHPPSIRGFDSDSFDFDTELEGSVPFSPLHSPSPTRFKISYTAAGSLSPLATEATRVNPPTSTVSPTPKLRRSNRIKAQQSNCEESLETAFDSLRVSPAVKSPEFEIHDDMQRLRKSRPKATVKSKEPLPAPSPKVPEAQLNDDLNPRVHKNQKDTPKAKKIDEVIDLEIVDPAPAKVEVKEHYQSQSQPPKALTELIRTHKGFWTVELCEQDEASPTNSEPQQEQEEDIEKGKDKKKRIARVSVLDMR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.21
4 0.16
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.26
12 0.3
13 0.36
14 0.37
15 0.44
16 0.47
17 0.49
18 0.48
19 0.46
20 0.45
21 0.43
22 0.42
23 0.36
24 0.32
25 0.3
26 0.31
27 0.27
28 0.24
29 0.18
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.12
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.21
38 0.24
39 0.28
40 0.3
41 0.3
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.31
46 0.32
47 0.34
48 0.31
49 0.31
50 0.29
51 0.28
52 0.28
53 0.25
54 0.23
55 0.19
56 0.18
57 0.2
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.2
65 0.24
66 0.29
67 0.34
68 0.43
69 0.5
70 0.54
71 0.61
72 0.67
73 0.68
74 0.73
75 0.73
76 0.76
77 0.79
78 0.8
79 0.78
80 0.75
81 0.68
82 0.59
83 0.55
84 0.47
85 0.41
86 0.35
87 0.26
88 0.23
89 0.24
90 0.22
91 0.2
92 0.17
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.1
97 0.09
98 0.16
99 0.2
100 0.25
101 0.27
102 0.29
103 0.35
104 0.37
105 0.38
106 0.34
107 0.36
108 0.35
109 0.36
110 0.34
111 0.28
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.15
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.1
160 0.12
161 0.11
162 0.15
163 0.18
164 0.2
165 0.19
166 0.2
167 0.2
168 0.24
169 0.26
170 0.24
171 0.23
172 0.23
173 0.25
174 0.24
175 0.23
176 0.17
177 0.15
178 0.13
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.05
214 0.04
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.19
238 0.19
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.1
253 0.15
254 0.17
255 0.2
256 0.25
257 0.3
258 0.31
259 0.39
260 0.43
261 0.42
262 0.44
263 0.49
264 0.45
265 0.4
266 0.4
267 0.31
268 0.27
269 0.25
270 0.22
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.2
277 0.2
278 0.22
279 0.18
280 0.19
281 0.21
282 0.2
283 0.23
284 0.25
285 0.29
286 0.33
287 0.36
288 0.36
289 0.34
290 0.32
291 0.34
292 0.35
293 0.37
294 0.31
295 0.31
296 0.3
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.19
301 0.14
302 0.12
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.11
310 0.1
311 0.16
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.21
316 0.24
317 0.28
318 0.34
319 0.32
320 0.38
321 0.4
322 0.46
323 0.48
324 0.53
325 0.49
326 0.45
327 0.44
328 0.37
329 0.34
330 0.26
331 0.23
332 0.19
333 0.17
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.17
339 0.19
340 0.19
341 0.21
342 0.22
343 0.21
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.15
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.14
364 0.18
365 0.23
366 0.25
367 0.26
368 0.26
369 0.31
370 0.3
371 0.31
372 0.34
373 0.31
374 0.29
375 0.24
376 0.23
377 0.19
378 0.19
379 0.16
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.09
430 0.1
431 0.12
432 0.15
433 0.19
434 0.23
435 0.27
436 0.31
437 0.32
438 0.39
439 0.43
440 0.45
441 0.43
442 0.43
443 0.43
444 0.41
445 0.39
446 0.32
447 0.29
448 0.26
449 0.25
450 0.22
451 0.18
452 0.16
453 0.17
454 0.16
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.11
465 0.14
466 0.14
467 0.17
468 0.19
469 0.2
470 0.24
471 0.31
472 0.32
473 0.4
474 0.47
475 0.51
476 0.55
477 0.59
478 0.61
479 0.63
480 0.68
481 0.68
482 0.67
483 0.69
484 0.71
485 0.76
486 0.82
487 0.82
488 0.81
489 0.79
490 0.79
491 0.79
492 0.8
493 0.78
494 0.75
495 0.69
496 0.68
497 0.65
498 0.6
499 0.51
500 0.42
501 0.35
502 0.29
503 0.24
504 0.17
505 0.14
506 0.15
507 0.15
508 0.18
509 0.16
510 0.15
511 0.16
512 0.16
513 0.14
514 0.17
515 0.19
516 0.2
517 0.28
518 0.28
519 0.27
520 0.29
521 0.28
522 0.25
523 0.25
524 0.2
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.1
529 0.1
530 0.08
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.1
537 0.13
538 0.18
539 0.23
540 0.23
541 0.24
542 0.25
543 0.29
544 0.28
545 0.26
546 0.22
547 0.17
548 0.17
549 0.16
550 0.14
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.12
559 0.15
560 0.19
561 0.22
562 0.25
563 0.28
564 0.34
565 0.39
566 0.44
567 0.48
568 0.47
569 0.44
570 0.43
571 0.4
572 0.36
573 0.32
574 0.23
575 0.15
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.09
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.1
599 0.14
600 0.21
601 0.21
602 0.26
603 0.27
604 0.32
605 0.39
606 0.44
607 0.41
608 0.37
609 0.4
610 0.36
611 0.4
612 0.35
613 0.29
614 0.24
615 0.23
616 0.19
617 0.16
618 0.15
619 0.11
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.11
630 0.15
631 0.17
632 0.2
633 0.24
634 0.34
635 0.35
636 0.39
637 0.37
638 0.36
639 0.39
640 0.4
641 0.42
642 0.35
643 0.35
644 0.3
645 0.3
646 0.28
647 0.23
648 0.18
649 0.11
650 0.09
651 0.07
652 0.06
653 0.08
654 0.09
655 0.11
656 0.15
657 0.17
658 0.17
659 0.17
660 0.19
661 0.24
662 0.25
663 0.27
664 0.27
665 0.33
666 0.37
667 0.45
668 0.52
669 0.53
670 0.61
671 0.63
672 0.7
673 0.73
674 0.78
675 0.8
676 0.82
677 0.83
678 0.83
679 0.84
680 0.83
681 0.79
682 0.74
683 0.65
684 0.56
685 0.47
686 0.39
687 0.33
688 0.25
689 0.19
690 0.13
691 0.12
692 0.11
693 0.11
694 0.1
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.11
699 0.16
700 0.22
701 0.21
702 0.22
703 0.24
704 0.31
705 0.33
706 0.34
707 0.33
708 0.3
709 0.35
710 0.36
711 0.35
712 0.35
713 0.37
714 0.38
715 0.39
716 0.43
717 0.46
718 0.53
719 0.61
720 0.64
721 0.7
722 0.78
723 0.82
724 0.82
725 0.82
726 0.77
727 0.74
728 0.66
729 0.63
730 0.56
731 0.55
732 0.54
733 0.54
734 0.54
735 0.49
736 0.5
737 0.45
738 0.47
739 0.43
740 0.43
741 0.44
742 0.41
743 0.4
744 0.4
745 0.4
746 0.36
747 0.35
748 0.32
749 0.34
750 0.4
751 0.45
752 0.5
753 0.57
754 0.65
755 0.72
756 0.76
757 0.78
758 0.8
759 0.8
760 0.75
761 0.72
762 0.67
763 0.63
764 0.61
765 0.54
766 0.46
767 0.41
768 0.38
769 0.31
770 0.26
771 0.2
772 0.14
773 0.1
774 0.08
775 0.08
776 0.09
777 0.1
778 0.1
779 0.15
780 0.17
781 0.24
782 0.28
783 0.29
784 0.33
785 0.37
786 0.4
787 0.46
788 0.54
789 0.5
790 0.51
791 0.48
792 0.48
793 0.45
794 0.47
795 0.39
796 0.38
797 0.42
798 0.45
799 0.52
800 0.49
801 0.5
802 0.48
803 0.5
804 0.42
805 0.38
806 0.37
807 0.32
808 0.36
809 0.37
810 0.34
811 0.31
812 0.3
813 0.27
814 0.24
815 0.22
816 0.2
817 0.18
818 0.17
819 0.23
820 0.24
821 0.26
822 0.24
823 0.28
824 0.32
825 0.31
826 0.33
827 0.3
828 0.32
829 0.32
830 0.33
831 0.31
832 0.3
833 0.37
834 0.42
835 0.45
836 0.49
837 0.57
838 0.64
839 0.72
840 0.76
841 0.79
842 0.81
843 0.82