FuNGI

A0A059JBB1

Protein Details

Accession

A0A059JBB1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
324-347	TLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSM	Hydrophilic
431-456	LDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
331-339	RKKKRKGAK
439-452	VHAKRKGAQGRRGK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPTKQWIDKKSATKYQLFHRSQNDPLIHDPEAEDRILHVVGRPGPASSVNSSSSKRETRNLRELDEEFKSTVRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRGLGEGVGDAHFVEARTKGKGKKSMKLEDALKEISLDGDRAESFTYGDANDDILSTASSYIRKATYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAYVDEECDEDIFDNLVAGGHDAEVDPDEWRDTYIDGDDEGWESDATEKAPVQHDTSTDSQLSTASDDKGNSVTSSQPPNDDQIPDMEEHEGDWLKDFAKYKKDMKANKAAAKVDDSASELRTTASTLFTLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERMEALYALDEGEEYEGSSMADDMSVASGVSRFSRFSKLSQAPSLVANDRNTPLRSDFNDVMDGFLDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNEVIGMRMLDEVRQGLGPPKLSTNAFGKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.67
3	0.69
4	0.72
5	0.68
6	0.66
7	0.64
8	0.63
9	0.61
10	0.65
11	0.58
12	0.51
13	0.5
14	0.48
15	0.42
16	0.37
17	0.33
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.15
23	0.17
24	0.17
25	0.15
26	0.13
27	0.16
28	0.19
29	0.22
30	0.21
31	0.19
32	0.2
33	0.23
34	0.24
35	0.22
36	0.23
37	0.24
38	0.27
39	0.29
40	0.32
41	0.37
42	0.41
43	0.41
44	0.46
45	0.52
46	0.57
47	0.65
48	0.65
49	0.6
50	0.6
51	0.58
52	0.55
53	0.49
54	0.42
55	0.33
56	0.31
57	0.31
58	0.28
59	0.32
60	0.32
61	0.3
62	0.3
63	0.38
64	0.4
65	0.39
66	0.38
67	0.36
68	0.3
69	0.29
70	0.26
71	0.18
72	0.14
73	0.12
74	0.13
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.14
80	0.19
81	0.23
82	0.23
83	0.23
84	0.24
85	0.23
86	0.23
87	0.21
88	0.16
89	0.12
90	0.1
91	0.09
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.08
99	0.1
100	0.12
101	0.16
102	0.22
103	0.27
104	0.34
105	0.44
106	0.48
107	0.53
108	0.6
109	0.64
110	0.63
111	0.64
112	0.61
113	0.55
114	0.53
115	0.46
116	0.37
117	0.29
118	0.25
119	0.19
120	0.15
121	0.12
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.09
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.06
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.12
148	0.14
149	0.19
150	0.25
151	0.29
152	0.33
153	0.33
154	0.34
155	0.35
156	0.33
157	0.28
158	0.22
159	0.17
160	0.12
161	0.11
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.08
231	0.1
232	0.11
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.16
237	0.18
238	0.18
239	0.16
240	0.15
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.11
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.11
255	0.13
256	0.17
257	0.17
258	0.18
259	0.18
260	0.21
261	0.22
262	0.19
263	0.17
264	0.14
265	0.15
266	0.13
267	0.13
268	0.11
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.11
278	0.14
279	0.16
280	0.22
281	0.27
282	0.31
283	0.38
284	0.45
285	0.49
286	0.53
287	0.6
288	0.61
289	0.62
290	0.62
291	0.56
292	0.49
293	0.45
294	0.4
295	0.3
296	0.23
297	0.2
298	0.16
299	0.15
300	0.14
301	0.12
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.11
314	0.12
315	0.17
316	0.25
317	0.35
318	0.42
319	0.47
320	0.56
321	0.63
322	0.72
323	0.78
324	0.81
325	0.82
326	0.85
327	0.89
328	0.82
329	0.76
330	0.66
331	0.55
332	0.47
333	0.37
334	0.28
335	0.21
336	0.19
337	0.15
338	0.15
339	0.15
340	0.13
341	0.14
342	0.19
343	0.2
344	0.22
345	0.23
346	0.23
347	0.24
348	0.31
349	0.3
350	0.27
351	0.24
352	0.23
353	0.22
354	0.21
355	0.21
356	0.13
357	0.14
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.06
364	0.07
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.06
382	0.08
383	0.09
384	0.11
385	0.13
386	0.21
387	0.22
388	0.24
389	0.34
390	0.38
391	0.43
392	0.45
393	0.45
394	0.39
395	0.4
396	0.41
397	0.34
398	0.32
399	0.29
400	0.29
401	0.29
402	0.33
403	0.32
404	0.31
405	0.31
406	0.33
407	0.34
408	0.38
409	0.37
410	0.34
411	0.38
412	0.35
413	0.32
414	0.26
415	0.24
416	0.17
417	0.16
418	0.15
419	0.11
420	0.14
421	0.2
422	0.21
423	0.23
424	0.34
425	0.41
426	0.5
427	0.57
428	0.64
429	0.64
430	0.74
431	0.81
432	0.8
433	0.81
434	0.81
435	0.83
436	0.83
437	0.83
438	0.74
439	0.72
440	0.7
441	0.63
442	0.57
443	0.49
444	0.42
445	0.37
446	0.35
447	0.27
448	0.22
449	0.19
450	0.15
451	0.16
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.14
456	0.17
457	0.21
458	0.24
459	0.24
460	0.27
461	0.3
462	0.3
463	0.33

A0A059JBB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer