FuNGI

B6QP41

Protein Details

Accession

B6QP41

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-178	HTSWTARKERKASAKRWHARLGH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
162-173	RKERKASAKRWH

Subcellular Location(s)

cyto 12, pero 8, nucl 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	tmf:PMAA_047980 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MEKDLAALSINDYPLKHSSILDSGSTIHVFNEIERFINFQKARPGDYLWAGTHKVPILGYGEVDIEVHGANNQLRFLRLYEVAYCKDFVANLVSLRQLRKQGIWWDGRQGYDCLRHEDDHQIVAYIRDMEGQFILEYINHDHPMIKTGFIIRRHQHTSWTARKERKASAKRWHARLGHPGPQVIQHLANATKGVRVTGLSKGPTTVQCEACARAKIQRMVRREYRKPAELPGDELAIDIHDFEKTTLKDDKDIRTLMLITDRYSGYTWDFYLTSHTTLEVLDMLKWLFAYLKKQYNLTPKRMEMDNEITMVIPGVADWLTEQHVKLLPSAPYAQAQNGGAERVGRIIKDKGRAMRASARFPRDLWPEICRAAVYLYNLSPRYGSQWKTPFDVFHTQVALMNGISIKDQKPQIGHLKVYGCRAYAMTTNALKKENRLDRFNPKAWIGYLVGYSSTNIYKIWNPKTGAIVRVRDVIFDESRVFSGHLLELEDELLGVSVEELARLLLRIDVSNNPEYINDLDEEMEDATFNQDRNNEHTTTQGSTGSESEEPSNRVSEDSSGPSLTVGERLLDGIDKYAYPTPPESPPSALLAGSLTIVQDNDPTLREGSEHAAGMSTDGEGSAAALVQEATNREGVAGALIGENIGEGSAAALNTRDSIDSSQRTRGKHFLEAGSAVSLKKSREGVAGAPTRTVDTVLTRCRDKLNPWRTAFLAGTRDRQYKVNDVKFDHSSLRRKLRAAVQLQAMMTGDIYNYERLTRQVLGGRRLQSFLVRDLPPAPKTHRDVESHPLGLLFQKAKIGHLDSHDPAGSWTEVPQSEAREKQILDCMWVYVYKADKKGRLVKCKARLVARGDQEKEDDMRDTYAATLAARSFRTLMSICARFGLEIKGFDAVNAFVNAKIDEEMYMKMPPGYRKRGLIYRINKAIYGLRRSPLLWQEELTGTLKDLGFKAVPHEPCCMLRSGIILFFYVDDIVLAYKKEREAEANEIMARLRKKYNITGGEDLDWFLGMRIVRDREKKLIWLSQATYIDKIAKLVDSHQNDDVPMSREELLPYEGTADYSSIHKYQRKVGSIMYTAVSTRPDVAFAVSRLARFLTNPGPKHHKAADKVLSYLRRFRTYALKLGGGDDYTVSTDASFGDNTLDLTTSTTEAELLALAQGVKEGKYILRLLLELDIRFQTPTLHVYCDNKQTLGLLEKDAPRLRTKLRHVDIHNHWVRQEVQKGDVQVHYMPTKDMIANGLTKALSKQEHQIFLNQIGVENIDSRLAPQQKDIENPDIEELLSLNDMPDNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.25
3	0.24
4	0.21
5	0.23
6	0.26
7	0.28
8	0.24
9	0.22
10	0.21
11	0.22
12	0.22
13	0.19
14	0.14
15	0.15
16	0.14
17	0.15
18	0.18
19	0.16
20	0.17
21	0.17
22	0.22
23	0.21
24	0.31
25	0.3
26	0.29
27	0.38
28	0.39
29	0.43
30	0.41
31	0.43
32	0.38
33	0.41
34	0.41
35	0.34
36	0.35
37	0.33
38	0.31
39	0.32
40	0.28
41	0.25
42	0.2
43	0.21
44	0.2
45	0.18
46	0.17
47	0.14
48	0.14
49	0.13
50	0.13
51	0.1
52	0.08
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.1
57	0.12
58	0.13
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.19
63	0.2
64	0.21
65	0.21
66	0.23
67	0.26
68	0.3
69	0.32
70	0.32
71	0.31
72	0.27
73	0.26
74	0.23
75	0.19
76	0.18
77	0.17
78	0.17
79	0.18
80	0.21
81	0.24
82	0.27
83	0.3
84	0.32
85	0.33
86	0.35
87	0.4
88	0.43
89	0.48
90	0.52
91	0.5
92	0.52
93	0.52
94	0.51
95	0.47
96	0.42
97	0.38
98	0.4
99	0.4
100	0.38
101	0.39
102	0.38
103	0.38
104	0.44
105	0.41
106	0.35
107	0.32
108	0.27
109	0.24
110	0.23
111	0.22
112	0.16
