Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015LJN3

Protein Details
Accession A0A015LJN3    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
459-493SNTIEKSEKNKNTRLKKTTRLKRLREKDGEDKTSNHydrophilic
503-532ESSPICTDKNSRKNKRVKAGPKSDVKKLNVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-376RLKGKGKGK
469-483KNTRLKKTTRLKRLR
514-524RKNKRVKAGPK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000812  TFIIB  
Gene Ontology GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Amino Acid Sequences MNFEDCTHNHTETFEGNKVCRDCGIVLNDIFEQQGEIVPDRSGNLLTGHYLPFIDLYDGRTFRPETIDGGTQDPGTEKKNPLVEPILNQTLSTLDLLDLKTRVITYYNAVDKNFIIGEGKLLHYVIAACALLVLREEKIPRTLREIAYLLELDLSRLCEVLFMIRSKFAPNVTNFVSVEDLIIRSIGIMFEDEKHKINFPLYTDIKQICHLKEDIHVYEKRKEIDLPNNTNNMESEEYREKMIKIYRVVFTGICMELLKYANDAFILSGRQPSFLGAAISLLAIEATEKPSVQEVKKSRKNVIHTISKIFMVDCHFVLFERYRELLDVIYHKVINIIPWCTHAKENKSRSYLYVTDLVQFQEWILKSRLKGKGKGKDKGDVNVENNDPVYNESAENSTGVILTSTDTSGFASSFTDNINERNEQNNNGDIEFDEAELDEYMRDEEEVEMFKKVWESLQSNTIEKSEKNKNTRLKKTTRLKRLREKDGEDKTSNHIEHLSSAGESSPICTDKNSRKNKRVKAGPKSDVKKLNVSIIDNINYDDFDHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.38
5 0.38
6 0.37
7 0.33
8 0.3
9 0.27
10 0.29
11 0.32
12 0.3
13 0.28
14 0.3
15 0.29
16 0.26
17 0.24
18 0.17
19 0.14
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.14
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.14
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.15
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.26
48 0.26
49 0.25
50 0.29
51 0.26
52 0.22
53 0.25
54 0.29
55 0.27
56 0.28
57 0.28
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.18
63 0.23
64 0.23
65 0.27
66 0.33
67 0.33
68 0.36
69 0.4
70 0.38
71 0.36
72 0.4
73 0.39
74 0.33
75 0.32
76 0.28
77 0.23
78 0.21
79 0.18
80 0.11
81 0.07
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.2
94 0.26
95 0.28
96 0.28
97 0.29
98 0.27
99 0.28
100 0.24
101 0.17
102 0.13
103 0.1
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.09
123 0.11
124 0.12
125 0.2
126 0.24
127 0.25
128 0.3
129 0.36
130 0.34
131 0.37
132 0.37
133 0.3
134 0.28
135 0.27
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.18
155 0.17
156 0.2
157 0.2
158 0.24
159 0.25
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.24
164 0.18
165 0.17
166 0.13
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.07
178 0.1
179 0.12
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.28
191 0.28
192 0.27
193 0.3
194 0.32
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.2
199 0.22
200 0.26
201 0.24
202 0.25
203 0.28
204 0.29
205 0.34
206 0.36
207 0.33
208 0.3
209 0.31
210 0.31
211 0.37
212 0.42
213 0.43
214 0.44
215 0.46
216 0.45
217 0.42
218 0.37
219 0.3
220 0.23
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.18
228 0.2
229 0.23
230 0.22
231 0.21
232 0.24
233 0.24
234 0.24
235 0.25
236 0.21
237 0.18
238 0.16
239 0.13
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.02
271 0.03
272 0.03
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.09
278 0.13
279 0.13
280 0.2
281 0.26
282 0.36
283 0.43
284 0.45
285 0.49
286 0.51
287 0.56
288 0.56
289 0.56
290 0.55
291 0.5
292 0.5
293 0.45
294 0.4
295 0.34
296 0.26
297 0.21
298 0.16
299 0.15
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.14
305 0.14
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.16
326 0.18
327 0.18
328 0.22
329 0.25
330 0.31
331 0.39
332 0.45
333 0.49
334 0.51
335 0.5
336 0.47
337 0.48
338 0.41
339 0.35
340 0.33
341 0.26
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.17
346 0.15
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.19
354 0.28
355 0.37
356 0.37
357 0.45
358 0.51
359 0.58
360 0.64
361 0.71
362 0.65
363 0.64
364 0.62
365 0.59
366 0.57
367 0.53
368 0.46
369 0.44
370 0.41
371 0.34
372 0.32
373 0.26
374 0.2
375 0.15
376 0.15
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.14
405 0.17
406 0.18
407 0.19
408 0.25
409 0.27
410 0.28
411 0.3
412 0.32
413 0.29
414 0.27
415 0.25
416 0.19
417 0.2
418 0.17
419 0.14
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.09
433 0.11
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.15
441 0.19
442 0.21
443 0.22
444 0.29
445 0.31
446 0.32
447 0.32
448 0.32
449 0.28
450 0.27
451 0.32
452 0.35
453 0.41
454 0.47
455 0.54
456 0.62
457 0.7
458 0.78
459 0.81
460 0.79
461 0.81
462 0.85
463 0.86
464 0.88
465 0.88
466 0.88
467 0.89
468 0.9
469 0.91
470 0.89
471 0.86
472 0.85
473 0.84
474 0.82
475 0.74
476 0.66
477 0.61
478 0.61
479 0.53
480 0.44
481 0.36
482 0.29
483 0.28
484 0.27
485 0.22
486 0.14
487 0.14
488 0.13
489 0.12
490 0.11
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.17
496 0.25
497 0.35
498 0.45
499 0.54
500 0.61
501 0.69
502 0.79
503 0.87
504 0.89
505 0.89
506 0.9
507 0.9
508 0.9
509 0.89
510 0.89
511 0.85
512 0.83
513 0.81
514 0.75
515 0.72
516 0.64
517 0.63
518 0.57
519 0.54
520 0.51
521 0.47
522 0.46
523 0.39
524 0.37
525 0.3
526 0.25