Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A015JXS6

Protein Details
Accession A0A015JXS6    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-50NREREYREDNRYYRRRRSRSRSRSVDRYRAVBasic
85-106DREENSKRRKTRHERERAPEGRBasic
212-232FLNYKKRESCHQCHHSKKGVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-38RRRSR
91-108KRRKTRHERERAPEGRWR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001876  Znf_RanBP2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
PS50199  ZF_RANBP2_2  
Amino Acid Sequences MSDFRYSRNQTYRPDYGRDNREREYREDNRYYRRRRSRSRSRSVDRYRAVGGINRQEDWREDFLQRGRPDDIGARSWGNKFHYDDREENSKRRKTRHERERAPEGRWRERNLGEPNNHVILQGLPLAATENDIQQTLDNLHASIENIRLIRDRRTGDSRRFAFVKFTSVEHARQFVEANHPFIMMEDIRVRVEYSNSASAEDEGWACKNCGFLNYKKRESCHQCHHSKKGVIRLWRIPQSPFGHQVVLFKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.64
3 0.64
4 0.69
5 0.7
6 0.68
7 0.64
8 0.68
9 0.67
10 0.64
11 0.64
12 0.62
13 0.62
14 0.65
15 0.66
16 0.68
17 0.74
18 0.77
19 0.78
20 0.82
21 0.83
22 0.84
23 0.89
24 0.9
25 0.9
26 0.93
27 0.92
28 0.9
29 0.91
30 0.89
31 0.89
32 0.8
33 0.72
34 0.63
35 0.54
36 0.47
37 0.4
38 0.37
39 0.35
40 0.35
41 0.32
42 0.31
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.3
47 0.24
48 0.23
49 0.27
50 0.3
51 0.37
52 0.36
53 0.34
54 0.31
55 0.28
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.22
60 0.23
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.25
65 0.23
66 0.24
67 0.26
68 0.31
69 0.35
70 0.38
71 0.4
72 0.4
73 0.48
74 0.47
75 0.5
76 0.52
77 0.54
78 0.54
79 0.58
80 0.64
81 0.65
82 0.73
83 0.77
84 0.79
85 0.8
86 0.82
87 0.86
88 0.79
89 0.71
90 0.66
91 0.62
92 0.6
93 0.56
94 0.53
95 0.47
96 0.45
97 0.49
98 0.51
99 0.5
100 0.42
101 0.41
102 0.39
103 0.36
104 0.34
105 0.26
106 0.2
107 0.13
108 0.12
109 0.09
110 0.07
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.12
136 0.14
137 0.17
138 0.22
139 0.23
140 0.26
141 0.34
142 0.4
143 0.44
144 0.52
145 0.49
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.4
150 0.34
151 0.32
152 0.24
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.27
157 0.23
158 0.25
159 0.21
160 0.2
161 0.2
162 0.17
163 0.23
164 0.22
165 0.24
166 0.22
167 0.21
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.12
179 0.14
180 0.14
181 0.16
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.13
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.13
197 0.18
198 0.22
199 0.28
200 0.38
201 0.47
202 0.54
203 0.57
204 0.59
205 0.65
206 0.69
207 0.7
208 0.7
209 0.71
210 0.73
211 0.78
212 0.83
213 0.82
214 0.79
215 0.76
216 0.75
217 0.72
218 0.7
219 0.69
220 0.69
221 0.69
222 0.7
223 0.67
224 0.59
225 0.61
226 0.59
227 0.57
228 0.54
229 0.47
230 0.42
231 0.4