Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059JHT5

Protein Details
Accession A0A059JHT5    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-90AVSEHPPSKKSKKAQEKPAKPEVATVKSSSTKPKKEKDTVNGAKSEKLSVKVDKKPTKELKPRKRAADFLHydrophilic
101-152EIAPKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAESKEKTKKAKSKTKEVKKEPEEAPBasic
318-337GANRRFKKTPWNQIEKRRLDHydrophilic
402-422IEDKKEETPKKKESKSKDEVEAcidic
441-469NVEAEKKSTEKKESKKSKKKVVNDAPVISHydrophilic
475-500DEKQSKGASKVKKVEEKPKKVKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-14KATKRKAPA
22-86VSEHPPSKKSKKAQEKPAKPEVATVKSSSTKPKKEKDTVNGAKSEKLSVKVDKKPTKELKPRKRA
103-146APKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAESKEKTKKAKSKTKEVKK
209-222SKKAMKAIRKKKKE
320-363NRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSRDGWSKAISKENSKRTKKAEKM
410-500PKKKESKSKDEVEAKPVTNGKATKEKKTETGNVEAEKKSTEKKESKKSKKKVVNDAPVISEKPTKDEKQSKGASKVKKVEEKPKKVKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 10.166, cyto 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MALEKKATKRKAPATTAAAPAVSEHPPSKKSKKAQEKPAKPEVATVKSSSTKPKKEKDTVNGAKSEKLSVKVDKKPTKELKPRKRAADFLSDDEEEEPKQEIAPKPKAEKKETQPKKKAKSEKPGVSAESKEKTKKAKSKTKEVKKEPEEAPELVEEQSPSSSDAGSDEEAEDDQTLALIRGFESSGDEDPSDDEGFEPGQEVPKIPDSKKAMKAIRKKKKESSAPEEPGTVYVGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGDISRLRLSRNRTTGKSKHYAFIEFTSSSVAKVVAATMQNYLMFGHILKCMYIPKDKVHADMWKGANRRFKKTPWNQIEKRRLDAGKSRDGWSKAISKENSKRTKKAEKMKALGYEYEIPKLKSVEEVPVALAVQDQIEEDTPAPVAAIEDKKEETPKKKESKSKDEVEAKPVTNGKATKEKKTETGNVEAEKKSTEKKESKKSKKKVVNDAPVISEKPTKDEKQSKGASKVKKVEEKPKKVKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.71
3 0.67
4 0.59
5 0.49
6 0.39
7 0.34
8 0.29
9 0.23
10 0.21
11 0.21
12 0.25
13 0.3
14 0.38
15 0.45
16 0.51
17 0.58
18 0.66
19 0.74
20 0.78
21 0.85
22 0.88
23 0.9
24 0.89
25 0.9
26 0.84
27 0.73
28 0.7
29 0.67
30 0.62
31 0.55
32 0.48
33 0.43
34 0.42
35 0.45
36 0.48
37 0.5
38 0.54
39 0.6
40 0.68
41 0.73
42 0.77
43 0.84
44 0.81
45 0.83
46 0.82
47 0.78
48 0.76
49 0.67
50 0.62
51 0.54
52 0.51
53 0.43
54 0.38
55 0.37
56 0.39
57 0.46
58 0.5
59 0.6
60 0.62
61 0.63
62 0.7
63 0.74
64 0.76
65 0.79
66 0.82
67 0.82
68 0.85
69 0.88
70 0.87
71 0.84
72 0.79
73 0.73
74 0.73
75 0.65
76 0.58
77 0.55
78 0.46
79 0.41
80 0.36
81 0.32
82 0.21
83 0.19
84 0.16
85 0.11
86 0.12
87 0.18
88 0.22
89 0.3
90 0.38
91 0.42
92 0.49
93 0.55
94 0.62
95 0.62
96 0.66
97 0.67
98 0.71
99 0.76
100 0.79
101 0.82
102 0.85
103 0.88
104 0.88
105 0.89
106 0.87
107 0.88
108 0.87
109 0.85
110 0.81
111 0.75
112 0.69
