Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q1DYR6

Protein Details
Accession Q1DYR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-359ERPSGKRSKSQTKKGGNKKPAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-357GKRSKSQTKKGGNKKP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG cim:CIMG_04547  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSHLDLTRHRTRSPSPSQIFGSSTTPVATNSTHSEPSASSILRSILGEYADPKRPDVSGADPIRCPVKRVHKTPAVRASSPGRENVPVRTLQSSKDAEGDNFSGDGQLTPCGGPRPLAERLSPKLLAKQTRRKGVGAQKRTKGCDLVDRILTGRSIKASATAASKSSDLPQPQRKGIPTLVKEANPGEADWEDEGLQLEPATKRKYSWTPVKDTNLSIIDLTANSGSSPPSIPGREAQKFTSLVSRYGFAETSPLAMKNEFPEDFPTRKRQLDLLQGTTNSSSSEGSSNKSSGKCPLKVNGTKGRRSRKVTTITSLSTAQYGLKDSPVESFPSVDTTERPSGKRSKSQTKKGGNKKPAGVSDFKVAPTTDALKSLEDQVYLFGTSSQLERVSSDEDKLGVPSAPASSRQSARDRTSVSTLSKYKVSRNLWAAGWRDLDGSVADIEIVDMVNIDTPKSHESSTLTLPSTSTNASNQGFSSQNTINDRSKPSQTTSTTTESTGVESGQLVVPSLCEDLSEKAGYPAVPERETLSSREIASSESAYIETMPSFRGFTTAELAQKVAAFGFKPIKSREKMISLLEKCWQSQHKNSAPTSLPANNANPPDSHASGQKNVVRCDTGGSNASHTTKRASKAPQKKQSTSSTSHSAKAGPKQVDCSQERPNHAYLPHDSTQASSQPVIVIPDSEESGDDFQDTYLGSLNRTSSTNYHPLSANSIPDGSPLFLRTISQASTEEKTSDPSDINQQITRAIKAQPRMTAINGMKRPTWLEKILMYDPIWLEDLTVWLNTEGLDRVGEDREVSRLTVREWCESKGICCTWKKPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.59
3 0.6
4 0.62
5 0.6
6 0.55
7 0.47
8 0.41
9 0.31
10 0.28
11 0.24
12 0.21
13 0.18
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.22
18 0.25
19 0.26
20 0.25
21 0.27
22 0.24
23 0.28
24 0.29
25 0.24
26 0.2
27 0.2
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.18
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.22
37 0.29
38 0.29
39 0.29
40 0.29
41 0.28
42 0.3
43 0.3
44 0.29
45 0.31
46 0.36
47 0.38
48 0.37
49 0.38
50 0.44
51 0.4
52 0.37
53 0.36
54 0.42
55 0.48
56 0.54
57 0.62
58 0.64
59 0.7
60 0.77
61 0.78
62 0.74
63 0.65
64 0.64
65 0.62
66 0.61
67 0.57
68 0.51
69 0.44
70 0.42
71 0.43
72 0.43
73 0.39
74 0.34
75 0.34
76 0.36
77 0.34
78 0.31
79 0.37
80 0.34
81 0.31
82 0.33
83 0.32
84 0.27
85 0.3
86 0.29
87 0.23
88 0.2
89 0.19
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.16
102 0.21
103 0.25
104 0.28
105 0.3
106 0.34
107 0.38
108 0.42
109 0.42
110 0.38
111 0.4
112 0.45
113 0.5
114 0.54
115 0.6
116 0.63
117 0.7
118 0.71
119 0.65
120 0.67
121 0.68
122 0.69
123 0.69
124 0.7
125 0.68
126 0.71
127 0.74
128 0.68
129 0.61
130 0.52
131 0.51
132 0.48
133 0.45
134 0.4
135 0.37
136 0.35
137 0.33
138 0.32
139 0.23
140 0.18
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.19
152 0.17
153 0.19
154 0.23
155 0.24
156 0.32
157 0.4
158 0.44
159 0.48
160 0.52
161 0.5
162 0.5
163 0.51
164 0.52
165 0.45
166 0.47
167 0.47
168 0.43
169 0.43
170 0.39
171 0.36
172 0.27
173 0.24
174 0.19
175 0.15
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.1
186 0.11
187 0.16
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.26
192 0.34
193 0.39
194 0.47
195 0.49
196 0.54
197 0.6
198 0.66
199 0.62
200 0.55
201 0.52
202 0.43
203 0.37
204 0.29
205 0.22
206 0.16
207 0.13
208 0.13
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.19
221 0.26
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.32
226 0.32
227 0.32
228 0.35
229 0.28
230 0.26
231 0.24
232 0.24
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.13
237 0.14
238 0.11
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.2
250 0.24
251 0.27
252 0.3
253 0.36
254 0.36
255 0.38
256 0.38
257 0.36
258 0.37
259 0.43
260 0.44
261 0.41
262 0.39
263 0.37
264 0.37
265 0.33
266 0.28
267 0.18
268 0.14
269 0.1
270 0.08
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.2
277 0.21
278 0.22
279 0.26
280 0.32
281 0.34
282 0.35
283 0.39
284 0.45
285 0.48
286 0.54
287 0.55
288 0.54
289 0.57
290 0.63
291 0.67
292 0.65
293 0.68
294 0.67
295 0.65
296 0.67
297 0.63
298 0.6
299 0.55
300 0.48
301 0.43
302 0.38
303 0.3
304 0.22
305 0.19
306 0.15
307 0.11
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.15
324 0.2
325 0.22
326 0.23
327 0.25
328 0.32
329 0.36
330 0.43
331 0.45
332 0.51
333 0.58
334 0.67
335 0.72
336 0.74
337 0.8
338 0.83
339 0.85
340 0.82
341 0.78
342 0.72
343 0.67
344 0.6
345 0.54
346 0.46
347 0.38
348 0.34
349 0.3
350 0.26
351 0.22
352 0.19
353 0.16
354 0.14
355 0.16
356 0.12
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.16
362 0.15
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.09
392 0.11
393 0.13
394 0.15
395 0.19
396 0.23
397 0.27
398 0.3
399 0.32
400 0.32
401 0.31
402 0.32
403 0.31
404 0.28
405 0.28
406 0.27
407 0.24
408 0.27
409 0.26
410 0.26
411 0.32
412 0.33
413 0.32
414 0.34
415 0.35
416 0.31
417 0.35
418 0.33
419 0.27
420 0.26
421 0.21
422 0.18
423 0.15
424 0.15
425 0.1
426 0.08
427 0.06
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.03
433 0.03
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.06
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.12
447 0.15
448 0.17
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.13
456 0.12
457 0.09
458 0.13
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.18
466 0.16
467 0.19
468 0.21
469 0.26
470 0.25
471 0.28
472 0.32
473 0.31
474 0.33
475 0.32
476 0.32
477 0.35
478 0.35
479 0.35
480 0.35
481 0.36
482 0.33
483 0.31
484 0.3
485 0.23
486 0.21
487 0.18
488 0.13
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.1
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.15
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.18
515 0.2
516 0.22
517 0.22
518 0.2
519 0.19
520 0.19
521 0.19
522 0.17
523 0.15
524 0.15
525 0.13
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.13
542 0.15
543 0.16
544 0.16
545 0.16
546 0.15
547 0.14
548 0.13
549 0.1
550 0.08
551 0.07
552 0.09
553 0.16
554 0.17
555 0.21
556 0.26
557 0.33
558 0.34
559 0.38
560 0.4
561 0.38
562 0.39
563 0.39
564 0.45
565 0.39
566 0.39
567 0.4
568 0.36
569 0.32
570 0.35
571 0.37
572 0.33
573 0.38
574 0.46
575 0.48
576 0.53
577 0.54
578 0.54
579 0.49
580 0.46
581 0.43
582 0.36
583 0.32
584 0.28
585 0.3
586 0.28
587 0.28
588 0.28
589 0.23
590 0.23
591 0.26
592 0.24
593 0.23
594 0.24
595 0.26
596 0.28
597 0.34
598 0.34
599 0.34
600 0.34
601 0.35
602 0.3
603 0.27
604 0.28
605 0.23
606 0.22
607 0.21
608 0.2
609 0.2
610 0.22
611 0.25
612 0.23
613 0.22
614 0.25
615 0.27
616 0.29
617 0.33
618 0.4
619 0.47
620 0.57
621 0.67
622 0.72
623 0.75
624 0.77
625 0.77
626 0.77
627 0.73
628 0.68
629 0.62
630 0.61
631 0.55
632 0.52
633 0.47
634 0.42
635 0.41
636 0.42
637 0.45
638 0.4
639 0.39
640 0.42
641 0.46
642 0.5
643 0.48
644 0.46
645 0.47
646 0.49
647 0.53
648 0.52
649 0.49
650 0.45
651 0.42
652 0.41
653 0.37
654 0.38
655 0.35
656 0.32
657 0.3
658 0.27
659 0.3
660 0.28
661 0.26
662 0.19
663 0.17
664 0.16
665 0.17
666 0.17
667 0.14
668 0.12
669 0.11
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.11
674 0.1
675 0.12
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.07
683 0.11
684 0.11
685 0.11
686 0.13
687 0.14
688 0.15
689 0.17
690 0.19
691 0.18
692 0.24
693 0.32
694 0.31
695 0.32
696 0.32
697 0.32
698 0.36
699 0.35
700 0.3
701 0.23
702 0.23
703 0.21
704 0.2
705 0.21
706 0.15
707 0.14
708 0.14
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.15
713 0.16
714 0.16
715 0.17
716 0.18
717 0.2
718 0.23
719 0.24
720 0.23
721 0.21
722 0.24
723 0.23
724 0.23
725 0.21
726 0.2
727 0.28
728 0.31
729 0.34
730 0.32
731 0.31
732 0.34
733 0.35
734 0.35
735 0.29
736 0.3
737 0.32
738 0.38
739 0.42
740 0.41
741 0.43
742 0.44
743 0.43
744 0.46
745 0.46
746 0.48
747 0.48
748 0.46
749 0.42
750 0.42
751 0.45
752 0.42
753 0.43
754 0.36
755 0.36
756 0.35
757 0.4
758 0.4
759 0.39
760 0.33
761 0.31
762 0.28
763 0.27
764 0.26
765 0.19
766 0.18
767 0.14
768 0.16
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.1
773 0.1
774 0.1
775 0.11
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.12
781 0.14
782 0.15
783 0.14
784 0.14
785 0.17
786 0.18
787 0.19
788 0.21
789 0.2
790 0.22
791 0.28
792 0.3
793 0.35
794 0.37
795 0.38
796 0.41
797 0.41
798 0.41
799 0.42
800 0.43
801 0.42
802 0.46