113	0.14
114	0.15
115	0.15
116	0.15
117	0.14
118	0.15
119	0.13
120	0.11
121	0.12
122	0.08
123	0.1
124	0.14
125	0.17
126	0.17
127	0.17
128	0.19
129	0.19
130	0.24
131	0.23
132	0.19
133	0.17
134	0.24
135	0.3
136	0.33
137	0.41
138	0.4
139	0.47
140	0.53
141	0.53
142	0.52
143	0.54
144	0.59
145	0.6
146	0.65
147	0.66
148	0.68
149	0.74
150	0.74
151	0.75
152	0.76
153	0.76
154	0.75
155	0.77
156	0.8
157	0.81
158	0.82
159	0.82
160	0.76
161	0.72
162	0.74
163	0.7
164	0.67
165	0.61
166	0.56
167	0.48
168	0.46
169	0.43
170	0.35
171	0.29
172	0.21
173	0.22
174	0.22
175	0.21
176	0.19
177	0.17
178	0.16
179	0.15
180	0.15
181	0.12
182	0.13
183	0.14
184	0.18
185	0.23
186	0.22
187	0.22
188	0.23
189	0.26
190	0.28
191	0.31
192	0.32
193	0.28
194	0.3
195	0.32
196	0.34
197	0.35
198	0.34
199	0.3
200	0.3
201	0.36
202	0.4
203	0.47
204	0.51
205	0.52
206	0.58
207	0.66
208	0.69
209	0.7
210	0.73
211	0.72
212	0.71
213	0.68
214	0.67
215	0.66
216	0.57
217	0.53
218	0.44
219	0.38
220	0.31
221	0.28
222	0.21
223	0.13
224	0.11
225	0.08
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.14
231	0.13
232	0.18
233	0.24
234	0.25
235	0.31
236	0.36
237	0.41
238	0.4
239	0.41
240	0.37
241	0.33
242	0.32
243	0.26
244	0.27
245	0.23
246	0.18
247	0.2
248	0.2
249	0.19
250	0.19
251	0.19
252	0.15
253	0.16
254	0.15
255	0.14
256	0.14
257	0.13
258	0.18
259	0.19
260	0.18
261	0.16
262	0.16
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.1
267	0.09
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.16
277	0.22
278	0.3
279	0.31
280	0.33
281	0.39
282	0.47
283	0.53
284	0.55
285	0.54
286	0.48
287	0.51
288	0.51
289	0.48
290	0.43
291	0.42
292	0.36
293	0.3
294	0.28
295	0.24
296	0.21
297	0.19
298	0.12
299	0.06
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.08
307	0.09
308	0.1
309	0.11
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.2
314	0.18
315	0.2
316	0.21
317	0.2
318	0.19
319	0.2
320	0.19
321	0.18
322	0.17
323	0.16
324	0.15
325	0.14
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.1
332	0.13
333	0.18
334	0.23
335	0.28
336	0.33
337	0.35
338	0.41
339	0.42
340	0.43
341	0.47
342	0.47
343	0.49
344	0.52
345	0.51
346	0.46
347	0.46
348	0.48
349	0.44
350	0.45
351	0.38
352	0.34
353	0.33
354	0.32
355	0.31
356	0.24
357	0.2
358	0.16
359	0.16
360	0.15
361	0.14
362	0.14
363	0.19
364	0.19
365	0.19
366	0.18
367	0.16
368	0.2
369	0.24
370	0.25
371	0.28
372	0.35
373	0.37
374	0.4
375	0.41
376	0.36
377	0.35
378	0.41
379	0.34
380	0.3
381	0.29
382	0.25
383	0.26
384	0.25
385	0.2
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.14
394	0.16
395	0.17
396	0.18
397	0.24
398	0.32
399	0.33
400	0.33
401	0.32
402	0.36
403	0.36
404	0.39
405	0.34
406	0.25
407	0.22
408	0.22
