FuNGI

B6QNL8

Protein Details

Accession

B6QNL8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
530-551	GGGTQKRSRGPRSRGGRGKGKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-31	RAPKVAA
195-241	KEKKASKAKDSASSKSSKRGAKEKETKAEKVESKKLLKRPDREAAAD
244-258	PASPEKKPTAAKVEK
534-553	QKRSRGPRSRGGRGKGKAAG

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	tmf:PMAA_053150 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQPKEAGIIQLPLSATLKGAPTKRAPKVAAPRLKLIIRRLPPGLTRAEFETGLGDDWKIGRGKIDWFQFKPGKISKDPAKPSRPARAYVHVLSEEIISSLSEKVRATSFHDARNTSNDPVLLGPPSVEFAPFARVPGSRSRKDGRQGTIDQDPEFVAFLESLTNPITKPIPVEGETEKKEEEEITITPLVQFIKEKKASKAKDSASSKSSKRGAKEKETKAEKVESKKLLKRPDREAAADSTPASPEKKPTAAKVEKATKEAVKAANKQASATKTKQASAKEATQTPDAPASTTERKRERGDARAAAMILQRDLGLSPSGGRRRGKAAAAAATEGDRTKGEEKPESVPSTPTIPTGPKPPRGSSKAAKDTTSKAAAAKAATATTAATSTGPGTSTTTDSAVPATTPRAPKAAKQQKPKQTAVISTATQAFLKHANPSQGVTEELLDAAFSAFGKVTKVEIDKKKGFGYVDFAEAESLQKAIAASPVTVAQSQVVVLERKNTPTQQQAKAAAKPVESAPQASSAAPQQPGGGTQKRSRGPRSRGGRGKGKAAGEGGNAAKTETGGGTSET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.18
3	0.15
4	0.15
5	0.18
6	0.21
7	0.24
8	0.28
9	0.36
10	0.46
11	0.51
12	0.57
13	0.56
14	0.6
15	0.68
16	0.72
17	0.72
18	0.67
19	0.66
20	0.65
21	0.66
22	0.62
23	0.59
24	0.58
25	0.54
26	0.55
27	0.53
28	0.51
29	0.49
30	0.47
31	0.47
32	0.39
33	0.36
34	0.34
35	0.35
36	0.3
37	0.28
38	0.25
39	0.19
40	0.18
41	0.17
42	0.13
43	0.11
44	0.12
45	0.16
46	0.15
47	0.14
48	0.16
49	0.17
50	0.22
51	0.28
52	0.36
53	0.4
54	0.41
55	0.5
56	0.52
57	0.52
58	0.55
59	0.55
60	0.53
61	0.49
62	0.55
63	0.55
64	0.6
65	0.67
66	0.68
67	0.69
68	0.7
69	0.73
70	0.75
71	0.7
72	0.66
73	0.62
74	0.61
75	0.6
76	0.55
77	0.52
78	0.42
79	0.39
80	0.34
81	0.28
82	0.2
83	0.14
84	0.12
85	0.07
86	0.08
87	0.1
88	0.1
89	0.12
90	0.12
91	0.13
92	0.15
93	0.16
94	0.22
95	0.3
96	0.33
97	0.37
98	0.42
99	0.42
100	0.42
101	0.48
102	0.45
103	0.36
104	0.34
105	0.28
106	0.24
107	0.23
108	0.23
109	0.16
110	0.13
111	0.11
112	0.1
113	0.11
114	0.1
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.15
123	0.17
124	0.27
125	0.34
126	0.32
127	0.39
128	0.43
129	0.48
130	0.56
131	0.61
132	0.55
133	0.55
134	0.54
135	0.53
136	0.53
137	0.49
138	0.4
139	0.34
140	0.29
141	0.22
142	0.19
143	0.15
144	0.09
145	0.07
146	0.06
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.08
153	0.1
154	0.11
155	0.1
156	0.12
157	0.12
158	0.15
159	0.16
160	0.19
161	0.21
162	0.27
163	0.29
164	0.29
165	0.27
166	0.24
167	0.23
168	0.2
169	0.17
170	0.13
171	0.11
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.13
177	0.12
178	0.11
179	0.13
180	0.12
181	0.21
182	0.27
183	0.3
184	0.35
185	0.44
186	0.46
187	0.49
188	0.55
189	0.49
190	0.53
191	0.55
192	0.52
193	0.47
194	0.5
195	0.45
196	0.44
197	0.48
198	0.42
199	0.42
200	0.47
201	0.5
202	0.55
203	0.64
204	0.63
205	0.66
206	0.68
207	0.65
208	0.59
209	0.6
210	0.54
211	0.51
212	0.51
213	0.49
214	0.51
215	0.55
216	0.58
217	0.6
218	0.63
219	0.62
220	0.62
221	0.62
222	0.58
223	0.54
224	0.5
225	0.44
226	0.37
227	0.32
228	0.26
229	0.19
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.12
234	0.14
235	0.16
236	0.2
237	0.21
238	0.24
239	0.33
240	0.34
241	0.37
242	0.41
243	0.47
244	0.43
245	0.44
246	0.44
247	0.35
248	0.32
249	0.33
250	0.3
251	0.27
252	0.29
253	0.32
254	0.33
255	0.32
256	0.32
257	0.32
258	0.3
259	0.31
260	0.29
261	0.29
262	0.27
263	0.3
264	0.33
265	0.3
266	0.32
267	0.3
268	0.32
269	0.29
270	0.3
271	0.3
272	0.27
273	0.26
274	0.22
275	0.2
276	0.16
277	0.13
278	0.12
279	0.15
280	0.2
281	0.23
282	0.29
283	0.31
284	0.35
285	0.37
286	0.45
287	0.44
288	0.44
289	0.47
290	0.43
291	0.4
292	0.37
293	0.35
294	0.28
295	0.25
296	0.18
297	0.12
298	0.09
299	0.08
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.11
307	0.15
308	0.2
309	0.21
310	0.21
311	0.26
312	0.29
313	0.28
314	0.26
315	0.26
316	0.24
317	0.24
318	0.23
319	0.18
320	0.16
321	0.15
322	0.12
323	0.1
324	0.07
325	0.08
326	0.11
327	0.13
328	0.16
329	0.19
330	0.21
331	0.24
332	0.29
333	0.3
334	0.28
335	0.26
336	0.24
337	0.25
338	0.23
339	0.2
340	0.17
341	0.16
342	0.17
343	0.25
344	0.29
345	0.33
346	0.37
347	0.4
348	0.46
349	0.49
350	0.54
351	0.52
352	0.56
353	0.58
354	0.56
355	0.54
356	0.49
357	0.48
358	0.47
359	0.42
360	0.33
361	0.24
362	0.24
363	0.23
364	0.2
365	0.18
366	0.13
367	0.11
368	0.1
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.12
388	0.1
389	0.09
390	0.09
391	0.11
392	0.15
393	0.17
394	0.18
395	0.23
396	0.23
397	0.28
398	0.38
399	0.46
400	0.49
401	0.57
402	0.66
403	0.7
404	0.77
405	0.75
406	0.71
407	0.64
408	0.6
409	0.54
410	0.48
411	0.39
412	0.33
413	0.32
414	0.25
415	0.22
416	0.19
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.18
421	0.19
422	0.22
423	0.23
424	0.24
425	0.24
426	0.22
427	0.22
428	0.19
429	0.16
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.08
434	0.07
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.12
445	0.17
446	0.26
447	0.33
448	0.42
449	0.45
450	0.47
451	0.48
452	0.47
453	0.44
454	0.36
455	0.35
456	0.28
457	0.27
458	0.24
459	0.23
460	0.2
461	0.19
462	0.18
463	0.12
464	0.1
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.18
485	0.2
486	0.24
487	0.29
488	0.31
489	0.33
490	0.41
491	0.49
492	0.5
493	0.55
494	0.59
495	0.59
496	0.61
497	0.63
498	0.56
499	0.48
500	0.44
501	0.39
502	0.37
503	0.33
504	0.31
505	0.24
506	0.25
507	0.25
508	0.23
509	0.23
510	0.21
511	0.25
512	0.24
513	0.23
514	0.2
515	0.2
516	0.24
517	0.29
518	0.31
519	0.32
520	0.37
521	0.45
522	0.51
523	0.58
524	0.64
525	0.68
526	0.69
527	0.73
528	0.76
529	0.79
530	0.81
531	0.82
532	0.82
533	0.76
534	0.76
535	0.72
536	0.64
537	0.57
538	0.5
539	0.45
540	0.36
541	0.37
542	0.3
543	0.26
544	0.24
545	0.21
546	0.18
547	0.15
548	0.16
549	0.11
550	0.11

B6QNL8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer