Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3KDS5

Protein Details
Accession J3KDS5    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-314DFETRQTPPRFRKRPRAPSLAGHydrophilic
602-621TPEERANRKREELRRQLESKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-309FRKRPRA
325-329KGKTR
333-359ASPEPPRPTAPPKQTKRSKGLGIIGSK
382-398PKAKSSGFGRIGGRKLK
457-495PSPPPKNKSTTAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKS
608-631NRKREELRRQLESKSGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) mito_nucl 14, nucl 13.5, mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG cim:CIMG_04568  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MRPLWKRLPLEGQSLSPALYISFTTGSNGYELLLTDLAHVWSECLTRKQILVNSSKYDTTIDPNQDDDQYFVLLQKIDDALSGKKGSRLSLRGQKHGNGLNLSTETDLPSPLEPLTWKMDLSQLPQAAFTKHVFLPVLREAASTESRMRSLIDKLREKDWALGKLCDKIEASGIDLSTVFPTLTGARHGRRESVFSQASKMIKGVAPFDENAWNSECMEQTPNESIKETIIKDFSATESPLDLETVENINDDWWTRIRDSDSAIMGPVASHKVATKKPPPKPAEEISTESDDDFETRQTPPRFRKRPRAPSLAGSEPESIPSLGKGKTRESTASPEPPRPTAPPKQTKRSKGLGIIGSKSSKKELPAEGSTGYDLSMQPEKPKAKSSGFGRIGGRKLKAPRVEDTNSDSSTESDVPPGAFTKKPLAQELSTDEADLALCPSKPQKSKSTGREESDKPSPPPKNKSTTAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKSKQSPQENIDDTSTHDQVESSHATAPKMAKRESKLGVIGGGKSPRKQAATKSQAIIPSTATRKDEASDKGNGPISIKTEQSEAPQRSKSPTPQIQAPQKEGSVPTNETPEERANRKREELRRQLESKSGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.26
4 0.22
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.24
34 0.26
35 0.31
36 0.34
37 0.39
38 0.43
39 0.44
40 0.45
41 0.46
42 0.45
43 0.4
44 0.38
45 0.32
46 0.31
47 0.33
48 0.33
49 0.32
50 0.34
51 0.35
52 0.35
53 0.34
54 0.29
55 0.23
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.17
69 0.2
70 0.19
71 0.22
72 0.23
73 0.26
74 0.31
75 0.34
76 0.38
77 0.45
78 0.5
79 0.53
80 0.56
81 0.56
82 0.56
83 0.57
84 0.52
85 0.45
86 0.41
87 0.36
88 0.33
89 0.3
90 0.24
91 0.19
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.14
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.22
107 0.23
108 0.26
109 0.29
110 0.26
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.23
115 0.24
116 0.21
117 0.2
118 0.18
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.22
123 0.22
124 0.23
125 0.19
126 0.19
127 0.17
128 0.2
129 0.22
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.18
137 0.23
138 0.28
139 0.34
140 0.4
141 0.42
142 0.44
143 0.47
144 0.45
145 0.45
146 0.44
147 0.42
148 0.37
149 0.39
150 0.38
151 0.4
152 0.39
153 0.35
154 0.29
155 0.23
156 0.23
157 0.19
158 0.19
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.07
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.12
172 0.16
173 0.19
174 0.26
175 0.27
176 0.31
177 0.31
178 0.35
179 0.32
180 0.35
181 0.36
182 0.3
183 0.32
184 0.32
185 0.31
186 0.27
187 0.26
188 0.19
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.12
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.17
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.21
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.17
247 0.19
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.13
260 0.16
261 0.23
262 0.31
263 0.39
264 0.46
265 0.55
266 0.57
267 0.57
268 0.61
269 0.58
270 0.53
271 0.48
272 0.45
273 0.37
274 0.36
275 0.31
276 0.25
277 0.21
278 0.16
279 0.13
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.16
285 0.18
286 0.25
287 0.34
288 0.44
289 0.53
290 0.59
291 0.69
292 0.73
293 0.81
294 0.82
295 0.81
296 0.72
297 0.68
298 0.66
299 0.58
300 0.48
301 0.4
302 0.33
303 0.25
304 0.23
305 0.18
306 0.13
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.13
312 0.14
313 0.17
314 0.19
315 0.21
316 0.22
317 0.21
318 0.26
319 0.28
320 0.34
321 0.34
322 0.37
323 0.36
324 0.36
325 0.36
326 0.34
327 0.36
328 0.36
329 0.43
330 0.48
331 0.53
332 0.62
333 0.68
334 0.71
335 0.71
336 0.68
337 0.61
338 0.55
339 0.54
340 0.49
341 0.43
342 0.39
343 0.34
344 0.32
345 0.29
346 0.26
347 0.23
348 0.19
349 0.19
350 0.21
351 0.22
352 0.25
353 0.26
354 0.27
355 0.25
356 0.24
357 0.22
358 0.18
359 0.15
360 0.1
361 0.08
362 0.09
363 0.12
364 0.12
365 0.14
366 0.2
367 0.23
368 0.23
369 0.28
370 0.3
371 0.29
372 0.35
373 0.37
374 0.41
375 0.41
376 0.43
377 0.42
378 0.42
379 0.44
380 0.42
381 0.39
382 0.34
383 0.36
384 0.39
385 0.42
386 0.4
387 0.39
388 0.42
389 0.43
390 0.41
391 0.42
392 0.39
393 0.34
394 0.32
395 0.29
396 0.22
397 0.23
398 0.22
399 0.16
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.13
408 0.19
409 0.22
410 0.24
411 0.27
412 0.29
413 0.27
414 0.29
415 0.31
416 0.29
417 0.25
418 0.23
419 0.2
420 0.16
421 0.15
422 0.13
423 0.1
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.12
428 0.19
429 0.24
430 0.28
431 0.36
432 0.43
433 0.52
434 0.6
435 0.67
436 0.67
437 0.66
438 0.69
439 0.64
440 0.61
441 0.59
442 0.55
443 0.48
444 0.5
445 0.54
446 0.55
447 0.61
448 0.61
449 0.62
450 0.6
451 0.62
452 0.58
453 0.58
454 0.55
455 0.5
456 0.43
457 0.37
458 0.34
459 0.3
460 0.25
461 0.17
462 0.13
463 0.14
464 0.18
465 0.23
466 0.26
467 0.28
468 0.34
469 0.43
470 0.5
471 0.56
472 0.58
473 0.63
474 0.69
475 0.75
476 0.78
477 0.76
478 0.79
479 0.75
480 0.78
481 0.74
482 0.74
483 0.73
484 0.72
485 0.75
486 0.69
487 0.71
488 0.64
489 0.59
490 0.53
491 0.45
492 0.4
493 0.35
494 0.31
495 0.23
496 0.19
497 0.17
498 0.16
499 0.21
500 0.19
501 0.15
502 0.19
503 0.2
504 0.21
505 0.24
506 0.29
507 0.29
508 0.32
509 0.35
510 0.37
511 0.41
512 0.48
513 0.47
514 0.47
515 0.44
516 0.39
517 0.39
518 0.33
519 0.31
520 0.28
521 0.32
522 0.3
523 0.3
524 0.34
525 0.35
526 0.38
527 0.4
528 0.44
529 0.48
530 0.53
531 0.57
532 0.55
533 0.54
534 0.53
535 0.51
536 0.43
537 0.35
538 0.34
539 0.32
540 0.34
541 0.32
542 0.29
543 0.29
544 0.3
545 0.33
546 0.31
547 0.32
548 0.34
549 0.34
550 0.37
551 0.4
552 0.38
553 0.34
554 0.31
555 0.31
556 0.28
557 0.27
558 0.23
559 0.22
560 0.23
561 0.28
562 0.35
563 0.36
564 0.39
565 0.43
566 0.44
567 0.47
568 0.53
569 0.54
570 0.55
571 0.59
572 0.58
573 0.61
574 0.69
575 0.72
576 0.72
577 0.7
578 0.63
579 0.55
580 0.53
581 0.47
582 0.42
583 0.38
584 0.36
585 0.33
586 0.34
587 0.34
588 0.32
589 0.34
590 0.38
591 0.4
592 0.43
593 0.5
594 0.52
595 0.58
596 0.65
597 0.7
598 0.72
599 0.76
600 0.79
601 0.78
602 0.8
603 0.77
604 0.72
605 0.71
606 0.65
607 0.62
608 0.62
609 0.62
610 0.63
611 0.7