409	0.2
410	0.17
411	0.17
412	0.17
413	0.2
414	0.22
415	0.24
416	0.27
417	0.26
418	0.26
419	0.33
420	0.38
421	0.39
422	0.42
423	0.46
424	0.52
425	0.59
426	0.6
427	0.54
428	0.46
429	0.42
430	0.37
431	0.34
432	0.26
433	0.19
434	0.16
435	0.13
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.09
444	0.13
445	0.21
446	0.25
447	0.3
448	0.31
449	0.32
450	0.38
451	0.38
452	0.39
453	0.36
454	0.34
455	0.29
456	0.33
457	0.32
458	0.26
459	0.26
460	0.24
461	0.19
462	0.18
463	0.18
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.13
468	0.09
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.03
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.05
493	0.06
494	0.07
495	0.1
496	0.14
497	0.16
498	0.16
499	0.15
500	0.14
501	0.16
502	0.15
503	0.13
504	0.09
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.06
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.11
518	0.13
519	0.18
520	0.22
521	0.21
522	0.2
523	0.22
524	0.23
525	0.21
526	0.21
527	0.17
528	0.14
529	0.13
530	0.13
531	0.13
532	0.12
533	0.11
534	0.12
535	0.12
536	0.14
537	0.14
538	0.14
539	0.12
540	0.12
541	0.12
542	0.12
543	0.12
544	0.13
545	0.13
546	0.13
547	0.12
548	0.12
549	0.12
550	0.1
551	0.09
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.07
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.12
567	0.14
568	0.17
569	0.19
570	0.19
571	0.17
572	0.18
573	0.19
574	0.18
575	0.15
576	0.12
577	0.1
578	0.09
579	0.07
580	0.06
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.05
603	0.04
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.02
610	0.02
611	0.02
612	0.03
613	0.03
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.04
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.02
631	0.02
632	0.02
633	0.02
634	0.02
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.04
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.07
645	0.11
646	0.14
647	0.16
648	0.24
649	0.27
650	0.28
651	0.31
652	0.35
653	0.33
654	0.34
655	0.34
656	0.28
657	0.25
658	0.25
659	0.22
660	0.17
661	0.15
662	0.11
663	0.09
664	0.1
665	0.09
666	0.11
667	0.11
668	0.12
669	0.13
670	0.14
671	0.15
672	0.2
673	0.24
674	0.22
675	0.21
676	0.2
677	0.19
678	0.18
679	0.17
680	0.1
681	0.08
682	0.12
683	0.16
684	0.18
685	0.19
686	0.19
687	0.22
688	0.24
689	0.28
690	0.34
691	0.39
692	0.45
693	0.46
694	0.47
695	0.44
696	0.45
697	0.39
698	0.31
699	0.3
700	0.22
701	0.26
702	0.28
703	0.29
704	0.28
705	0.31
706	0.3
707	0.33
708	0.4
709	0.4
710	0.4
711	0.4
712	0.43
713	0.41
714	0.41
715	0.37
716	0.34
717	0.36
718	0.39
719	0.45
720	0.44
721	0.43
722	0.45
723	0.47
724	0.49
725	0.44
726	0.41
727	0.35
728	0.35
729	0.33
730	0.3
731	0.23
732	0.15
733	0.12
734	0.08
735	0.06
736	0.05
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.08
742	0.09
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.16
747	0.2
748	0.23
749	0.28
750	0.3
751	0.29
752	0.29
753	0.27
754	0.25
755	0.23
756	0.22
757	0.23
758	0.2
759	0.2
760	0.22
761	0.26
762	0.24
763	0.26
764	0.27
765	0.27
766	0.31
767	0.35
768	0.37
769	0.36
770	0.38
771	0.42
772	0.42
773	0.36
774	0.32
775	0.27
776	0.22
777	0.19
778	0.19
779	0.13
780	0.09
781	0.12
782	0.13
783	0.13
784	0.15
785	0.17
786	0.16
787	0.18
788	0.22
789	0.19
790	0.21
791	0.2
792	0.18
793	0.16
794	0.16
795	0.14
796	0.09
797	0.09
798	0.11
799	0.11
800	0.13
801	0.14
802	0.16
803	0.19
804	0.21
805	0.22
806	0.22
807	0.22
808	0.22
809	0.26
810	0.23
811	0.21
812	0.2
813	0.18
814	0.15
815	0.15
816	0.14
817	0.11
818	0.15
819	0.17
820	0.23
821	0.26
822	0.29
823	0.35
824	0.44
825	0.5
826	0.55
827	0.6
828	0.63
829	0.68
830	0.72
831	0.7
832	0.65
833	0.63
834	0.59
835	0.58
836	0.56
837	0.54
838	0.49
839	0.46
840	0.42
841	0.38
842	0.33
843	0.26
844	0.21
845	0.15
846	0.14
847	0.12
848	0.11
849	0.1
850	0.1
851	0.09
852	0.07
853	0.08
854	0.08
855	0.1
856	0.1
857	0.11
858	0.11
859	0.1
860	0.13
861	0.13
862	0.15
863	0.19
864	0.2
865	0.19
866	0.2
867	0.2
868	0.17
869	0.18
870	0.19
871	0.14
872	0.13
873	0.13
874	0.14
875	0.14
876	0.13
877	0.13
878	0.1
879	0.09
880	0.1
881	0.1
882	0.08
883	0.09
884	0.1
885	0.09
886	0.09
887	0.08
888	0.08
889	0.09
890	0.1
891	0.1
892	0.11
893	0.1
894	0.12
895	0.15
896	0.21
897	0.28
898	0.34
899	0.36
900	0.39
901	0.44
902	0.49
903	0.51
904	0.53
905	0.53
906	0.53
907	0.57
908	0.53
909	0.49
910	0.44
911	0.44
912	0.4
913	0.4
914	0.34
915	0.29
916	0.3
917	0.3
918	0.34
919	0.34
920	0.32
921	0.26
922	0.24
923	0.25
924	0.24
925	0.26
926	0.23
927	0.17
928	0.13
929	0.15
930	0.14
931	0.13
932	0.13
933	0.13
934	0.12
935	0.12
936	0.16
937	0.2
938	0.23
939	0.24
940	0.26
941	0.26
942	0.27
943	0.29
944	0.27
945	0.2
946	0.18
947	0.18
948	0.16
949	0.16
950	0.14
951	0.13
952	0.11
953	0.11
954	0.11
955	0.08
956	0.07
957	0.05
958	0.05
959	0.05
960	0.06
961	0.06
962	0.07
963	0.09
964	0.11
965	0.13
966	0.14
967	0.17
968	0.21
969	0.26
970	0.28
971	0.28
972	0.27
973	0.25
974	0.25
975	0.26
976	0.23
977	0.2
978	0.21
979	0.24
980	0.28
981	0.34
982	0.42
983	0.44
984	0.49
985	0.5
986	0.48
987	0.45
988	0.41
989	0.35
990	0.26
991	0.19
992	0.13
993	0.09
994	0.1
995	0.08
996	0.09
997	0.13
998	0.18
999	0.24
1000	0.31
1001	0.35
1002	0.39
1003	0.41
1004	0.45
1005	0.45
1006	0.46
1007	0.43
1008	0.42
1009	0.4
1010	0.4
1011	0.43
1012	0.39
1013	0.34
1014	0.3
1015	0.29
1016	0.24
1017	0.23
1018	0.17
1019	0.14
1020	0.14
1021	0.18
1022	0.25
1023	0.26
1024	0.29
1025	0.31
1026	0.31
1027	0.29
1028	0.3
1029	0.28
1030	0.23
1031	0.19
1032	0.19
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.18
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.14
1041	0.13
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.09
1046	0.11
1047	0.14
1048	0.15
1049	0.21
1050	0.25
1051	0.27
1052	0.36
1053	0.43
1054	0.46
1055	0.45
1056	0.45
1057	0.45
1058	0.42
1059	0.42
1060	0.34
1061	0.26
1062	0.22
1063	0.22
1064	0.19
1065	0.14
1066	0.14
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.12
1070	0.14
1071	0.16
1072	0.15
1073	0.21
1074	0.19
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.2
1078	0.18
1079	0.16
1080	0.21
1081	0.24
1082	0.31
1083	0.34
1084	0.4
1085	0.48
1086	0.49
1087	0.54
1088	0.56
1089	0.55
1090	0.52
1091	0.58
1092	0.6
1093	0.53
1094	0.54
1095	0.55
1096	0.55
1097	0.51
1098	0.54
1099	0.5
1100	0.47
1101	0.45
1102	0.45
1103	0.49
1104	0.46
1105	0.51
1106	0.46
1107	0.44
1108	0.39
1109	0.4
1110	0.39
1111	0.28
1112	0.24
1113	0.16
1114	0.13
1115	0.11
1116	0.11
1117	0.1
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.08
1121	0.1
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.1
1127	0.1
1128	0.1
1129	0.08
1130	0.1
1131	0.11
1132	0.1
1133	0.1
1134	0.1
1135	0.09
1136	0.09
1137	0.09
1138	0.07
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.07
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.09
1149	0.1
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.15
1153	0.16
1154	0.16
1155	0.17
1156	0.2
1157	0.22
1158	0.18
1159	0.2
1160	0.2
1161	0.19
1162	0.19
1163	0.18
1164	0.15
1165	0.15
1166	0.2
1167	0.19
1168	0.21
1169	0.24
1170	0.29
1171	0.34
1172	0.41
1173	0.41
1174	0.36
1175	0.34
1176	0.32
1177	0.32
1178	0.32
1179	0.28
1180	0.23
1181	0.27
1182	0.29
1183	0.36
1184	0.39
1185	0.38
1186	0.38
1187	0.42
1188	0.46
1189	0.5
1190	0.56
1191	0.59
1192	0.61
1193	0.67
1194	0.68
1195	0.73
1196	0.73
1197	0.74
1198	0.71
1199	0.62
1200	0.56
1201	0.52
1202	0.51
1203	0.48
1204	0.48
1205	0.41
1206	0.38
1207	0.39
1208	0.41
1209	0.4
1210	0.37
1211	0.32
1212	0.27
1213	0.29
1214	0.27
1215	0.25
1216	0.24
1217	0.22
1218	0.23
1219	0.21
1220	0.2
1221	0.17
1222	0.18
1223	0.19
1224	0.19
1225	0.2
1226	0.17
1227	0.17
1228	0.18
1229	0.21
1230	0.22
1231	0.22
1232	0.31
1233	0.36
1234	0.42
1235	0.42
1236	0.47
1237	0.45
1238	0.44
1239	0.46
1240	0.37
1241	0.3
1242	0.25
1243	0.24
1244	0.19
1245	0.17
1246	0.15
1247	0.11
1248	0.11
1249	0.12
1250	0.21
1251	0.25
1252	0.25
1253	0.29
1254	0.36
1255	0.38
1256	0.45
1257	0.5
1258	0.48
1259	0.44
1260	0.45
1261	0.42
1262	0.35
1263	0.31
1264	0.24
1265	0.19
1266	0.13
1267	0.12
1268	0.1
1269	0.09

B6QP41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer