Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015LJB9

Protein Details
Accession A0A015LJB9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-96EDDVKKQPAKLKQKRSPLRHTPERDRDDEEYVPVPLNKRRRKTNESRKRRKRHERIENAGDLDBasic
318-338DPYKNIKKTMARLKRTGKNMKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-48KLKQKR
70-87NKRRRKTNESRKRRKRHE
128-133RKGRSK
324-337KKTMARLKRTGKNM
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MDKEKELEEIFGNDADELSDVLEDYSDFDNASSEDDVKKQPAKLKQKRSPLRHTPERDRDDEEYVPVPLNKRRRKTNESRKRRKRHERIENAGDLDDDESGNVEPSLAPLMASKAFVDRDFDEILPKRKGRSKKNDIELDKMYDEQASKVYQRMMEAGEKDISQNARGAHSSEKNQVQSWVMDKLEKAYLRESLLEHNILDAIKLWLEPLPDRSLPSHNIQEDLLKSLNDFNITTDHLLSSKVGRIVYFYTKSPRININIQRQAQQLVDKWAGPINGESSNYREKIMRMVHEANSGAPLPVAGTFDTIPTIRSGKRDDPYKNIKKTMARLKRTGKNMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.1
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.05
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.17
23 0.2
24 0.24
25 0.29
26 0.3
27 0.36
28 0.45
29 0.55
30 0.62
31 0.7
32 0.73
33 0.8
34 0.86
35 0.87
36 0.88
37 0.87
38 0.87
39 0.86
40 0.87
41 0.86
42 0.87
43 0.84
44 0.77
45 0.72
46 0.65
47 0.6
48 0.52
49 0.44
50 0.35
51 0.3
52 0.28
53 0.24
54 0.24
55 0.26
56 0.35
57 0.41
58 0.46
59 0.56
60 0.63
61 0.72
62 0.79
63 0.84
64 0.85
65 0.87
66 0.92
67 0.92
68 0.94
69 0.95
70 0.95
71 0.95
72 0.95
73 0.95
74 0.94
75 0.92
76 0.88
77 0.81
78 0.71
79 0.6
80 0.48
81 0.37
82 0.27
83 0.18
84 0.11
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.14
105 0.13
106 0.15
107 0.16
108 0.16
109 0.2
110 0.23
111 0.28
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.37
116 0.45
117 0.5
118 0.57
119 0.63
120 0.66
121 0.74
122 0.79
123 0.75
124 0.72
125 0.63
126 0.56
127 0.46
128 0.37
129 0.28
130 0.2
131 0.18
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.19
159 0.22
160 0.25
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.22
165 0.2
166 0.19
167 0.17
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.14
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.1
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.2
202 0.22
203 0.26
204 0.28
205 0.25
206 0.25
207 0.24
208 0.25
209 0.22
210 0.22
211 0.19
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.15
233 0.18
234 0.23
235 0.24
236 0.23
237 0.27
238 0.32
239 0.33
240 0.35
241 0.37
242 0.36
243 0.43
244 0.49
245 0.54
246 0.58
247 0.58
248 0.58
249 0.54
250 0.52
251 0.44
252 0.39
253 0.31
254 0.28
255 0.28
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.23
260 0.2
261 0.18
262 0.15
263 0.16
264 0.18
265 0.18
266 0.2
267 0.26
268 0.26
269 0.27
270 0.26
271 0.24
272 0.3
273 0.34
274 0.34
275 0.34
276 0.38
277 0.38
278 0.4
279 0.4
280 0.33
281 0.3
282 0.26
283 0.19
284 0.14
285 0.12
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.17
298 0.17
299 0.22
300 0.28
301 0.34
302 0.42
303 0.5
304 0.52
305 0.58
306 0.67
307 0.73
308 0.74
309 0.72
310 0.71
311 0.7
312 0.74
313 0.76
314 0.75
315 0.73
316 0.74
317 0.78
318 0.8