Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059JF47

Protein Details
Accession A0A059JF47    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-231DYRRKRFDDKEHRRRRGQARDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-227GRRHRGPRGDSDGDYRRKRFDDKEHRRRRG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, cyto 4, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEERTAVEALASAANGTMDIGMDIDMDLDLGQLPEPDPIELEPVSTLTVASAIAGQTEVGVANPNDEPQLEKVHIRGVDELTTDDIKRFAGEHFTLEEPERIEWIDDTSANIIYSSAEVASKALSSFTQENVEDAVTSSPSLRLRTAKALSSHPDSVLQVRMAVKSDRKKHRAYEASRFYLMHPEHDPRERMRNEFSGRRHRGPRGDSDGDYRRKRFDDKEHRRRRGQARDDNFDVSMYDDDADRGRRASSGDISSTGSHSRSRARRNNRDLFDDRMESLEGRLRDRSASPSRANGDGPDLRLAGGSSSNRRFRDRPSLSGRDSRDRSRSNAGKELYRSGNNAGDEITRGRELFPNKTASSYLKQELLMNTVSPPANTVHRRSDAFDAADETTDLFAQRMTVPFVDGTNDDAKRSNKRNVELFPDSTKDRSQSLNIRGLSSENDGVSIRGAASGGISIKGAANVRELFPSKYTGNEGKELFSDTLEGRGGRRRRAEDMFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.04
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.09
48 0.08
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.13
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.26
64 0.22
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.11
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.2
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.23
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.14
89 0.14
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.1
113 0.11
114 0.13
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.21
132 0.28
133 0.3
134 0.31
135 0.32
136 0.34
137 0.36
138 0.38
139 0.37
140 0.3
141 0.29
142 0.26
143 0.25
144 0.23
145 0.19
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.19
151 0.24
152 0.3
153 0.39
154 0.47
155 0.52
156 0.56
157 0.58
158 0.65
159 0.68
160 0.66
161 0.67
162 0.65
163 0.63
164 0.6
165 0.55
166 0.46
167 0.45
168 0.38
169 0.31
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.32
174 0.34
175 0.28
176 0.37
177 0.36
178 0.36
179 0.37
180 0.4
181 0.41
182 0.45
183 0.49
184 0.51
185 0.55
186 0.58
187 0.6
188 0.58
189 0.59
190 0.56
191 0.57
192 0.54
193 0.51
194 0.46
195 0.47
196 0.5
197 0.51
198 0.52
199 0.46
200 0.41
201 0.4
202 0.44
203 0.43
204 0.46
205 0.5
206 0.57
207 0.66
208 0.74
209 0.79
210 0.79
211 0.81
212 0.8
213 0.79
214 0.78
215 0.76
216 0.71
217 0.7
218 0.68
219 0.6
220 0.5
221 0.39
222 0.29
223 0.21
224 0.15
225 0.09
226 0.07
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.19
249 0.25
250 0.34
251 0.42
252 0.51
253 0.61
254 0.69
255 0.76
256 0.71
257 0.72
258 0.66
259 0.62
260 0.54
261 0.45
262 0.36
263 0.28
264 0.26
265 0.19
266 0.17
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.22
275 0.24
276 0.29
277 0.29
278 0.32
279 0.34
280 0.34
281 0.33
282 0.26
283 0.26
284 0.22
285 0.21
286 0.18
287 0.16
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.15
295 0.21
296 0.28
297 0.3
298 0.34
299 0.36
300 0.38
301 0.48
302 0.46
303 0.48
304 0.51
305 0.55
306 0.54
307 0.59
308 0.58
309 0.56
310 0.56
311 0.53
312 0.53
313 0.49
314 0.49
315 0.52
316 0.53
317 0.49
318 0.52
319 0.49
320 0.45
321 0.44
322 0.46
323 0.4
324 0.36
325 0.33
326 0.28
327 0.3
328 0.26
329 0.24
330 0.19
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.16
339 0.19
340 0.23
341 0.26
342 0.29
343 0.29
344 0.3
345 0.31
346 0.3
347 0.31
348 0.31
349 0.3
350 0.26
351 0.27
352 0.28
353 0.27
354 0.26
355 0.22
356 0.17
357 0.16
358 0.17
359 0.17
360 0.13
361 0.14
362 0.13
363 0.2
364 0.24
365 0.28
366 0.31
367 0.35
368 0.36
369 0.38
370 0.41
371 0.37
372 0.35
373 0.31
374 0.27
375 0.23
376 0.22
377 0.19
378 0.15
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.07
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.15
395 0.2
396 0.2
397 0.2
398 0.25
399 0.28
400 0.36
401 0.42
402 0.47
403 0.47
404 0.52
405 0.58
406 0.57
407 0.62
408 0.58
409 0.55
410 0.51
411 0.48
412 0.45
413 0.41
414 0.39
415 0.33
416 0.3
417 0.29
418 0.32
419 0.37
420 0.42
421 0.46
422 0.44
423 0.44
424 0.42
425 0.4
426 0.36
427 0.31
428 0.27
429 0.19
430 0.19
431 0.18
432 0.18
433 0.17
434 0.15
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.12
447 0.14
448 0.13
449 0.17
450 0.18
451 0.2
452 0.25
453 0.26
454 0.26
455 0.26
456 0.3
457 0.25
458 0.27
459 0.32
460 0.33
461 0.35
462 0.38
463 0.38
464 0.35
465 0.36
466 0.37
467 0.31
468 0.24
469 0.23
470 0.18
471 0.2
472 0.2
473 0.19
474 0.18
475 0.27
476 0.32
477 0.37
478 0.45
479 0.47
480 0.53