113 0.62
114 0.56
115 0.5
116 0.46
117 0.43
118 0.41
119 0.42
120 0.47
121 0.52
122 0.57
123 0.61
124 0.65
125 0.67
126 0.75
127 0.81
128 0.84
129 0.85
130 0.86
131 0.86
132 0.8
133 0.81
134 0.72
135 0.68
136 0.61
137 0.5
138 0.43
139 0.33
140 0.29
141 0.22
142 0.2
143 0.14
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.16
192 0.2
193 0.19
194 0.27
195 0.3
196 0.37
197 0.42
198 0.48
199 0.48
200 0.53
201 0.63
202 0.67
203 0.71
204 0.73
205 0.74
206 0.75
207 0.78
208 0.79
209 0.77
210 0.75
211 0.74
212 0.69
213 0.64
214 0.56
215 0.47
216 0.38
217 0.3
218 0.22
219 0.12
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.19
248 0.25
249 0.27
250 0.35
251 0.39
252 0.4
253 0.48
254 0.53
255 0.55
256 0.57
257 0.51
258 0.47
259 0.44
260 0.42
261 0.36
262 0.32
263 0.28
264 0.21
265 0.2
266 0.18
267 0.16
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.13
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.27
296 0.27
297 0.29
298 0.3
299 0.32
300 0.3
301 0.35
302 0.36
303 0.34
304 0.36
305 0.38
306 0.44
307 0.44
308 0.48
309 0.46
310 0.48
311 0.54
312 0.6
313 0.67
314 0.67
315 0.74
316 0.74
317 0.79
318 0.85
319 0.77
320 0.71
321 0.67
322 0.58
323 0.52
324 0.53
325 0.48
326 0.47
327 0.46
328 0.46
329 0.45
330 0.45
331 0.43
332 0.38
333 0.39
334 0.33
335 0.39
336 0.38
337 0.42
338 0.48
339 0.57
340 0.64
341 0.63
342 0.66
343 0.67
344 0.75
345 0.74
346 0.77
347 0.77
348 0.76
349 0.75
350 0.73
351 0.71
352 0.63
353 0.55
354 0.48
355 0.44
356 0.36
357 0.37
358 0.34
359 0.28
360 0.28
361 0.28
362 0.24
363 0.21
364 0.21
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.14
372 0.12
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.1
388 0.13
389 0.14
390 0.16
391 0.18
392 0.2
393 0.28
394 0.35
395 0.38
396 0.44
397 0.53
398 0.61
399 0.68
400 0.75
401 0.78
402 0.81
403 0.81
404 0.79
405 0.79
406 0.79
407 0.73
408 0.71
409 0.67
410 0.57
411 0.54
412 0.5
413 0.41
414 0.38
415 0.36
416 0.35
417 0.39
418 0.43
419 0.47
420 0.51
421 0.53
422 0.54
423 0.6
424 0.63
425 0.57
426 0.62
427 0.58
428 0.55
429 0.57
430 0.51
431 0.44
432 0.39
433 0.36
434 0.35
435 0.36
436 0.42
437 0.46
438 0.54
439 0.65
440 0.73
441 0.82
442 0.86
443 0.89
444 0.9
445 0.91
446 0.91
447 0.91
448 0.9
449 0.9
450 0.86
451 0.79
452 0.73
453 0.67
454 0.59
455 0.5
456 0.45
457 0.35
458 0.33
459 0.39
460 0.38
461 0.45
462 0.53
463 0.55
464 0.6
465 0.68
466 0.7
467 0.72
468 0.76
469 0.75
470 0.75
471 0.78
472 0.78
473 0.79
474 0.79
475 0.8
476 0.83
477 0.85
478 0.87
479 0.89
480 0.9